Association of Autophagy-relaterade gener, LncRNA och SNPs med kolorektal cancer i egyptisk befolkning
- Bestämning av serumexpressionsnivån för HOTTIP och EIF4EBP1 (Eukaryot translationsinitieringsfaktor 4E-bindande protein 1).
- Undersökning av SNP HOTTIP rs1859168 och dess samband med CRC-känslighet.
- Bestämning av serumnivån av Interleukin -6 och dess relation till andra studerade gener.
- Korrelation av uttrycket av dessa gener med olika stadier av CRC för att bestämma det prognostiska värdet av var och en av dem.
Studieöversikt
Status
Betingelser
Intervention / Behandling
Detaljerad beskrivning
Kolorektal cancer (CRC) är en vanlig tumör i matsmältningskanalen 1. Den är den tredje vanligaste dödsorsaken i världen. Den totala 5-års överlevnaden är mindre än 40 %, och förekomsten ökar 2. Prognosen och behandlingen har dock inte förbättrats signifikant. Därför är ett korrekt urval av patienter för aggressiv behandling nödvändigt, nya terapeutiska och prognostiska strategier behövs akut 3.
Autofagi är en väg för självsmältning, där oönskade cytoplasmatiska komponenter återvinns 4. Under normala förhållanden är autofagi avgörande för cellulär homeostas 5. Autofagi har dubbla roller i cancerceller, stimulering eller undertryckning, med effekter på progression och onkogenes 6. Ny forskning har fastställt att autofagi är ett viktigt mål för att kontrollera cancer beroende på stadium och typ av tumör 7. Olika molekylära mekanismer bidrar till cancercellers motståndskraft mot behandling 8. Bland dessa mekanismer verkar autofagi vara avgörande 9.
EIF4EBP1 (eukaryot translationsinitieringsfaktor 4E-bindande protein 1) kodas av EIF4EBP1-genen. Den fungerar som en effektor i mTOR-vägen (mammilian target of rapamycin) som vid aktivering är EIF4EBP1 fosforylerad och främjar cellproliferation 10. Studier har föreslagit att EIF4EBP1 främjar karcinogenes som vid hepatocellulärt karcinom. Däremot har dess roll i CRC inte klarlagts 10.
Långa icke-kodande RNA (lncRNA) är en grupp av RNA, 200 nukleotider i längd 11,. Uttryck av lncRNA har upptäckts i flera tumörer, som fungerar som onkogener. 'HOXA (hydrogenase transcriptional regulatory protein) transcript at the distal tip' (HOTTIP) har fått uppmärksamhet på sistone. Det är uppreglerat i CRC-vävnad, som reglerar gener via epigenetisk modifiering. Därför kan det vara en kandidat för cancerbildning och terapi av CRC 12.
Uttryck av lncRNA kan påverkas av singelnukleotidpolymorfismer (SNP), den vanligaste genetiska variationen i mänskliga genom13. rs1859168 rapporterades som en potentiell funktionell polymorfism på HOTTIP som ändrar dess uttrycksnivå 14. Det har också nyligen rapporterats att HOTTIP förbättrar interleukin 6-uttryck, vilket potentierar immunutrymning av cancerceller 15.
Studietyp
Inskrivning (Faktisk)
Kontakter och platser
Studieorter
-
-
-
Assiut, Egypten
- Assiut University
-
-
Deltagandekriterier
Urvalskriterier
Åldrar som är berättigade till studier
Tar emot friska volontärer
Testmetod
Studera befolkning
Friska kontroller (n = 74) matchade så mycket som möjligt vad gäller ålder och kön med fall.
-Kokolorektal cancerpatienter (n = 74) från stadium I-III med följande kriterier:-
Beskrivning
Inklusionskriterier:
- Ingen sexförkärlek.
- Ålder (25-65 år).
- Kolorektalt karcinom bekräftat genom histopatologisk undersökning
Exklusions kriterier:
- -patienter som fått någon behandling.
- Fall med andra organcancer.
- Historien om kemoterapi och strålbehandling.
- Systemiska sjukdomar som njursvikt, diabetes mellitus och högt blodtryck.
Studieplan
Hur är studien utformad?
Designdetaljer
- Observationsmodeller: Case-Control
- Tidsperspektiv: Tvärsnitt
Kohorter och interventioner
Grupp / Kohort |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
kolorektal cancerpatienter
Kolorektal cancerpatienter (n = 30) från stadium I-III med följande kriterier:- a. Inklusionskriterier:
|
5 ml färskt blodprov, normal och CRC-vävnad
|
|
Friska kontroller (n = 30)
matchas vad gäller ålder och kön så mycket som möjligt med fall.
|
5 ml färskt blodprov, normal och CRC-vävnad
|
Vad mäter studien?
Primära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
HOTTIP genuttryck
Tidsram: 2 år
|
Uppskattning av uttrycksnivån av HOTTIP i perifera mononukleära blodceller och vävnad med syfte att använda mindre invasiva prognostiska markörer för kolorektal cancer som möjligt.
|
2 år
|
Sekundära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
EIF4EBP
Tidsram: 2 år
|
Uppskattning av uttrycksnivån av EIF4EBP i perifera mononukleära blodceller och vävnad
|
2 år
|
Samarbetspartners och utredare
Sponsor
Samarbetspartners
Utredare
- Huvudutredare: Esraa H Mohamed, Master, Assistant lecturer of Medical Microbiology and Immunology
Publikationer och användbara länkar
Allmänna publikationer
- Chisanga D, Keerthikumar S, Pathan M, Ariyaratne D, Kalra H, Boukouris S, Mathew NA, Al Saffar H, Gangoda L, Ang CS, Sieber OM, Mariadason JM, Dasgupta R, Chilamkurti N, Mathivanan S. Colorectal cancer atlas: An integrative resource for genomic and proteomic annotations from colorectal cancer cell lines and tissues. Nucleic Acids Res. 2016 Jan 4;44(D1):D969-74. doi: 10.1093/nar/gkv1097. Epub 2015 Oct 22.
- Katheder NS, Khezri R, O'Farrell F, Schultz SW, Jain A, Rahman MM, Schink KO, Theodossiou TA, Johansen T, Juhasz G, Bilder D, Brech A, Stenmark H, Rusten TE. Microenvironmental autophagy promotes tumour growth. Nature. 2017 Jan 19;541(7637):417-420. doi: 10.1038/nature20815. Epub 2017 Jan 11.
- Rahman MA, Rhim H. Therapeutic implication of autophagy in neurodegenerative diseases. BMB Rep. 2017 Jul;50(7):345-354. doi: 10.5483/bmbrep.2017.50.7.069.
- Uddin MS, Stachowiak A, Mamun AA, Tzvetkov NT, Takeda S, Atanasov AG, Bergantin LB, Abdel-Daim MM, Stankiewicz AM. Autophagy and Alzheimer's Disease: From Molecular Mechanisms to Therapeutic Implications. Front Aging Neurosci. 2018 Jan 30;10:04. doi: 10.3389/fnagi.2018.00004. eCollection 2018.
- Avalos Y, Canales J, Bravo-Sagua R, Criollo A, Lavandero S, Quest AF. Tumor suppression and promotion by autophagy. Biomed Res Int. 2014;2014:603980. doi: 10.1155/2014/603980. Epub 2014 Sep 18.
- Abdullah LN, Chow EK. Mechanisms of chemoresistance in cancer stem cells. Clin Transl Med. 2013 Jan 17;2(1):3. doi: 10.1186/2001-1326-2-3.
- Ojha R, Bhattacharyya S, Singh SK. Autophagy in Cancer Stem Cells: A Potential Link Between Chemoresistance, Recurrence, and Metastasis. Biores Open Access. 2015 Jan 1;4(1):97-108. doi: 10.1089/biores.2014.0035. eCollection 2015.
- Cha YL, Li PD, Yuan LJ, Zhang MY, Zhang YJ, Rao HL, Zhang HZ, Zheng XF, Wang HY. EIF4EBP1 overexpression is associated with poor survival and disease progression in patients with hepatocellular carcinoma. PLoS One. 2015 Feb 6;10(2):e0117493. doi: 10.1371/journal.pone.0117493. eCollection 2015.
- Bonasio R, Shiekhattar R. Regulation of transcription by long noncoding RNAs. Annu Rev Genet. 2014;48:433-55. doi: 10.1146/annurev-genet-120213-092323. Epub 2014 Sep 18.
- Wang KC, Yang YW, Liu B, Sanyal A, Corces-Zimmerman R, Chen Y, Lajoie BR, Protacio A, Flynn RA, Gupta RA, Wysocka J, Lei M, Dekker J, Helms JA, Chang HY. A long noncoding RNA maintains active chromatin to coordinate homeotic gene expression. Nature. 2011 Apr 7;472(7341):120-4. doi: 10.1038/nature09819. Epub 2011 Mar 20.
- Lv Z, Xu Q, Yuan Y. A systematic review and meta-analysis of the association between long non-coding RNA polymorphisms and cancer risk. Mutat Res Rev Mutat Res. 2017 Jan-Mar;771:1-14. doi: 10.1016/j.mrrev.2016.10.002. Epub 2016 Nov 5.
- Hu P, Qiao O, Wang J, Li J, Jin H, Li Z, Jin Y. rs1859168 A > C polymorphism regulates HOTTIP expression and reduces risk of pancreatic cancer in a Chinese population. World J Surg Oncol. 2017 Aug 17;15(1):155. doi: 10.1186/s12957-017-1218-0.
- Shang A, Wang W, Gu C, Chen C, Zeng B, Yang Y, Ji P, Sun J, Wu J, Lu W, Sun Z, Li D. Correction to: Long non-coding RNA HOTTIP enhances IL-6 expression to potentiate immune escape of ovarian cancer cells by upregulating the expression of PD-L1 in neutrophils. J Exp Clin Cancer Res. 2020 Dec 4;39(1):272. doi: 10.1186/s13046-020-01755-z.
- Vorobiova OA. [Participation of the supraoptic nucleus of the anterior hypothalamus in controlling the gonadotropic functions of the pituitary]. Fiziol Zh. 1974 May-Jun;20(3):334-8. No abstract available. Ukrainian.
Studieavstämningsdatum
Studera stora datum
Studiestart (Faktisk)
Primärt slutförande (Faktisk)
Avslutad studie (Faktisk)
Studieregistreringsdatum
Först inskickad
Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna
Första postat (Faktisk)
Uppdateringar av studier
Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)
Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna
Senast verifierad
Mer information
Termer relaterade till denna studie
Nyckelord
Ytterligare relevanta MeSH-villkor
Andra studie-ID-nummer
- Esraa Hassan MD Protocol
Plan för individuella deltagardata (IPD)
Planerar du att dela individuella deltagardata (IPD)?
IPD-planbeskrivning
Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument
Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt
Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt
produkt tillverkad i och exporterad från U.S.A.
Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .