Katetrový biofilmový mikrobiom v infikovaných novorozeneckých katetrech.

Infekce krevního řečiště spojené s katétrem (CLABSI) jsou významnou složkou infekcí spojených se zdravotní péčí (HAI), které jsou spojeny s významnou mortalitou, morbiditou a náklady na zdravotní péči. Novorozenci jsou vystaveni vyššímu riziku CLABSI než děti nebo dospělí a CLABSI jsou častěji pozorovány u novorozenců než na jednotkách intenzivní péče pro děti nebo dospělé. Novorozenci, u kterých se vyvinou CLABSI, jsou nejen vystaveni vážnému riziku úmrtnosti, ale také dlouhodobému neurovývojovému poškození. CLABSI jsou často způsobeny organismy kolonizujícími kůži a nejčastěji izolovanými organismy jsou CONS, S. aureus a Candida.

Katétrový biofilmový mikrobiom, pokud je nám známo, nebyl dosud zkoumán. Hodnocení mikrobiálních signatur biofilmu a zátěže mikrobiální DNA je nová strategie, která může umožnit dřívější diagnostiku CLABSI. Včasnější detekce může umožnit dřívější cílenou terapii, jako jsou antimikrobiální uzávěrové roztoky, a může usnadnit zachování katétrů u této zranitelné populace. Katetrizační mikrobiální DNA signatury nebo zatížení mohou být užitečnými biomarkery nejen k predikci nebo diagnostice infekcí, ale také k monitorování antibiotické terapie a potvrzení vymizení infekce.

Budeme studovat 15 perkutánně zavedených centrálních katétrů (PICC), každý od novorozenců s CLABSI a těch bez. Budeme hodnotit bakteriální mikrobiom profilováním oblasti V3-5 16S rDNA, pomocí PCR a pyrosekvenování. Budeme korelovat mikrobiom biofilmu katétru s kulturami hrotu katétru a kožním mikrobiomem v místě vstupu katétru. Naším cílem je identifikovat mikrobiální signatury, které predisponují k šíření infekce z katétrových biofilmů vedoucích k CLABSI. Dále budeme kvantifikovat zátěž mikrobiální DNA v krvi z katétrů v době odstranění pomocí PCR v reálném čase bakteriální 16S rDNA.