Анализ биомаркеров для пациентов с метастатическим колоректальным раком (MCC)

Это краткосрочное проспективное технико-экономическое обоснование для определения того, насколько эффективно исследователи могут получить анализ биомаркеров у пациентов с мКРР, от которых будет получено информированное согласие и разрешение. Исследование будет проводиться в партнерстве с Quintiles. Исследователи будут собирать данные о количестве клинически активных биомаркеров, которые могут быть обнаружены в каждой популяции, и о количестве пробных активных маркеров, которые могут быть обнаружены в этих популяциях. Пациентам с рецидивирующим метастатическим заболеванием (то есть с первым диагнозом метастатического заболевания после резекции, последней лучевой терапии или последней химиотерапии в условиях адъювантной терапии) первичный образец будет отправлен на анализ биомаркеров. Действующие маркеры или геномные изменения будут одобрены FDA как сопутствующие диагностические маркеры и маркеры, используемые для включения в исследование метастатического колоректального рака. Также будет собираться и сообщаться дополнительная информация об утвержденных FDA сопутствующих диагностических маркерах и маркерах, используемых для включения в исследование по показаниям, отличным от мКРР.

Биообразцы от 25 пациентов с ранним рецидивом (≤ 12 месяцев) и 25 пациентов с поздним рецидивом (> 12 месяцев) метастатического колоректального рака будут надлежащим образом собраны, обработаны, отправлены и протестированы. Частота и места мутации могут быть источником гипотез, помогающих выявить пациентов с повышенным риском раннего рецидива и помочь в определении будущих вариантов лечения и в выборе лучших вариантов лечения для этой группы с плохим прогнозом.

ПРОЦЕДУРЫ РЕГИСТРАЦИИ Письменная документация о полном, безусловном одобрении IRB должна быть в файле до того, как пациент может быть зарегистрирован. Процесс регистрации начинается, когда координатор получает подписанное информированное согласие. Демографические данные пациентов будут включены в Систему управления клиническими испытаниями (CTMS); это интранет-система на основе Интернета для доставки информации об испытаниях через USOR. В это время пациенту будет присвоен уникальный номер пациента (UPN). Внесение пациента в CTMS не означает, что пациент зарегистрирован в исследовании.

Когда у пациента есть номер UPN, координатор может перейти к отчету о пациенте и выбрать пациента для регистрации. Слева от UPN пациента будут буквы «Reg» синего цвета. Координатор нажмет на синюю кнопку «Регистрация», чтобы открыть информацию об этом пациенте. Каждая страница, которую необходимо заполнить, будет выделена желтым цветом. Сайт ответит на вопросы на страницах «Включения», «Исключения» и «Оценка перед исследованием». Как только все вопросы на каждой странице будут даны ответы, эта страница станет зеленой. Идентификационный номер и исследовательская группа будут назначены напрямую.

ПРОЦЕДУРЫ ЗАКУПКИ ОБРАЗЦОВ Исследовательские центры USOR будут снабжены наборами для сбора опухолей через Центр исследований онкологических продуктов США (IPC).

Биообразцы будут иметь дату отправки в течение 4 недель после того, как пациент подпишет согласие на включение в исследование. Ткань будет отправлена ​​в центральную лабораторию. Подробная информация о доставке будет указана в Информации о клинических испытаниях (CTI), предоставленной USOR отдельно.

Справочное лабораторное руководство по подготовке тканей и инструкции по транспортировке.

АНАЛИЗ ПРОБ И КОНФИДЕНЦИАЛЬНОСТЬ USOR и Quintiles намерены обеспечить конфиденциальность пациента на протяжении всей процедуры. USOR поддерживает строгие стандарты конфиденциальности для клинических исследований, кодируя образцы инициалами пациента и уникальным идентификатором (номер UPN/идентификационный номер пациента/исследования) и номером исследования. Пациент находится на скрининге после подписания МКФ и регистрации в CTMS. Пациент будет считаться включенным в исследование, если будет доступен биообразец стандарта медицинской помощи для тестирования биомаркеров с датой отправки в течение 4 недель после подписания ICF. Если по какой-либо причине биообразец стандарта медицинской помощи недоступен в течение 4 недель, пациент считается не прошедшим скрининг.

ОЦЕНКА БИООБРАЗЦОВ Будет использоваться высокопроизводительное секвенирование с использованием платформы Life Technologies Ion Torrent или аналогичной альтернативы. Эта методология обеспечивает высококачественное покрытие глубоким секвенированием, идеально подходящее для обнаружения SNP и анализа мутаций. Анализ идентификации точечных мутаций будет включать целевое секвенирование всего экзома опухолевой ткани, которое будет охватывать несколько сотен экзонов, кодирующих белок человека. Результаты профилирования будут скомпилированы и упорядочены в соответствии с их актуальностью для клинической практики. Все клинически обоснованные результаты будут возвращены врачу с использованием тех же идентификаторов, которые указаны выше.

НЕУДАЧИ ПРИ ТЕСТИРОВАНИИ ОБРАЗЦОВ Образцы, отправленные на анализ, будут взяты из архивной ткани FFPE. Возможность проведения тестирования AmpliSeq может быть ограничена в зависимости от качества и количества доступного образца. Причины неудачных испытаний могут быть связаны с невозможностью выделения достаточного количества и качества ДНК, невозможностью создать библиотеку секвенирования или невозможностью секвенирования образца. В случае неудачи тестирования причина неудачи тестирования будет зарегистрирована лабораторией и сообщена лечащему врачу. Пациент будет иметь возможность, после обсуждения со своим врачом-исследователем, в зависимости от места в исследовании и одобрения со стороны руководителя клинического проекта по онкологии в США, повторно представить один дополнительный образец для секвенирования. Если образец от пациента не прошел тестирование после 2 попыток тестирования, пациент считается навсегда не прошедшим тестирование, и ему не будет предложено представить какие-либо дополнительные образцы.