Biomarkøranalyse for patienter med metastatisk kolorektal cancer (MCC)

Dette er en kortsigtet, prospektiv gennemførlighedsundersøgelse for at bestemme, hvor effektivt efterforskere kan opnå biomarkøranalyse på patienter med mCRC, fra hvem informeret samtykke og autorisation vil blive opnået. Undersøgelsen vil blive udført i samarbejde med Quintiles. Efterforskere vil indsamle data om antallet af klinisk handlingsdygtige biomarkører, der kan påvises i hver population, og antallet af forsøgshandlingsaktive markører, der kan påvises i disse populationer. Patienter med tilbagevendende metastatisk sygdom (dvs. første diagnose af metastatisk sygdom efter resektion, sidste stråling eller sidste kemoterapi i adjuverende omgivelser) vil få deres primære prøve sendt til en biomarkøranalyse. Handlingsmarkører eller genomiske ændringer vil være FDA-godkendte ledsagende diagnostiske markører og markører, der bruges til forsøgsregistrering i metastatisk kolorektal cancer. Yderligere oplysninger om FDA-godkendte ledsagende diagnostiske markører og markører, der bruges til forsøgstilmelding til andre indikationer end mCRC, vil også blive indsamlet og rapporteret.

Bioprøver fra 25 patienter, der har haft tidligt recidiv (≤ 12 måneder) og 25 patienter, der har haft sent recidiv (> 12 måneder) af deres metastaserende kolorektal cancer, vil blive opsamlet, behandlet, forsendet og testet korrekt. Hyppigheden og stederne for mutation kan være hypotesegenererende for at hjælpe med at identificere de patienter med højere risiko for tidligt tilbagefald og hjælpe med at identificere fremtidige behandlingsmuligheder og til at vælge bedre behandlingsmuligheder for denne dårlige prognostiske gruppe.

REGISTRERINGSPROCEDURER Skriftlig dokumentation for fuld, ikke-kontingent IRB-godkendelse skal foreligge, før en patient kan registreres. Registreringsprocessen begynder, når koordinatoren har indhentet et underskrevet informeret samtykke. Patientdemografi vil være i Clinical Trial Management System (CTMS); dette er det webbaserede intranetsystem til levering af prøveinformation på tværs af USOR. Et unikt patientnummer (UPN) vil blive tildelt patienten på det tidspunkt. Indtastning af en patient i CTMS betyder ikke, at patienten er blevet registreret i undersøgelsen.

Når patienten har et UPN-nummer, kan koordinatoren gå til Patientrapporten og vælge den patient, der skal registreres. Placeret til venstre for patientens UPN vil bogstaverne "Reg" være blåt. Koordinatoren vil klikke på den blå "Reg" for at åbne patientens oplysninger. Hver side, der skal udfyldes, vil være i gult. Webstedet vil besvare spørgsmålene på siderne Inklusioner, Ekskluderinger og Prestudy Assessment. Når alle spørgsmål på hver side er besvaret, bliver siden grøn. Et ID-nummer og studiearm vil blive direkte tildelt.

EKSEMPELPROCEDURER FOR UDTAGNING USOR-undersøgelsessteder vil blive forsynet med tumorindsamlingssæt gennem US Oncology Investigational Product Center (IPC).

Bioprøver vil have en afsendelsesdato inden for 4 uger efter, at patienten har underskrevet samtykket for at blive tilmeldt undersøgelsen. Væv vil blive sendt til et centralt laboratorium. Nærmere oplysninger om forsendelse vil blive angivet i Clinical Trials Information (CTI), som leveres separat af USOR.

Referencelaboratoriemanual til vævsforberedelse og forsendelsesinstruktioner.

PRØVEANALYSE OG FORTROLIGHED Det er USOR og Quintiles hensigt, at patienthemmeligheden opretholdes under hele proceduren. USOR opretholder strenge standarder for fortrolighed for kliniske undersøgelser ved at kode prøver med patientinitialer og en unik identifikator (UPN-nummer/patient-/undersøgelses-id-nummer) og undersøgelsesnummer. En patient er til screening ved underskrivelse af ICF og registreret i CTMS. En patient vil blive betragtet som indskrevet i undersøgelsen, hvis der er en standardbehandlingsbioprøve tilgængelig til biomarkørtestning med en forsendelsesdato inden for 4 uger efter ICF-signatur. Hvis en standardbehandlingsbioprøve af en eller anden grund ikke er tilgængelig inden for 4 uger, anses patienten for at være en skærmfejl.

VURDERING AF BIOSPRØVNING Høj gennemløbssekventering ved hjælp af Life Technologies Ion Torrent-platformen eller lignende alternativer vil blive brugt. Denne metode giver dyb sekventeringsdækning af høj kvalitet, der er ideel til SNP-detektion og mutationsanalyse. Punktmutationsidentifikationsanalyse vil omfatte målrettet hel exome-sekventering af tumorvæv, der vil dække flere hundrede humane proteinkodende exoner. Resultater fra profileringen vil blive sammensat og arrangeret efter relevans for klinisk praksis. Alle klinisk brugbare resultater vil blive leveret tilbage til lægen ved hjælp af de samme identifikatorer, der er nævnt ovenfor.

FEJL PÅ PRØVE-TEST Prøver indsendt til analyse vil være fra arkiveret FFPE-væv. Muligheden for at udføre AmpliSeq-testningen kan være begrænset baseret på kvaliteten og kvantiteten af ​​den tilgængelige prøve. Årsager til testfejl kan skyldes manglende evne til at udtrække tilstrækkelig kvalitet og mængde af DNA, manglende evne til at skabe et sekventeringsbibliotek eller manglende evne til at sekvensere en prøve. Hvis der opstår en testfejl, vil årsagen til testfejlen blive registreret af laboratoriet og rapporteret tilbage til klinikeren. En patient vil have mulighed for, i diskussion med deres undersøgelseslæge, afhængig af plads i undersøgelsen og godkendelse fra den amerikanske onkologiske kliniske projektleder, at få lov til at genindsende en ekstra prøve til sekventering. Hvis en prøve fra en patient er en testfejl efter 2 testforsøg, betragtes patienten som en permanent testfejl og vil ikke blive tilbudt mulighed for at indsende yderligere prøver.