Biomarkøranalyse for pasienter med metastatisk tykktarmskreft (MCC)

Dette er en kortsiktig, prospektiv mulighetsstudie for å bestemme hvor effektivt etterforskere kan få biomarkøranalyse på pasienter med mCRC som informert samtykke og autorisasjon vil bli innhentet fra. Studien vil bli gjort i samarbeid med Quintiles. Etterforskere vil samle inn data om antall klinisk handlingsdyktige biomarkører som kan påvises i hver populasjon og antall handlingsaktive markører som kan påvises i disse populasjonene. Pasienter med tilbakevendende metastatisk sykdom (dvs. første diagnose av metastatisk sykdom etter reseksjon, siste stråling eller siste kjemoterapi i adjuvant setting) vil få sin primærprøve sendt til en biomarkøranalyse. Handlingsbare markører eller genomiske endringer vil være FDA-godkjente ledsagende diagnostiske markører og markører som brukes for prøveregistrering i metastatisk kolorektal kreft. Ytterligere informasjon om FDA-godkjente ledsagende diagnostiske markører og markører som brukes for prøveregistrering i andre indikasjoner enn mCRC vil også bli samlet inn og rapportert.

Bioprøver fra 25 pasienter som har hatt tidlig residiv (≤ 12 måneder) og 25 pasienter som har hatt sent residiv (> 12 måneder) av deres metastatiske tykktarmskreft vil bli samlet inn, behandlet, sendt og testet på riktig måte. Frekvensen og stedene for mutasjoner kan være hypotesegenererende for å hjelpe til med å identifisere de pasientene med høyere risiko for tidlig tilbakefall og hjelpe til med å identifisere fremtidige behandlingsalternativer og velge bedre behandlingsalternativer for denne dårlige prognostiske gruppen.

REGISTRERINGSPROSEDYRER Skriftlig dokumentasjon på full, ikke-kontingent IRB-godkjenning må foreligge før en pasient kan registreres. Registreringsprosessen starter når koordinator har innhentet et signert informert samtykke. Pasientdemografi vil være i Clinical Trial Management System (CTMS); dette er det nettbaserte intranettsystemet for levering av prøveinformasjon på tvers av USOR. Et unikt pasientnummer (UPN) vil bli tildelt pasienten på det tidspunktet. Å legge inn en pasient i CTMS betyr ikke at pasienten er registrert i studien.

Når pasienten har et UPN-nummer, kan koordinatoren gå til Pasientrapporten og velge pasienten som skal registreres. Plassert til venstre for pasientens UPN vil det være bokstavene "Reg" i blått. Koordinatoren vil klikke på den blå "Reg" for å åpne pasientens informasjon. Hver side som må fylles ut vil være i gult. Nettstedet vil svare på spørsmålene på sidene Inkludering, Ekskludering og Forstudievurdering. Når alle spørsmålene på hver side er besvart, blir siden grønn. ID-nummer og studiearm vil bli direkte tildelt.

PRØVEPROSEDYRER FOR INNkjøp USOR-studiesteder vil bli levert med tumorsamlingssett gjennom US Oncology Investigational Product Center (IPC).

Bioprøver vil ha en forsendelsesdato innen 4 uker etter at pasienten har signert samtykket for å bli registrert i studien. Vev vil bli sendt til sentrallaboratorium. Detaljer for frakt vil bli gitt i Clinical Trials Information (CTI) gitt separat av USOR.

Referanselaboratoriehåndbok for vevsforberedelse og forsendelsesinstruksjoner.

PRØVEANALYSE OG KONFIDENSIALITET Det er USOR og Quintiles intensjon at pasientens konfidensialitet skal opprettholdes gjennom hele prosedyren. USOR opprettholder strenge standarder for konfidensialitet for kliniske studier ved å kode prøver med pasientinitialer og en unik identifikator (UPN-nummer/pasient-/studie-ID-nummer) og studienummer. En pasient er under screening ved signering av ICF og registrert i CTMS. En pasient vil bli betraktet som registrert i studien hvis en standardbehandlingsbioprøve er tilgjengelig for biomarkørtesting med en forsendelsesdato innen 4 uker etter ICF-signatur. Hvis en standardbehandlingsbioprøve er utilgjengelig, av en eller annen grunn, innen 4 uker anses pasienten som en skjermfeil.

VURDERING AV BIOSPRØVNING Høy gjennomstrømningssekvens ved bruk av Life Technologies Ion Torrent-plattformen eller lignende alternativer vil bli brukt. Denne metodikken gir høykvalitets dypsekvenseringsdekning som er ideell for SNP-deteksjon og mutasjonsanalyse. Punktmutasjonsidentifikasjonsanalyse vil inkludere målrettet hele eksomsekvensering av tumorvev som vil dekke flere hundre humane proteinkodende eksoner. Resultater fra profileringen vil bli sammenstilt og ordnet etter relevans for klinisk praksis. Alle kliniske resultater vil bli gitt tilbake til legen ved å bruke de samme identifikatorene som er referert til ovenfor.

FEIL PÅ PRØVETESTER Prøver som sendes inn for analyse vil være fra arkivert FFPE-vev. Muligheten til å utføre AmpliSeq-testingen kan være begrenset basert på kvaliteten og kvantiteten på prøven som er tilgjengelig. Årsaker til testfeil kan skyldes manglende evne til å trekke ut tilstrekkelig kvalitet og mengde DNA, manglende evne til å lage et sekvenseringsbibliotek eller manglende evne til å sekvensere en prøve. Skulle det oppstå en testfeil, vil årsaken til testfeilen bli registrert av laboratoriet og rapportert tilbake til klinikeren. En pasient vil ha mulighet, i diskusjon med sin studielege, avhengig av plass i studien og godkjenning fra US Oncology Clinical Project Manager, få lov til å sende inn en ekstra prøve for sekvensering på nytt. Dersom en prøve fra en pasient er en testfeil etter 2 testforsøk, anses pasienten som en permanent testingssvikt og vil ikke bli tilbudt mulighet til å sende inn ytterligere prøver.