Mikrobiom a rakovina konečníku
31. července 2023 aktualizováno: University of South Florida
Variabilita rektálního mikrobiomu mezi kohortami rektálního karcinomu včetně kompletních klinických respondérů, patologických respondérů a časné recidivy
Účelem naší studie je zjistit, zda existuje souvislost mezi mikrobiomem pacientů s rektálním adenokarcinomem, kteří plně patologicky reagují, a těmi, kteří mají částečnou nebo žádnou odpověď na neoadjuvantní terapii.
Přehled studie
Postavení
Aktivní, ne nábor
Intervence / Léčba
Detailní popis
Tato studie pomůže dále objasnit spojení bakterií s rakovinou konečníku a zároveň charakterizuje geny spojené s tímto rizikem.
Dále se pokusí lépe porozumět tomu, kteří pacienti mohou mít optimální odpověď na neoadjuvantní chemoradiaci, což umožní možné prediktivní vyhodnocení metagenomiky, výzkumníci mohou být schopni rozšířit léčbu a také poskytnout doporučení pro úspěšnost a nákladovou efektivitu onkologické péče.
Typ studie
Intervenční
Zápis (Odhadovaný)
40
Fáze
- Nelze použít
Kontakty a umístění
Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.
Studijní místa
-
-
Florida
-
Tampa, Florida, Spojené státy, 33606
- Tampa General Hospital
-
Tampa, Florida, Spojené státy, 33612
- University of South Florida
-
Tampa, Florida, Spojené státy, 33606
- University of South Florida - South Tampa Campus
-
-
Kritéria účasti
Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
18 let a starší (Dospělý, Starší dospělý)
Přijímá zdravé dobrovolníky
Ne
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Věk ≥ 18 let
- Lokálně pokročilý rektální adenokarcinom (T3)
- Standardní chemoradiace založená na 5FU
- Celková neoadjuvantní terapie podle pokynů protokolu OPRA
Kritéria vyloučení:
- Věk < 18 let
- Rektální adenokarcinom stadia I nebo stadia IV
- Rakovina rekta jiná než adenokarcinom
- Geneticky asociovaná rakovina (HNPCC, FAP atd.) nebo vysoce podezřelá pro geneticky asociovanou rakovinu
- Předchozí anamnéza rektálního adenokarcinomu (tj. recidivující kolorektální adenokarcinom)
Studijní plán
Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Primární účel: Základní věda
- Přidělení: N/A
- Intervenční model: Přiřazení jedné skupiny
- Maskování: Žádné (otevřený štítek)
Zbraně a zásahy
Skupina účastníků / Arm |
Intervence / Léčba |
|---|---|
|
Jiný: Sbírka tkání
|
Flexibilní sigmoidoskopie je postup, při kterém se do řitního otvoru zavede flexibilní tubularizovaná kamera o průměru přibližně 1 cm a posune se proximálně k sigmoideu (přibližně 20 cm).
V té době bude odebrána rektální biopsie nádoru a také vzorek z > 5 cm proximálně od nádoru pomocí samostatné bioptické kleště.
Tetovací injekce, jako standardní péče, bude provedena do 1 cm distálně od nádoru pro identifikaci místa v budoucnu nebo pro chirurgický zákrok.
Pokud není možné dostat se proximálně k nádoru, bude postačovat umístění alespoň 5 cm přilehlé v libovolném směru, pokud se zdá být zcela normální.
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
16s rRNA genové sekvenování pro studium bakteriální fylogeneze a taxonomie
Časové okno: 5 let
|
16s sekvenování rRNA z bioptických vzorků
|
5 let
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
rektální mikrobiota ke studiu bakteriálních kmenů
Časové okno: 5 let
|
rektální mikrobiota - bakteriální kmeny z bioptických vzorků
|
5 let
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.
Sponzor
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: James R Williams, MD, University of South Florida
Publikace a užitečné odkazy
Osoba odpovědná za zadávání informací o studiu tyto publikace poskytuje dobrovolně. Mohou se týkat čehokoli, co souvisí se studiem.
Obecné publikace
- Maas M, Nelemans PJ, Valentini V, Das P, Rodel C, Kuo LJ, Calvo FA, Garcia-Aguilar J, Glynne-Jones R, Haustermans K, Mohiuddin M, Pucciarelli S, Small W Jr, Suarez J, Theodoropoulos G, Biondo S, Beets-Tan RG, Beets GL. Long-term outcome in patients with a pathological complete response after chemoradiation for rectal cancer: a pooled analysis of individual patient data. Lancet Oncol. 2010 Sep;11(9):835-44. doi: 10.1016/S1470-2045(10)70172-8. Epub 2010 Aug 6.
- Garcia-Aguilar J, Chow OS, Smith DD, Marcet JE, Cataldo PA, Varma MG, Kumar AS, Oommen S, Coutsoftides T, Hunt SR, Stamos MJ, Ternent CA, Herzig DO, Fichera A, Polite BN, Dietz DW, Patil S, Avila K; Timing of Rectal Cancer Response to Chemoradiation Consortium. Effect of adding mFOLFOX6 after neoadjuvant chemoradiation in locally advanced rectal cancer: a multicentre, phase 2 trial. Lancet Oncol. 2015 Aug;16(8):957-66. doi: 10.1016/S1470-2045(15)00004-2. Epub 2015 Jul 14.
- Peters BA, Wu J, Pei Z, Yang L, Purdue MP, Freedman ND, Jacobs EJ, Gapstur SM, Hayes RB, Ahn J. Oral Microbiome Composition Reflects Prospective Risk for Esophageal Cancers. Cancer Res. 2017 Dec 1;77(23):6777-6787. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-17-1296.
- Smith JJ, Chow OS, Gollub MJ, Nash GM, Temple LK, Weiser MR, Guillem JG, Paty PB, Avila K, Garcia-Aguilar J; Rectal Cancer Consortium. Organ Preservation in Rectal Adenocarcinoma: a phase II randomized controlled trial evaluating 3-year disease-free survival in patients with locally advanced rectal cancer treated with chemoradiation plus induction or consolidation chemotherapy, and total mesorectal excision or nonoperative management. BMC Cancer. 2015 Oct 23;15:767. doi: 10.1186/s12885-015-1632-z.
- Wirbel J, Pyl PT, Kartal E, Zych K, Kashani A, Milanese A, Fleck JS, Voigt AY, Palleja A, Ponnudurai R, Sunagawa S, Coelho LP, Schrotz-King P, Vogtmann E, Habermann N, Nimeus E, Thomas AM, Manghi P, Gandini S, Serrano D, Mizutani S, Shiroma H, Shiba S, Shibata T, Yachida S, Yamada T, Waldron L, Naccarati A, Segata N, Sinha R, Ulrich CM, Brenner H, Arumugam M, Bork P, Zeller G. Meta-analysis of fecal metagenomes reveals global microbial signatures that are specific for colorectal cancer. Nat Med. 2019 Apr;25(4):679-689. doi: 10.1038/s41591-019-0406-6. Epub 2019 Apr 1.
- NIH HMP Working Group; Peterson J, Garges S, Giovanni M, McInnes P, Wang L, Schloss JA, Bonazzi V, McEwen JE, Wetterstrand KA, Deal C, Baker CC, Di Francesco V, Howcroft TK, Karp RW, Lunsford RD, Wellington CR, Belachew T, Wright M, Giblin C, David H, Mills M, Salomon R, Mullins C, Akolkar B, Begg L, Davis C, Grandison L, Humble M, Khalsa J, Little AR, Peavy H, Pontzer C, Portnoy M, Sayre MH, Starke-Reed P, Zakhari S, Read J, Watson B, Guyer M. The NIH Human Microbiome Project. Genome Res. 2009 Dec;19(12):2317-23. doi: 10.1101/gr.096651.109. Epub 2009 Oct 9.
- Smith JD, Ruby JA, Goodman KA, Saltz LB, Guillem JG, Weiser MR, Temple LK, Nash GM, Paty PB. Nonoperative management of rectal cancer with complete clinical response after neoadjuvant therapy. Ann Surg. 2012 Dec;256(6):965-72. doi: 10.1097/SLA.0b013e3182759f1c.
- Gerassy-Vainberg S, Blatt A, Danin-Poleg Y, Gershovich K, Sabo E, Nevelsky A, Daniel S, Dahan A, Ziv O, Dheer R, Abreu MT, Koren O, Kashi Y, Chowers Y. Radiation induces proinflammatory dysbiosis: transmission of inflammatory susceptibility by host cytokine induction. Gut. 2018 Jan;67(1):97-107. doi: 10.1136/gutjnl-2017-313789. Epub 2017 Apr 24.
- Araujo-Perez F, McCoy AN, Okechukwu C, Carroll IM, Smith KM, Jeremiah K, Sandler RS, Asher GN, Keku TO. Differences in microbial signatures between rectal mucosal biopsies and rectal swabs. Gut Microbes. 2012 Nov-Dec;3(6):530-5. doi: 10.4161/gmic.22157. Epub 2012 Oct 11.
- Sanapareddy N, Legge RM, Jovov B, McCoy A, Burcal L, Araujo-Perez F, Randall TA, Galanko J, Benson A, Sandler RS, Rawls JF, Abdo Z, Fodor AA, Keku TO. Increased rectal microbial richness is associated with the presence of colorectal adenomas in humans. ISME J. 2012 Oct;6(10):1858-68. doi: 10.1038/ismej.2012.43. Epub 2012 May 24.
- Xu K, Jiang B. Analysis of Mucosa-Associated Microbiota in Colorectal Cancer. Med Sci Monit. 2017 Sep 14;23:4422-4430. doi: 10.12659/msm.904220.
- Kwong TNY, Wang X, Nakatsu G, Chow TC, Tipoe T, Dai RZW, Tsoi KKK, Wong MCS, Tse G, Chan MTV, Chan FKL, Ng SC, Wu JCY, Wu WKK, Yu J, Sung JJY, Wong SH. Association Between Bacteremia From Specific Microbes and Subsequent Diagnosis of Colorectal Cancer. Gastroenterology. 2018 Aug;155(2):383-390.e8. doi: 10.1053/j.gastro.2018.04.028. Epub 2018 May 3.
- Kasai C, Sugimoto K, Moritani I, Tanaka J, Oya Y, Inoue H, Tameda M, Shiraki K, Ito M, Takei Y, Takase K. Comparison of human gut microbiota in control subjects and patients with colorectal carcinoma in adenoma: Terminal restriction fragment length polymorphism and next-generation sequencing analyses. Oncol Rep. 2016 Jan;35(1):325-33. doi: 10.3892/or.2015.4398. Epub 2015 Nov 4.
- Yoon H, Kim N, Park JH, Kim YS, Lee J, Kim HW, Choi YJ, Shin CM, Park YS, Lee DH, Jung HC. Comparisons of Gut Microbiota Among Healthy Control, Patients With Conventional Adenoma, Sessile Serrated Adenoma, and Colorectal Cancer. J Cancer Prev. 2017 Jun;22(2):108-114. doi: 10.15430/JCP.2017.22.2.108. Epub 2017 Jun 30.
- Ahn J, Sinha R, Pei Z, Dominianni C, Wu J, Shi J, Goedert JJ, Hayes RB, Yang L. Human gut microbiome and risk for colorectal cancer. J Natl Cancer Inst. 2013 Dec 18;105(24):1907-11. doi: 10.1093/jnci/djt300. Epub 2013 Dec 6.
- Chen W, Liu F, Ling Z, Tong X, Xiang C. Human intestinal lumen and mucosa-associated microbiota in patients with colorectal cancer. PLoS One. 2012;7(6):e39743. doi: 10.1371/journal.pone.0039743. Epub 2012 Jun 28.
- Jones RB, Zhu X, Moan E, Murff HJ, Ness RM, Seidner DL, Sun S, Yu C, Dai Q, Fodor AA, Azcarate-Peril MA, Shrubsole MJ. Inter-niche and inter-individual variation in gut microbial community assessment using stool, rectal swab, and mucosal samples. Sci Rep. 2018 Mar 7;8(1):4139. doi: 10.1038/s41598-018-22408-4.
- Mandal P. Molecular mechanistic pathway of colorectal carcinogenesis associated with intestinal microbiota. Anaerobe. 2018 Feb;49:63-70. doi: 10.1016/j.anaerobe.2017.12.008. Epub 2017 Dec 19.
- Chen GY. The Role of the Gut Microbiome in Colorectal Cancer. Clin Colon Rectal Surg. 2018 May;31(3):192-198. doi: 10.1055/s-0037-1602239. Epub 2018 Apr 1.
- Flemer B, Lynch DB, Brown JM, Jeffery IB, Ryan FJ, Claesson MJ, O'Riordain M, Shanahan F, O'Toole PW. Tumour-associated and non-tumour-associated microbiota in colorectal cancer. Gut. 2017 Apr;66(4):633-643. doi: 10.1136/gutjnl-2015-309595. Epub 2016 Mar 18.
- Mima K, Sukawa Y, Nishihara R, Qian ZR, Yamauchi M, Inamura K, Kim SA, Masuda A, Nowak JA, Nosho K, Kostic AD, Giannakis M, Watanabe H, Bullman S, Milner DA, Harris CC, Giovannucci E, Garraway LA, Freeman GJ, Dranoff G, Chan AT, Garrett WS, Huttenhower C, Fuchs CS, Ogino S. Fusobacterium nucleatum and T Cells in Colorectal Carcinoma. JAMA Oncol. 2015 Aug;1(5):653-61. doi: 10.1001/jamaoncol.2015.1377.
- Mima K, Nishihara R, Qian ZR, Cao Y, Sukawa Y, Nowak JA, Yang J, Dou R, Masugi Y, Song M, Kostic AD, Giannakis M, Bullman S, Milner DA, Baba H, Giovannucci EL, Garraway LA, Freeman GJ, Dranoff G, Garrett WS, Huttenhower C, Meyerson M, Meyerhardt JA, Chan AT, Fuchs CS, Ogino S. Fusobacterium nucleatum in colorectal carcinoma tissue and patient prognosis. Gut. 2016 Dec;65(12):1973-1980. doi: 10.1136/gutjnl-2015-310101. Epub 2015 Aug 26.
- Liu L, Tabung FK, Zhang X, Nowak JA, Qian ZR, Hamada T, Nevo D, Bullman S, Mima K, Kosumi K, da Silva A, Song M, Cao Y, Twombly TS, Shi Y, Liu H, Gu M, Koh H, Li W, Du C, Chen Y, Li C, Li W, Mehta RS, Wu K, Wang M, Kostic AD, Giannakis M, Garrett WS, Hutthenhower C, Chan AT, Fuchs CS, Nishihara R, Ogino S, Giovannucci EL. Diets That Promote Colon Inflammation Associate With Risk of Colorectal Carcinomas That Contain Fusobacterium nucleatum. Clin Gastroenterol Hepatol. 2018 Oct;16(10):1622-1631.e3. doi: 10.1016/j.cgh.2018.04.030. Epub 2018 Apr 24.
- McCoy AN, Araujo-Perez F, Azcarate-Peril A, Yeh JJ, Sandler RS, Keku TO. Fusobacterium is associated with colorectal adenomas. PLoS One. 2013;8(1):e53653. doi: 10.1371/journal.pone.0053653. Epub 2013 Jan 15.
- Flanagan L, Schmid J, Ebert M, Soucek P, Kunicka T, Liska V, Bruha J, Neary P, Dezeeuw N, Tommasino M, Jenab M, Prehn JH, Hughes DJ. Fusobacterium nucleatum associates with stages of colorectal neoplasia development, colorectal cancer and disease outcome. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2014 Aug;33(8):1381-90. doi: 10.1007/s10096-014-2081-3. Epub 2014 Mar 6.
- Mima K, Cao Y, Chan AT, Qian ZR, Nowak JA, Masugi Y, Shi Y, Song M, da Silva A, Gu M, Li W, Hamada T, Kosumi K, Hanyuda A, Liu L, Kostic AD, Giannakis M, Bullman S, Brennan CA, Milner DA, Baba H, Garraway LA, Meyerhardt JA, Garrett WS, Huttenhower C, Meyerson M, Giovannucci EL, Fuchs CS, Nishihara R, Ogino S. Fusobacterium nucleatum in Colorectal Carcinoma Tissue According to Tumor Location. Clin Transl Gastroenterol. 2016 Nov 3;7(11):e200. doi: 10.1038/ctg.2016.53.
- Yang Y, Weng W, Peng J, Hong L, Yang L, Toiyama Y, Gao R, Liu M, Yin M, Pan C, Li H, Guo B, Zhu Q, Wei Q, Moyer MP, Wang P, Cai S, Goel A, Qin H, Ma Y. Fusobacterium nucleatum Increases Proliferation of Colorectal Cancer Cells and Tumor Development in Mice by Activating Toll-Like Receptor 4 Signaling to Nuclear Factor-kappaB, and Up-regulating Expression of MicroRNA-21. Gastroenterology. 2017 Mar;152(4):851-866.e24. doi: 10.1053/j.gastro.2016.11.018. Epub 2016 Nov 19.
- Kostic AD, Chun E, Robertson L, Glickman JN, Gallini CA, Michaud M, Clancy TE, Chung DC, Lochhead P, Hold GL, El-Omar EM, Brenner D, Fuchs CS, Meyerson M, Garrett WS. Fusobacterium nucleatum potentiates intestinal tumorigenesis and modulates the tumor-immune microenvironment. Cell Host Microbe. 2013 Aug 14;14(2):207-15. doi: 10.1016/j.chom.2013.07.007.
- Wong SH, Kwong TNY, Chow TC, Luk AKC, Dai RZW, Nakatsu G, Lam TYT, Zhang L, Wu JCY, Chan FKL, Ng SSM, Wong MCS, Ng SC, Wu WKK, Yu J, Sung JJY. Quantitation of faecal Fusobacterium improves faecal immunochemical test in detecting advanced colorectal neoplasia. Gut. 2017 Aug;66(8):1441-1448. doi: 10.1136/gutjnl-2016-312766. Epub 2016 Oct 24.
- Sears CL. The who, where and how of fusobacteria and colon cancer. Elife. 2018 Mar 13;7:e28434. doi: 10.7554/eLife.28434.
- Abed J, Maalouf N, Parhi L, Chaushu S, Mandelboim O, Bachrach G. Tumor Targeting by Fusobacterium nucleatum: A Pilot Study and Future Perspectives. Front Cell Infect Microbiol. 2017 Jun 30;7:295. doi: 10.3389/fcimb.2017.00295. eCollection 2017.
- Rubinstein MR, Wang X, Liu W, Hao Y, Cai G, Han YW. Fusobacterium nucleatum promotes colorectal carcinogenesis by modulating E-cadherin/beta-catenin signaling via its FadA adhesin. Cell Host Microbe. 2013 Aug 14;14(2):195-206. doi: 10.1016/j.chom.2013.07.012.
- Chen Y, Peng Y, Yu J, Chen T, Wu Y, Shi L, Li Q, Wu J, Fu X. Invasive Fusobacterium nucleatum activates beta-catenin signaling in colorectal cancer via a TLR4/P-PAK1 cascade. Oncotarget. 2017 May 9;8(19):31802-31814. doi: 10.18632/oncotarget.15992.
- Bullman S, Pedamallu CS, Sicinska E, Clancy TE, Zhang X, Cai D, Neuberg D, Huang K, Guevara F, Nelson T, Chipashvili O, Hagan T, Walker M, Ramachandran A, Diosdado B, Serna G, Mulet N, Landolfi S, Ramon Y Cajal S, Fasani R, Aguirre AJ, Ng K, Elez E, Ogino S, Tabernero J, Fuchs CS, Hahn WC, Nuciforo P, Meyerson M. Analysis of Fusobacterium persistence and antibiotic response in colorectal cancer. Science. 2017 Dec 15;358(6369):1443-1448. doi: 10.1126/science.aal5240. Epub 2017 Nov 23.
- Thomas AM, Jesus EC, Lopes A, Aguiar S Jr, Begnami MD, Rocha RM, Carpinetti PA, Camargo AA, Hoffmann C, Freitas HC, Silva IT, Nunes DN, Setubal JC, Dias-Neto E. Tissue-Associated Bacterial Alterations in Rectal Carcinoma Patients Revealed by 16S rRNA Community Profiling. Front Cell Infect Microbiol. 2016 Dec 9;6:179. doi: 10.3389/fcimb.2016.00179. eCollection 2016.
Termíny studijních záznamů
Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
18. února 2020
Primární dokončení (Odhadovaný)
1. ledna 2027
Dokončení studie (Odhadovaný)
1. června 2027
Termíny zápisu do studia
První předloženo
12. listopadu 2019
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
8. ledna 2020
První zveřejněno (Aktuální)
10. ledna 2020
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
2. srpna 2023
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
31. července 2023
Naposledy ověřeno
1. července 2023
Více informací
Termíny související s touto studií
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- Pro00040924
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
NE
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Ne
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Ne
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .
Klinické studie na Sbírka tkání
-
Assistance Publique - Hôpitaux de ParisZatím nenabíráme
-
Acorai ABDokončenoSrdeční selháníSpojené státy, Švédsko, Spojené království, Kanada, Dánsko, Belgie
-
Northwell HealthBecton, Dickinson and CompanyPozastaveno
-
IdentigeneCRI Lifetree Clinical ResearchNeznámý
-
M.D. Anderson Cancer CenterDokončenoRakovina prsuSpojené státy
-
Rutgers, The State University of New JerseyNational Cancer Institute (NCI)PozastavenoPeritoneální karcinomatóza | Novotvar trávicího systému | Karcinom jater a intrahepatálních žlučovodů | Apendix Karcinom podle AJCC V8 Stage | Kolorektální karcinom podle AJCC V8 Stage | Karcinom jícnu podle stadia AJCC V8 | Karcinom žaludku podle stadia AJCC V8Spojené státy
-
Cliniques universitaires Saint-Luc- Université...Université de LiègeNáborCystická fibróza | BiomarkeryBelgie
-
Memorial Sloan Kettering Cancer CenterDokončenoRakovina prostatySpojené státy
-
Indiana UniversityUkončenoDiabetes Mellitus | Bakteriální infekce | Rána | Infikovaný vřed kůžeSpojené státy
-
University of MinnesotaNational Institute on Drug Abuse (NIDA)DokončenoPorucha užívání látkySpojené státy