Biomarköranalys för patienter med metastatisk kolorektal cancer (MCC)

Detta är en kortsiktig, prospektiv genomförbarhetsstudie för att avgöra hur effektivt utredare kan få biomarköranalys på patienter med mCRC från vilka informerat samtycke och tillstånd kommer att erhållas. Studien kommer att göras i samarbete med Quintiles. Utredarna kommer att samla in data om antalet kliniskt verksamma biomarkörer som kan detekteras i varje population och antalet verkningsbara testmarkörer som kan detekteras i dessa populationer. Patienter med återkommande metastaserande sjukdom (dvs första diagnos av metastaserande sjukdom efter resektion, sista strålning eller sista kemoterapi i adjuvant miljö) kommer att få sitt primära prov skickat för en biomarköranalys. Handlingsbara markörer eller genomiska förändringar kommer att vara FDA-godkända följeslagningsdiagnostiska markörer och markörer som används för försöksregistrering i metastaserad kolorektal cancer. Ytterligare information om FDA-godkända diagnostiska markörer och markörer som används för försöksregistrering vid andra indikationer än mCRC kommer också att samlas in och rapporteras.

Bioprover från 25 patienter som har haft tidigt återfall (≤ 12 månader) och 25 patienter som har haft sent återfall (> 12 månader) av sin metastaserande kolorektalcancer kommer att samlas in, bearbetas, skickas och testas på lämpligt sätt. Frekvensen och ställena för mutationer kan vara hypotesgenererande för att hjälpa till att identifiera de patienter med högre risk för tidigt återfall och hjälpa till att identifiera framtida behandlingsalternativ och välja bättre behandlingsalternativ för denna dåliga prognostiska grupp.

REGISTRERINGSFÖRFARANDEN Skriftlig dokumentation av fullständigt, icke-kontingent IRB-godkännande måste finnas i filen innan en patient kan registreras. Registreringsprocessen börjar när samordnaren har fått ett undertecknat informerat samtycke. Patientdemografi kommer att ingå i Clinical Trial Management System (CTMS); detta är det webbaserade intranätet för leverans av testinformation över USOR. Ett unikt patientnummer (UPN) kommer att tilldelas patienten vid den tidpunkten. Att skriva in en patient i CTMS betyder inte att patienten har registrerats i studien.

När patienten har ett UPN-nummer kan koordinatorn gå till patientrapporten och välja den patient som ska registreras. Till vänster om patientens UPN finns bokstäverna "Reg" i blått. Koordinatorn klickar på den blå "Reg" för att öppna patientens information. Varje sida som behöver fyllas i kommer att vara i gult. Webbplatsen kommer att svara på frågorna på sidorna Inkludering, Uteslutning och Förstudiebedömning. När alla frågor på varje sida har besvarats blir den sidan grön. Ett ID-nummer och studiearm kommer att tilldelas direkt.

PROVUPPHANDLINGSPROCEDURER USOR-studieplatser kommer att förses med tumöruppsamlingskit genom US Oncology Investigational Product Center (IPC).

Bioprover kommer att ha ett leveransdatum inom 4 veckor från det att patienten undertecknat samtycket för att kunna registreras i studien. Vävnad kommer att skickas till ett centralt laboratorium. Detaljer för leverans kommer att tillhandahållas i Clinical Trials Information (CTI) som tillhandahålls separat av USOR.

Referenslaboratoriemanual för instruktioner för vävnadsberedning och leverans.

PROVANALYS OCH KONFIDENTIALITET Det är USORs och Quintiles avsikt att patientens konfidentialitet ska upprätthållas under hela proceduren. USOR upprätthåller rigorösa standarder för konfidentialitet för kliniska studier genom att koda prover med patientinitialer och en unik identifierare (UPN-nummer/patient-/studie-ID-nummer) och studienummer. En patient är i screening efter att ha undertecknat ICF och registrerad i CTMS. En patient kommer att anses vara inskriven i studien om ett standardiserat bioprov är tillgängligt för biomarkörtestning med ett leveransdatum inom 4 veckor efter ICF-signaturen. Om ett standardiserat bioprov av någon anledning inte är tillgängligt inom 4 veckor anses patienten vara ett skärmfel.

BEDÖMNING AV BIOSPERV Högkapacitetssekvensering med Life Technologies Ion Torrent-plattform eller liknande alternativ kommer att användas. Denna metod ger högkvalitativ djupsekvenseringstäckning idealisk för SNP-detektion och mutationsanalys. Punktmutationsidentifieringsanalys kommer att inkludera riktad hel exomsekvensering av tumörvävnad som kommer att täcka flera hundra humana proteinkodande exoner. Resultat från profileringen kommer att sammanställas och ordnas efter relevans för klinisk praxis. Alla kliniskt genomförbara resultat kommer att skickas tillbaka till läkaren med samma identifierare som hänvisas till ovan.

PROVTESTNINGSFEL. Prover som skickas in för analys kommer att vara från arkiverad FFPE-vävnad. Möjligheten att utföra AmpliSeq-testningen kan vara begränsad baserat på kvaliteten och kvantiteten på det tillgängliga provet. Orsaker till testmisslyckanden kan bero på oförmåga att extrahera tillräcklig kvalitet och kvantitet av DNA, oförmåga att skapa ett sekvenseringsbibliotek eller oförmåga för ett prov att sekvensera. Om ett testfel inträffar kommer orsaken till testfelet att registreras av laboratoriet och rapporteras tillbaka till läkaren. En patient kommer att ha möjlighet att, i diskussion med sin studieläkare, beroende på utrymme i studien och godkännande från US Oncology Clinical Project Manager, få lämna in ytterligare ett prov för sekvensering. Om ett prov från en patient är ett testmisslyckande efter 2 testförsök, anses patienten vara ett permanent testmisslyckande och kommer inte att erbjudas en möjlighet att lämna in några ytterligare prover.