Biomarkeranalyse voor patiënten met gemetastaseerde colorectale kanker (MCC)

Dit is een prospectieve haalbaarheidsstudie op korte termijn om te bepalen hoe effectief onderzoekers biomarkeranalyse kunnen verkrijgen van patiënten met mCRC van wie geïnformeerde toestemming en autorisatie zal worden verkregen. De studie zal worden uitgevoerd in samenwerking met Quintiles. Onderzoekers zullen gegevens verzamelen over het aantal klinisch uitvoerbare biomarkers dat in elke populatie kan worden gedetecteerd en het aantal test-bruikbare markers dat in deze populaties kan worden gedetecteerd. Patiënten met recidiverende gemetastaseerde ziekte (dwz de eerste diagnose van gemetastaseerde ziekte na resectie, laatste bestraling of laatste chemotherapie in de adjuvante setting) zullen hun primaire monster laten opsturen voor een biomarkeranalyse. Bruikbare markers of genomische veranderingen zullen door de FDA goedgekeurde begeleidende diagnostische markers zijn en markers die worden gebruikt voor proefinschrijving bij gemetastaseerde colorectale kanker. Er zal ook aanvullende informatie worden verzameld en gerapporteerd over door de FDA goedgekeurde begeleidende diagnostische markers en markers die worden gebruikt voor proefinschrijving bij andere indicaties dan mCRC.

Biospecimens van 25 patiënten met een vroeg recidief (≤ 12 maanden) en 25 patiënten met een laat recidief (> 12 maanden) van hun gemetastaseerde colorectale kanker zullen op de juiste manier worden verzameld, verwerkt, verzonden en getest. De frequentie en locaties van mutatie kunnen hypothesen genereren om te helpen bij het identificeren van die patiënten met een hoger risico op vroege recidief en om te helpen bij het identificeren van toekomstige behandelingsopties en bij het selecteren van betere behandelingsopties voor deze groep met een slechte prognose.

REGISTRATIEPROCEDURES Er moet schriftelijke documentatie van volledige, niet-voorwaardelijke IRB-goedkeuring aanwezig zijn voordat een patiënt kan worden geregistreerd. Het registratieproces begint wanneer de coördinator een ondertekende geïnformeerde toestemming heeft verkregen. Demografische patiëntgegevens worden opgenomen in het Clinical Trial Management System (CTMS); dit is het webgebaseerde intranetsysteem voor de levering van proefinformatie over USOR. Op dat moment wordt aan de patiënt een uniek patiëntnummer (UPN) toegekend. Het invoeren van een patiënt in CTMS betekent niet dat de patiënt in het onderzoek is geregistreerd.

Zodra de patiënt een UPN-nummer heeft, kan de coördinator naar het patiëntrapport gaan en de te registreren patiënt selecteren. Aan de linkerkant van de UPN van de patiënt staan ​​de letters "Reg" in blauw. De coördinator klikt op de blauwe "Reg" om de informatie van die patiënt te openen. Elke pagina die moet worden ingevuld, is geel. De site beantwoordt de vragen op de pagina's Inclusies, Uitsluitingen en Prestudy Assessment. Zodra alle vragen op elke pagina zijn beantwoord, wordt die pagina groen. Een ID-nummer en studiearm worden direct toegewezen.

PROCEDURES VOOR HET VERKRIJGEN VAN MONSTERS USOR-onderzoekslocaties zullen worden voorzien van tumorverzamelingskits via het US Oncology Investigational Product Center (IPC).

Biospecimens krijgen een verzendingsdatum binnen 4 weken nadat de patiënt de toestemming heeft ondertekend om aan het onderzoek deel te nemen. Weefsel wordt naar een centraal laboratorium gestuurd. Details voor verzending zullen worden verstrekt in de Clinical Trials Information (CTI) die afzonderlijk door USOR wordt verstrekt.

Referentielaboratoriumhandleiding voor instructies voor weefselvoorbereiding en verzending.

MONSTERANALYSE EN VERTROUWELIJKHEID Het is de bedoeling van USOR en Quintiles dat de vertrouwelijkheid van de patiënt gedurende de gehele procedure wordt gehandhaafd. USOR handhaaft strikte vertrouwelijkheidsnormen voor klinische onderzoeken door monsters te coderen met patiëntinitialen en een unieke identificatie (UPN-nummer/patiënt-/onderzoeks-ID-nummer) en onderzoeksnummer. Een patiënt is bij ondertekening van de ICF in screening en geregistreerd in CTMS. Een patiënt wordt geacht deel te nemen aan het onderzoek als er een standaard biospecimen beschikbaar is voor het testen van biomarkers met een verzenddatum binnen 4 weken na ICF-ondertekening. Als een biospecimen volgens de standaardzorg om welke reden dan ook niet beschikbaar is, wordt de patiënt binnen 4 weken beschouwd als een schermfout.

BIOSPECIMEN-BEOORDELING Er wordt high-throughput-sequencing gebruikt met behulp van het Life Technologies Ion Torrent-platform of een vergelijkbaar alternatief. Deze methodologie biedt hoogwaardige dekking voor diepe sequencing, bij uitstek geschikt voor SNP-detectie en mutatieanalyse. Analyse van puntmutatie-identificatie omvat gerichte sequentiebepaling van het hele exoom van tumorweefsel dat honderden menselijke eiwitcoderende exons zal omvatten. Resultaten van de profilering zullen worden verzameld en gerangschikt volgens relevantie voor de klinische praktijk. Alle klinisch bruikbare resultaten zullen aan de arts worden teruggegeven met dezelfde identificatoren waarnaar hierboven wordt verwezen.

FOUTEN VAN HET TESTEN VAN MONSTERS Monsters die voor analyse worden ingediend, zijn afkomstig van gearchiveerd FFPE-weefsel. De mogelijkheid om de AmpliSeq-test uit te voeren kan beperkt zijn op basis van de kwaliteit en kwantiteit van het beschikbare monster. Redenen voor mislukte tests kunnen te wijten zijn aan het onvermogen om voldoende kwalitatief en kwantitatief DNA te extraheren, het onvermogen om een ​​sequentiebibliotheek aan te maken of het onvermogen om een ​​monster te sequensen. Mocht er een testfout optreden, dan wordt de reden voor de testfout geregistreerd door het laboratorium en gerapporteerd aan de clinicus. Een patiënt krijgt de kans om, in overleg met zijn onderzoeksarts, afhankelijk van de beschikbare ruimte in het onderzoek en de goedkeuring van de klinische projectmanager oncologie in de VS, één extra monster opnieuw in te dienen voor sequentiëring. Als een monster van een patiënt na 2 testpogingen een testfout is, wordt de patiënt beschouwd als een permanente testfout en krijgt hij niet de kans om extra monsters in te dienen.