Assoziation von Autophagie-bezogenen Genen, LncRNA und SNPs mit Darmkrebs in der ägyptischen Bevölkerung
- Bestimmung des Serumexpressionsspiegels von HOTTIP und EIF4EBP1 (eukaryotischer Translationsinitiationsfaktor 4E-Bindungsprotein 1).
- Untersuchung des SNP HOTTIP rs1859168 und seiner Assoziation mit CRC-Anfälligkeit.
- Bestimmung des Serumspiegels von Interleukin-6 und seine Beziehung zu anderen untersuchten Genen.
- Korrelation der Expression dieser Gene mit verschiedenen Stadien von CRC, um den prognostischen Wert von jedem von ihnen zu bestimmen.
Studienübersicht
Status
Bedingungen
Intervention / Behandlung
Detaillierte Beschreibung
Darmkrebs (CRC) ist ein häufiger Tumor des Verdauungstrakts 1. Er ist die dritthäufigste Todesursache weltweit. Die 5-Jahres-Gesamtüberlebensrate beträgt weniger als 40 %, und das Auftreten nimmt zu 2. Prognose und Therapie wurden jedoch nicht signifikant verbessert. Daher ist eine geeignete Auswahl von Patienten für eine aggressive Behandlung notwendig, neue therapeutische und prognostische Strategien werden dringend benötigt 3.
Autophagie ist ein Weg zur Selbstverdauung, bei dem unerwünschte zytoplasmatische Komponenten wiederverwertet werden 4. Unter normalen Bedingungen ist Autophagie für die zelluläre Homöostase unerlässlich 5. Autophagie hat in Krebszellen eine doppelte Rolle, Stimulation oder Unterdrückung, mit Auswirkungen auf das Fortschreiten und die Onkogenese 6. Jüngste Forschungen haben ergeben, dass die Autophagie je nach Stadium und Art des Tumors ein wichtiges Ziel für die Krebsbekämpfung ist 7. Verschiedene molekulare Mechanismen tragen zur Resistenz von Krebszellen gegenüber der Behandlung bei 8. Unter diesen Mechanismen scheint die Autophagie von entscheidender Bedeutung zu sein 9.
EIF4EBP1 (Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1) wird vom EIF4EBP1-Gen kodiert. Es fungiert als Effektor im mTOR-Signalweg (mammilian target of rapamycin), der bei Aktivierung EIF4EBP1 phosphoryliert und die Zellproliferation fördert 10. Studien haben gezeigt, dass EIF4EBP1 die Karzinogenese wie beim hepatozellulären Karzinom fördert. Seine Rolle bei CRC wurde jedoch nicht aufgeklärt 10.
Lange nicht-codierende RNAs (lncRNAs) sind eine Gruppe von RNA, 200 Nukleotide lang 11,. Die Expression von lncRNAs wurde in mehreren Tumoren entdeckt, die als Onkogene wirken. „HOXA (Hydrogenase Transcriptional Regulatory Protein) Transkript an der distalen Spitze“ (HOTTIP) hat in letzter Zeit Aufmerksamkeit erregt. Es wird im CRC-Gewebe hochreguliert und reguliert Gene durch epigenetische Modifikation. Daher könnte es ein Kandidat für die Kanzerisierung und Therapie von CRC 12 sein.
Die Expression von lncRNAs könnte durch Einzelnukleotidpolymorphismen (SNPs), die häufigste genetische Variation im menschlichen Genom13, beeinflusst werden. rs1859168 wurde als potenzieller funktioneller Polymorphismus auf HOTTIP beschrieben, der dessen Expressionsniveau verändert 14. Außerdem wurde kürzlich berichtet, dass HOTTIP die Expression von Interleukin 6 verstärkt, was die Immunflucht von Krebszellen potenziert 15.
Studientyp
Einschreibung (Tatsächlich)
Kontakte und Standorte
Studienorte
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Assiut, Ägypten
- Assiut University
-
-
Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Probenahmeverfahren
Studienpopulation
Gesunde Kontrollen (n = 74) stimmten bezüglich Alter und Geschlecht möglichst gut mit den Fällen überein.
- Darmkrebspatienten ( n = 74 ) im Stadium I-III mit folgenden Kriterien: -
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- Keine Geschlechtspräferenz.
- Alter (25-65 Jahre).
- Durch histopathologische Untersuchung bestätigtes kolorektales Karzinom
Ausschlusskriterien:
- -Patienten, die eine Behandlung erhalten haben.
- Fälle mit anderen Organkrebsarten.
- Geschichte der Chemotherapie und Strahlentherapie.
- Systemische Erkrankungen wie Nierenversagen, Diabetes mellitus und Bluthochdruck.
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
- Beobachtungsmodelle: Fallkontrolle
- Zeitperspektiven: Querschnitt
Kohorten und Interventionen
Gruppe / Kohorte |
Intervention / Behandlung |
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Patienten mit Darmkrebs
Patienten mit Darmkrebs (n = 30) im Stadium I–III mit den folgenden Kriterien: – A. Einschlusskriterien:
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5 ml frische Blutprobe, normales und CRC-Gewebe
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Gesunde Kontrollpersonen (n = 30)
hinsichtlich Alter und Geschlecht so weit wie möglich mit den Fällen abgeglichen.
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5 ml frische Blutprobe, normales und CRC-Gewebe
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Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
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HOTTIP Genexpression
Zeitfenster: 2 Jahre
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Schätzung des Expressionsniveaus von HOTTIP in mononukleären Zellen und Gewebe des peripheren Blutes mit dem Ziel, möglichst weniger invasive Prognosemarker für Darmkrebs zu verwenden.
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2 Jahre
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Sekundäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
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EIF4EBP
Zeitfenster: 2 Jahre
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Schätzung des Expressionsniveaus von EIF4EBP in mononukleären Zellen und Gewebe des peripheren Blutes
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2 Jahre
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Mitarbeiter und Ermittler
Sponsor
Mitarbeiter
Ermittler
- Hauptermittler: Esraa H Mohamed, Master, Assistant lecturer of Medical Microbiology and Immunology
Publikationen und hilfreiche Links
Allgemeine Veröffentlichungen
- Chisanga D, Keerthikumar S, Pathan M, Ariyaratne D, Kalra H, Boukouris S, Mathew NA, Al Saffar H, Gangoda L, Ang CS, Sieber OM, Mariadason JM, Dasgupta R, Chilamkurti N, Mathivanan S. Colorectal cancer atlas: An integrative resource for genomic and proteomic annotations from colorectal cancer cell lines and tissues. Nucleic Acids Res. 2016 Jan 4;44(D1):D969-74. doi: 10.1093/nar/gkv1097. Epub 2015 Oct 22.
- Katheder NS, Khezri R, O'Farrell F, Schultz SW, Jain A, Rahman MM, Schink KO, Theodossiou TA, Johansen T, Juhasz G, Bilder D, Brech A, Stenmark H, Rusten TE. Microenvironmental autophagy promotes tumour growth. Nature. 2017 Jan 19;541(7637):417-420. doi: 10.1038/nature20815. Epub 2017 Jan 11.
- Rahman MA, Rhim H. Therapeutic implication of autophagy in neurodegenerative diseases. BMB Rep. 2017 Jul;50(7):345-354. doi: 10.5483/bmbrep.2017.50.7.069.
- Uddin MS, Stachowiak A, Mamun AA, Tzvetkov NT, Takeda S, Atanasov AG, Bergantin LB, Abdel-Daim MM, Stankiewicz AM. Autophagy and Alzheimer's Disease: From Molecular Mechanisms to Therapeutic Implications. Front Aging Neurosci. 2018 Jan 30;10:04. doi: 10.3389/fnagi.2018.00004. eCollection 2018.
- Avalos Y, Canales J, Bravo-Sagua R, Criollo A, Lavandero S, Quest AF. Tumor suppression and promotion by autophagy. Biomed Res Int. 2014;2014:603980. doi: 10.1155/2014/603980. Epub 2014 Sep 18.
- Abdullah LN, Chow EK. Mechanisms of chemoresistance in cancer stem cells. Clin Transl Med. 2013 Jan 17;2(1):3. doi: 10.1186/2001-1326-2-3.
- Ojha R, Bhattacharyya S, Singh SK. Autophagy in Cancer Stem Cells: A Potential Link Between Chemoresistance, Recurrence, and Metastasis. Biores Open Access. 2015 Jan 1;4(1):97-108. doi: 10.1089/biores.2014.0035. eCollection 2015.
- Cha YL, Li PD, Yuan LJ, Zhang MY, Zhang YJ, Rao HL, Zhang HZ, Zheng XF, Wang HY. EIF4EBP1 overexpression is associated with poor survival and disease progression in patients with hepatocellular carcinoma. PLoS One. 2015 Feb 6;10(2):e0117493. doi: 10.1371/journal.pone.0117493. eCollection 2015.
- Bonasio R, Shiekhattar R. Regulation of transcription by long noncoding RNAs. Annu Rev Genet. 2014;48:433-55. doi: 10.1146/annurev-genet-120213-092323. Epub 2014 Sep 18.
- Wang KC, Yang YW, Liu B, Sanyal A, Corces-Zimmerman R, Chen Y, Lajoie BR, Protacio A, Flynn RA, Gupta RA, Wysocka J, Lei M, Dekker J, Helms JA, Chang HY. A long noncoding RNA maintains active chromatin to coordinate homeotic gene expression. Nature. 2011 Apr 7;472(7341):120-4. doi: 10.1038/nature09819. Epub 2011 Mar 20.
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- Hu P, Qiao O, Wang J, Li J, Jin H, Li Z, Jin Y. rs1859168 A > C polymorphism regulates HOTTIP expression and reduces risk of pancreatic cancer in a Chinese population. World J Surg Oncol. 2017 Aug 17;15(1):155. doi: 10.1186/s12957-017-1218-0.
- Shang A, Wang W, Gu C, Chen C, Zeng B, Yang Y, Ji P, Sun J, Wu J, Lu W, Sun Z, Li D. Correction to: Long non-coding RNA HOTTIP enhances IL-6 expression to potentiate immune escape of ovarian cancer cells by upregulating the expression of PD-L1 in neutrophils. J Exp Clin Cancer Res. 2020 Dec 4;39(1):272. doi: 10.1186/s13046-020-01755-z.
- Vorobiova OA. [Participation of the supraoptic nucleus of the anterior hypothalamus in controlling the gonadotropic functions of the pituitary]. Fiziol Zh. 1974 May-Jun;20(3):334-8. No abstract available. Ukrainian.
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Studienbeginn (Tatsächlich)
Primärer Abschluss (Tatsächlich)
Studienabschluss (Tatsächlich)
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Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Tatsächlich)
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Letztes Update gepostet (Tatsächlich)
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Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
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