Asociace genů souvisejících s autofagií, LncRNA a SNP s kolorektálním karcinomem v egyptské populaci
- Stanovení hladiny sérové exprese HOTTIP a EIF4EBP1 (eukaryotický translační iniciační faktor 4E-vazebný protein 1).
- Vyšetření SNP HOTTIP rs1859168 a jeho spojení s citlivostí CRC.
- Stanovení sérové hladiny interleukinu -6 a jeho vztahu k dalším studovaným genům.
- Korelace exprese těchto genů s různými stádii CRC ke stanovení prognostické hodnoty každého z nich.
Přehled studie
Postavení
Podmínky
Detailní popis
Kolorektální karcinom (CRC) je běžný nádor trávicího traktu 1. Je třetí nejčastější příčinou úmrtí na světě. Celková pětiletá míra přežití je nižší než 40 % a výskyt stoupá 2. Prognóza a terapie se však významně nezlepšily. Proto je nutný správný výběr pacientů pro agresivní léčbu, naléhavě jsou zapotřebí nové terapeutické a prognostické strategie 3.
Autofagie je cesta pro vlastní trávení, při které se recyklují nežádoucí cytoplazmatické složky 4. Za normálních podmínek je autofagie nezbytná pro buněčnou homeostázu 5. Autofagie má v rakovinných buňkách dvojí roli, stimulaci nebo supresi, s účinky na progresi a onkogenezi 6. Nedávný výzkum prokázal, že autofagie je důležitým cílem pro kontrolu rakoviny v závislosti na stadiu a typu nádoru 7. Různorodé molekulární mechanismy přispívají k odolnosti rakovinných buněk vůči léčbě 8. Mezi těmito mechanismy se autofagie jeví jako kritická 9.
EIF4EBP1 (eukaryotický translační iniciační faktor 4E-vazebný protein 1) je kódován genem EIF4EBP1. Působí jako efektor v dráze mTOR (savčí cíl rapamycinu), který je při aktivaci fosforylován EIF4EBP1 a podporuje buněčnou proliferaci 10. Studie naznačují, že EIF4EBP1 podporuje karcinogenezi jako u hepatocelulárního karcinomu. Jeho role v CRC však nebyla objasněna10.
Dlouhé nekódující RNA (lncRNA) jsou skupina RNA, 200 nukleotidů o délce 11,. Exprese lncRNA byla objevena v mnoha nádorech, které působí jako onkogeny. „HOXA (hydrogenázový transkripční regulační protein) transkript na distální špičce“ (HOTTIP) v poslední době získal pozornost. Je up-regulován ve tkáni CRC a reguluje geny prostřednictvím epigenetické modifikace. Proto by mohl být kandidátem pro kancerizaci a terapii CRC 12.
Exprese lncRNA by mohla být ovlivněna jednonukleotidovými polymorfismy (SNP), nejběžnější genetickou variací v lidských genomech13. rs1859168 byl hlášen jako potenciální funkční polymorfismus na HOTTIP, který mění jeho úroveň exprese 14. Nedávno bylo také oznámeno, že HOTTIP zvyšuje expresi interleukinu 6, což potencuje imunitní únik rakovinných buněk 15.
Typ studie
Zápis (Aktuální)
Kontakty a umístění
Studijní místa
-
-
-
Assiut, Egypt
- Assiut University
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
Přijímá zdravé dobrovolníky
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Zdravé kontroly ( n = 74) se co nejvíce shodovaly s případy, pokud jde o věk a pohlaví.
-Pacienti s kolorektálním karcinomem (n = 74) od stadia I-III s následujícími kritérii:-
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Žádná náklonnost k sexu.
- Věk (25-65 let).
- Kolorektální karcinom potvrzený histopatologickým vyšetřením
Kritéria vyloučení:
- -pacienti, kteří podstoupili jakoukoli léčbu.
- Případy s jinými rakovinami orgánů.
- Historie chemoterapie a radioterapie.
- Systémová onemocnění, jako je selhání ledvin, diabetes mellitus a hypertenze.
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Observační modely: Case-Control
- Časové perspektivy: Průřezový
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
Intervence / Léčba |
|---|---|
|
pacientů s kolorektálním karcinomem
Pacienti s kolorektálním karcinomem (n = 30) od stadia I-III s následujícími kritérii:- A. Kritéria pro zařazení:
|
5 ml čerstvého vzorku krve, normální a CRC tkáně
|
|
Zdravé kontroly (n = 30)
pokud jde o věk a pohlaví, co nejvíce se shodují s případy.
|
5 ml čerstvého vzorku krve, normální a CRC tkáně
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Genová exprese HOTTIP
Časové okno: 2 roky
|
Odhad úrovně exprese HOTTIP v mononukleárních buňkách a tkáni periferní krve s cílem využít co možná méně invazivních prognostických markerů pro kolorektální karcinom.
|
2 roky
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
EIF4EBP
Časové okno: 2 roky
|
Odhad úrovně exprese EIF4EBP v mononukleárních buňkách a tkáni periferní krve
|
2 roky
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Spolupracovníci
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Esraa H Mohamed, Master, Assistant lecturer of Medical Microbiology and Immunology
Publikace a užitečné odkazy
Obecné publikace
- Chisanga D, Keerthikumar S, Pathan M, Ariyaratne D, Kalra H, Boukouris S, Mathew NA, Al Saffar H, Gangoda L, Ang CS, Sieber OM, Mariadason JM, Dasgupta R, Chilamkurti N, Mathivanan S. Colorectal cancer atlas: An integrative resource for genomic and proteomic annotations from colorectal cancer cell lines and tissues. Nucleic Acids Res. 2016 Jan 4;44(D1):D969-74. doi: 10.1093/nar/gkv1097. Epub 2015 Oct 22.
- Katheder NS, Khezri R, O'Farrell F, Schultz SW, Jain A, Rahman MM, Schink KO, Theodossiou TA, Johansen T, Juhasz G, Bilder D, Brech A, Stenmark H, Rusten TE. Microenvironmental autophagy promotes tumour growth. Nature. 2017 Jan 19;541(7637):417-420. doi: 10.1038/nature20815. Epub 2017 Jan 11.
- Rahman MA, Rhim H. Therapeutic implication of autophagy in neurodegenerative diseases. BMB Rep. 2017 Jul;50(7):345-354. doi: 10.5483/bmbrep.2017.50.7.069.
- Uddin MS, Stachowiak A, Mamun AA, Tzvetkov NT, Takeda S, Atanasov AG, Bergantin LB, Abdel-Daim MM, Stankiewicz AM. Autophagy and Alzheimer's Disease: From Molecular Mechanisms to Therapeutic Implications. Front Aging Neurosci. 2018 Jan 30;10:04. doi: 10.3389/fnagi.2018.00004. eCollection 2018.
- Avalos Y, Canales J, Bravo-Sagua R, Criollo A, Lavandero S, Quest AF. Tumor suppression and promotion by autophagy. Biomed Res Int. 2014;2014:603980. doi: 10.1155/2014/603980. Epub 2014 Sep 18.
- Abdullah LN, Chow EK. Mechanisms of chemoresistance in cancer stem cells. Clin Transl Med. 2013 Jan 17;2(1):3. doi: 10.1186/2001-1326-2-3.
- Ojha R, Bhattacharyya S, Singh SK. Autophagy in Cancer Stem Cells: A Potential Link Between Chemoresistance, Recurrence, and Metastasis. Biores Open Access. 2015 Jan 1;4(1):97-108. doi: 10.1089/biores.2014.0035. eCollection 2015.
- Cha YL, Li PD, Yuan LJ, Zhang MY, Zhang YJ, Rao HL, Zhang HZ, Zheng XF, Wang HY. EIF4EBP1 overexpression is associated with poor survival and disease progression in patients with hepatocellular carcinoma. PLoS One. 2015 Feb 6;10(2):e0117493. doi: 10.1371/journal.pone.0117493. eCollection 2015.
- Bonasio R, Shiekhattar R. Regulation of transcription by long noncoding RNAs. Annu Rev Genet. 2014;48:433-55. doi: 10.1146/annurev-genet-120213-092323. Epub 2014 Sep 18.
- Wang KC, Yang YW, Liu B, Sanyal A, Corces-Zimmerman R, Chen Y, Lajoie BR, Protacio A, Flynn RA, Gupta RA, Wysocka J, Lei M, Dekker J, Helms JA, Chang HY. A long noncoding RNA maintains active chromatin to coordinate homeotic gene expression. Nature. 2011 Apr 7;472(7341):120-4. doi: 10.1038/nature09819. Epub 2011 Mar 20.
- Lv Z, Xu Q, Yuan Y. A systematic review and meta-analysis of the association between long non-coding RNA polymorphisms and cancer risk. Mutat Res Rev Mutat Res. 2017 Jan-Mar;771:1-14. doi: 10.1016/j.mrrev.2016.10.002. Epub 2016 Nov 5.
- Hu P, Qiao O, Wang J, Li J, Jin H, Li Z, Jin Y. rs1859168 A > C polymorphism regulates HOTTIP expression and reduces risk of pancreatic cancer in a Chinese population. World J Surg Oncol. 2017 Aug 17;15(1):155. doi: 10.1186/s12957-017-1218-0.
- Shang A, Wang W, Gu C, Chen C, Zeng B, Yang Y, Ji P, Sun J, Wu J, Lu W, Sun Z, Li D. Correction to: Long non-coding RNA HOTTIP enhances IL-6 expression to potentiate immune escape of ovarian cancer cells by upregulating the expression of PD-L1 in neutrophils. J Exp Clin Cancer Res. 2020 Dec 4;39(1):272. doi: 10.1186/s13046-020-01755-z.
- Vorobiova OA. [Participation of the supraoptic nucleus of the anterior hypothalamus in controlling the gonadotropic functions of the pituitary]. Fiziol Zh. 1974 May-Jun;20(3):334-8. No abstract available. Ukrainian.
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Primární dokončení (Aktuální)
Dokončení studie (Aktuální)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- Esraa Hassan MD Protocol
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Popis plánu IPD
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
produkt vyrobený a vyvážený z USA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .