Reakcja łańcuchowa polimerazy multipleksowej w pooperacyjnym zapaleniu płuc po operacji klatki piersiowej (POP-PCR)

Wstęp: Pooperacyjne zapalenie płuc (POP) jest częstym i ciężkim powikłaniem związanym z dużą chorobowością i śmiertelnością, niezależnie od rodzaju operacji. W chirurgii klatki piersiowej globalną częstość występowania POP szacuje się na 25%. Według piśmiennictwa przedoperacyjna kolonizacja bakteryjna oskrzeli i płuc wydaje się być głównym czynnikiem ryzyka wystąpienia POP.

Rozpoznanie POP jest trudne, ponieważ zwykłe kryteria diagnostyczne są mało trafne, a kliniczne wyniki diagnostyczne nie są potwierdzone, co może tłumaczyć niedostatek opublikowanych danych w piśmiennictwie.

Osłabienie pacjentów i choroby współistniejące, głównie spowodowane paleniem tytoniu, ograniczają możliwość wykonania inwazyjnej diagnostyki mikrobiologicznej, a te ostatnie wypadają słabo. W sumie zaangażowany patogen (patogeny) jest identyfikowany w 14% do 50%.

W tym kontekście istotna jest ocena wartości diagnostycznej molekularnych testów diagnostycznych (mPCR). Testy diagnostyki molekularnej oferują lepszą wydajność (czułość i czułość) niż testy konwencjonalne, a na wyniki nie wpływa wcześniejsza ekspozycja na antybiotyki. Testy te mogą być przydatne do analizy mikrobiologicznego związku między przed lub okołooperacyjną kolonizacją oskrzeli i płuc a infekcją pooperacyjną, w celu optymalizacji diagnostyki i leczenia POP po operacjach klatki piersiowej.

Materiał i metody: W niniejszej pracy badacze starali się opisać mikrobiologiczny związek między istnieniem przedoperacyjnej (jeśli jest dostępna) i śródoperacyjnej kolonizacji bakteryjnej oskrzeli i płuc a występowaniem TZO. Badacze zamierzają również przeanalizować udział mPCR w diagnostyce POP.

Aby uzyskać większą precyzję, opisy głównych i drugorzędnych wyników są szczegółowo opisane w odpowiedniej sekcji.

Badacze przeprowadzają monocentryczne, prospektywne, nieinterwencyjne badania z minimalnym ryzykiem i ograniczeniami. Badana populacja jest reprezentowana przez wszystkich kolejnych dorosłych pacjentów hospitalizowanych w celu chirurgicznej resekcji płuc (z wyjątkiem resekcji chirurgicznej wskazanej z powodu choroby zakaźnej) w ciągu jednego roku w szpitalu Tenon, uniwersyteckim szpitalu klinicznym w Paryżu, we Francji. Około 200 pacjentów rocznie poddawanych jest chirurgicznej resekcji płuca. W zależności od częstości występowania TZO liczba pacjentów z podejrzeniem TZO może wahać się od 25 do 50 w okresie objętym badaniem. Czas trwania uczestnictwa w badaniu odpowiada długości pobytu w szpitalu.

Testem molekularnym stosowanym w tym badaniu jest PCR Film Array Pneumonia. Jest przeznaczony do wykrywania najczęstszych i krytycznych patogenów zapalenia płuc (bakterie, wirusy). Wyniki są podawane ilościowo. Postępowanie z pacjentami jest zgodne z zaleceniami i nie jest modyfikowane badaniami. Oczekiwane ryzyko jest związane ze zwykłą opieką.

Praktyczny przebieg studiów określają:

• Przedoperacyjne. Gromadzone są dane dotyczące charakterystyki klinicznej pacjentów, stanu układu oddechowego i spodziewanej operacji. Przedoperacyjne próbki oddechowe (data i typ, patogen i próg) są rejestrowane, jeśli są dostępne w ciągu 3 poprzedzających miesięcy
• Zaoperacyjny. Śródoperacyjnie pobiera się aspirat z oskrzeli do bezpośredniego badania i posiewu (patogen i próg) oraz mPCR (PCR1). Zbierane są cechy operacji. Antybioprofilaktyka okołooperacyjna jest zgodna z zaleceniami.
• Pooperacyjny. Identyfikacja powikłań pooperacyjnych (oddechowych i pozaoddechowych), w tym POP. Rozpoznanie POP opiera się na danych klinicznych i mikrobiologicznych (Clinical Pulmonary Infection Score). W przypadku klinicznego podejrzenia TZO pobiera się wymazy z dróg oddechowych do bezpośredniego badania i posiewu (patogen i próg) oraz mPCR (PCR2). Wynik CPIS jest obliczany na podstawie wyników konwencjonalnych testów mikrobiologicznych (CPIS 1) i wyników PCR (CPIS2). Rejestruje się szpitalną opiekę zdrowotną i stan życiowy przy wypisie.

Podstawowe i drugorzędne miary wyników są szczegółowo opisane w odpowiedniej sekcji.

Analiza statystyczna: Analiza statystyczna zostanie przeprowadzona na koniec badania. Opisana zostanie charakterystyka pacjentów i porównana między dwiema grupami, tj. chorymi na POP i chorymi bez POP. Zmienne jakościowe zostaną opisane za pomocą wielkości i częstości, a zmienne ilościowe za pomocą średniej i odchylenia standardowego lub mediany i rozstępu międzykwartylowego. Porównania międzygrupowe zostaną przeprowadzone przy użyciu testu Chi2 lub dokładnego testu Fishera dla zmiennych jakościowych oraz testu t Studenta lub testu U Manna-Whitneya dla zmiennych ilościowych.

Dla pierwotnego wyniku zostanie obliczony odsetek pacjentów, u których śródoperacyjny szczep kolonizacyjny i pooperacyjny szczep infekcyjny są takie same (z ich 95% przedziałem ufności).

W przypadku drugorzędowych wyników ogólny współczynnik zgodności oraz jakościowe i ilościowe rozbieżności diagnostyczne zostaną obliczone z ich 95% przedziałem ufności między testami konwencjonalnymi i molekularnymi. Oszacowane zostaną odsetki pacjentów z odpowiednią antybiotykoterapią oraz antybiotykoterapią celowaną i porównane między testami konwencjonalnymi i molekularnymi.

Czynniki predykcyjne wystąpienia TZO zostaną ocenione za pomocą modelu regresji logistycznej.