Multiplexní polymerázová řetězová reakce u pooperační pneumonie po hrudní chirurgii (POP-PCR)

Východiska: Pooperační pneumonie (POP) je častou a závažnou komplikací spojenou s vysokou morbiditou a mortalitou bez ohledu na typ operace. V hrudní chirurgii se celosvětový výskyt POP odhaduje na 25 %. Předoperační bronchiální a plicní bakteriální kolonizace se podle literatury jeví jako hlavní rizikový faktor pro výskyt POP.

Diagnóza POP je náročná, protože obvyklá diagnostická kritéria jsou málo relevantní a klinické diagnostické skóre není validováno, což může vysvětlit nedostatek publikovaných údajů v literatuře.

Křehkost pacientů a komorbidní stavy, zejména kvůli kouření, omezují možnost provádět invazivní mikrobiologické diagnostické testy a tito pacienti mají špatný výkon. Celkem je patogen(y) identifikován ve 14 % až 50 %.

V této souvislosti je důležité hodnocení diagnostického přínosu molekulárně diagnostických testů (mPCR). Molekulárně diagnostické testy nabízejí lepší výkon (citlivost a citlivost) než konvenční test a výsledky nejsou ovlivněny předchozí expozicí antibiotikům. Tyto testy by mohly být užitečné k analýze mikrobiologického vztahu mezi předoperační nebo peroperační bronchiální a plicní kolonizací a pooperační infekcí, k optimalizaci diagnostiky a léčby POP po hrudní chirurgii.

Materiály a metody: V této studii si výzkumníci kladou za cíl popsat mikrobiologický vztah mezi existencí předoperační (pokud je k dispozici) a intraoperační bronchiální a plicní bakteriální kolonizace a výskytem POP. Výzkumníci mají také v úmyslu analyzovat přínos mPCR pro diagnostiku POP.

Pro větší přesnost jsou popisy primárních a sekundárních výsledků plně podrobně popsány v odpovídající části.

Řešitelé provádějí monocentrický prospektivní neintervenční výzkum s minimálními riziky a omezeními. Populaci studie představují všichni po sobě jdoucí dospělí pacienti hospitalizovaní pro chirurgickou resekci plic (kromě chirurgické resekce indikované pro infekční onemocnění) během jednoho roku v Tenon Hospital, fakultní nemocnici v Paříži, Francie. Chirurgickou resekci plic podstoupí ročně asi 200 pacientů. V závislosti na incidenci POP se může počet pacientů s podezřením na POP během období studie pohybovat mezi 25 a 50. Délka účasti ve studii odpovídá délce pobytu v nemocnici.

PCR Film Array Pneumonia je molekulární test použitý v této studii. Je určen k detekci nejběžnějších a nejkritičtějších patogenů pneumonie (bakterie, viry). Výsledky jsou uvedeny kvantitativně. Vedení pacientů je v souladu s doporučeními a není modifikováno výzkumem. Očekávaná rizika jsou rizika běžné péče.

Praktický postup studia je definován:

• Předoperační. Shromažďují se klinické charakteristiky pacientů, stav dýchání a údaje o očekávané operaci. Předoperační respirační vzorky (datum a typ, patogen a práh) se zaznamenávají, pokud jsou k dispozici během 3 předchozích měsíců
• Na operaci. K přímému vyšetření a kultivaci (patogen a prahová hodnota) a mPCR (PCR1) se provádí intraoperační bronchiální aspirát. Shromažďují se charakteristiky chirurgického zákroku. Peroperační antibioprofylaxe je v souladu s doporučeními.
• Po operaci. Identifikace pooperačních komplikací (respiračních a extrarespiračních) včetně POP. POP diagnóza je založena na klinických a mikrobiologických datech (Clinical Pulmonary Infection Score). V případě klinického podezření na POP se provádějí vzorky z dýchacích cest k přímému vyšetření a kultivaci (patogen a prahová hodnota) a mPCR (PCR2). Skóre CPIS se vypočítá z výsledků konvenčních mikrobiologických testů (CPIS 1) a výsledků PCR (CPIS2). Zaznamenává se nemocniční zdravotní péče a vitální stav při propuštění.

Míry primárních a sekundárních výsledků jsou podrobně popsány v odpovídající části.

Statistická analýza: Statistická analýza bude provedena na konci studie. Charakteristiky pacientů budou popsány a porovnány mezi dvěma skupinami, tj. pacienty s POP a pacienty bez POP. Kvalitativní proměnné budou popsány velikostí a četností a kvantitativní proměnné průměrem a směrodatnou odchylkou nebo mediánem a mezikvartilovým rozmezím. Srovnání mezi skupinami bude provedeno pomocí Chi2 nebo Fisherova exaktního testu pro kvalitativní proměnné a Studentova t testu nebo Mann-Whitneyho U testu pro kvantitativní proměnné.

Pro primární výsledek bude vypočítán podíl pacientů, u kterých je intraoperační kolonizační kmen a pooperační infekční kmen stejný (s jejich 95% intervalem spolehlivosti).

U sekundárních výsledků bude celková míra shody a kvalitativní a kvantitativní diagnostické nesrovnalosti vypočítány s jejich 95% intervalem spolehlivosti mezi konvenčními a molekulárními testy. Budou odhadnuty podíly pacientů s vhodnou antibiotickou terapií a s cílenou antibiotickou terapií a porovnány mezi konvenčními a molekulárními testy.

Prediktivní faktory pro výskyt POP budou hodnoceny pomocí modelu logistické regrese.