Association des gènes liés à l'autophagie, de l'ARNlnc et des SNP avec le cancer colorectal dans la population égyptienne
- Détermination du niveau d'expression sérique de HOTTIP et EIF4EBP1 (Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1) .
- Enquête sur le SNP HOTTIP rs1859168 et son association avec la susceptibilité au CRC.
- Détermination du taux sérique d'interleukine -6 et sa relation avec d'autres gènes étudiés.
- Corrélation de l'expression de ces gènes avec différents stades du CCR pour déterminer la valeur pronostique de chacun d'eux.
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Intervention / Traitement
Description détaillée
Le cancer colorectal (CCR) est une tumeur courante du tube digestif 1. Il s'agit de la troisième cause de décès dans le monde. Le taux de survie global à 5 ans est inférieur à 40 % et la fréquence est en augmentation 2. Cependant, le pronostic et le traitement n'ont pas été significativement améliorés. Par conséquent, une sélection appropriée des patients pour un traitement agressif est nécessaire, de nouvelles stratégies thérapeutiques et pronostiques sont nécessaires de toute urgence 3.
L'autophagie est une voie d'autodigestion, dans laquelle les composants cytoplasmiques indésirables sont recyclés 4. Dans des conditions normales, l'autophagie est essentielle à l'homéostasie cellulaire 5. L'autophagie a un double rôle dans les cellules cancéreuses, stimulation ou suppression, avec des effets sur la progression et l'oncogenèse 6. Des recherches récentes ont établi que l'autophagie est une cible importante pour contrôler le cancer en fonction du stade et du type de tumeur 7. Divers mécanismes moléculaires contribuent à la résistance des cellules cancéreuses au traitement 8. Parmi ces mécanismes, l'autophagie semble être essentielle 9.
EIF4EBP1 (Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1) est codé par le gène EIF4EBP1. Il agit comme un effecteur dans la voie mTOR (mammilian target of rapamycin) qui, lors de l'activation, EIF4EBP1 est phosphorylé favorisant la prolifération cellulaire 10. Des études ont suggéré que EIF4EBP1 favorise la carcinogenèse comme dans le carcinome hépatocellulaire. Cependant, son rôle dans le CCR n'a pas été élucidé 10.
Les ARN longs non codants (ARNlnc) sont un groupe d'ARN d'une longueur de 200 nucléotides 11,. L'expression d'ARNlnc a été découverte dans de multiples tumeurs, agissant comme des oncogènes. Le « transcrit HOXA (protéine régulatrice de la transcription de l'hydrogénase) à l'extrémité distale » (HOTTIP) a récemment retenu l'attention. Par conséquent, il pourrait être un candidat pour la cancérisation et le traitement du CRC 12.
L'expression des lncRNA pourrait être affectée par les polymorphismes mononucléotidiques (SNP), la variation génétique la plus courante dans les génomes humains13. rs1859168 a été signalé comme un polymorphisme fonctionnel potentiel sur HOTTIP qui modifie son niveau d'expression 14. De plus, il a été récemment rapporté que HOTTIP améliore l'expression de l'interleukine 6, qui potentialise l'évasion immunitaire des cellules cancéreuses 15.
Type d'étude
Inscription (Réel)
Contacts et emplacements
Lieux d'étude
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Assiut, Egypte
- Assiut University
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
Accepte les volontaires sains
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
Les témoins sains (n = 74) appariés autant que possible en ce qui concerne l'âge et le sexe avec les cas.
- Patients atteints d'un cancer colorectal ( n = 74 ) de stade I-III avec les critères suivants : -
La description
Critère d'intégration:
- Pas de prédilection sexuelle.
- Âge (25-65 ans).
- Carcinome colorectal confirmé par examen histopathologique
Critère d'exclusion:
- -les patients qui ont reçu un traitement.
- Cas avec d'autres cancers d'organes.
- Histoire de la chimiothérapie et de la radiothérapie.
- Maladies systémiques telles que l'insuffisance rénale, le diabète sucré et l'hypertension.
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
- Modèles d'observation: Cas-témoins
- Perspectives temporelles: Transversale
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
Intervention / Traitement |
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patients atteints d'un cancer colorectal
Patients atteints d'un cancer colorectal (n = 30) de stade I à III avec les critères suivants : - un. Critère d'intégration:
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Test diagnostique: PBMC et expression tissulaire de HOTTIP, EIF4EBP1 et SNP sérique HOTTIP rs1859168
5 ml d'échantillon de sang frais, tissu normal et CCR
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Contrôles sains (n = 30)
autant que possible en termes d'âge et de sexe avec les cas.
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Test diagnostique: PBMC et expression tissulaire de HOTTIP, EIF4EBP1 et SNP sérique HOTTIP rs1859168
5 ml d'échantillon de sang frais, tissu normal et CCR
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Expression du gène HOTTIP
Délai: 2 ans
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Estimation du niveau d'expression de HOTTIP dans les cellules mononucléées et les tissus du sang périphérique visant à utiliser autant que possible des marqueurs pronostiques moins invasifs du cancer colorectal.
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2 ans
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Mesures de résultats secondaires
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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FEI4EBP
Délai: 2 ans
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Estimation du niveau d'expression d'EIF4EBP dans les cellules mononucléées et les tissus du sang périphérique
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2 ans
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Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Collaborateurs
Les enquêteurs
- Chercheur principal: Esraa H Mohamed, Master, Assistant lecturer of Medical Microbiology and Immunology
Publications et liens utiles
Publications générales
- Chisanga D, Keerthikumar S, Pathan M, Ariyaratne D, Kalra H, Boukouris S, Mathew NA, Al Saffar H, Gangoda L, Ang CS, Sieber OM, Mariadason JM, Dasgupta R, Chilamkurti N, Mathivanan S. Colorectal cancer atlas: An integrative resource for genomic and proteomic annotations from colorectal cancer cell lines and tissues. Nucleic Acids Res. 2016 Jan 4;44(D1):D969-74. doi: 10.1093/nar/gkv1097. Epub 2015 Oct 22.
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Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Achèvement primaire (Réel)
Achèvement de l'étude (Réel)
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Première publication (Réel)
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Dernière mise à jour publiée (Réel)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
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Mots clés
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