Associazione di geni correlati all'autofagia, LncRNA e SNP con cancro del colon-retto nella popolazione egiziana
- Determinazione del livello di espressione sierica di HOTTIP e EIF4EBP1 (proteina legante 1 del fattore di inizio della traduzione eucariotica 4E).
- Indagine sull'SNP HOTTIP rs1859168 e la sua associazione con la suscettibilità CRC.
- Determinazione del livello sierico di interleuchina -6 e sua relazione con altri geni studiati.
- Correlazione dell'espressione di questi geni con vari stadi di CRC per determinare il valore prognostico di ciascuno di essi.
Panoramica dello studio
Stato
Condizioni
Intervento / Trattamento
Descrizione dettagliata
Il cancro del colon-retto (CRC) è un comune tumore del tratto digestivo 1. È la terza causa di morte nel mondo. Il tasso complessivo di sopravvivenza a 5 anni è inferiore al 40% e l'incidenza è in aumento 2. Tuttavia, la prognosi e la terapia non sono migliorate in modo significativo. Pertanto, è necessaria un'adeguata selezione dei pazienti per il trattamento aggressivo, sono urgentemente necessarie nuove strategie terapeutiche e prognostiche 3.
L'autofagia è un percorso per l'auto-digestione, in cui i componenti citoplasmatici indesiderati vengono riciclati 4. In condizioni normali, l'autofagia è essenziale per l'omeostasi cellulare 5. L'autofagia ha un duplice ruolo nelle cellule tumorali, stimolazione o soppressione, con effetti sulla progressione e sull'oncogenesi 6. Ricerche recenti hanno stabilito che l'autofagia è un obiettivo importante per il controllo del cancro a seconda dello stadio e del tipo di tumore 7. Diversi meccanismi molecolari contribuiscono alla resistenza delle cellule tumorali al trattamento 8. Tra questi meccanismi, l'autofagia sembra essere fondamentale 9.
EIF4EBP1 (Eukaryotic translation iniziation factor 4E-binding protein 1) è codificato dal gene EIF4EBP1. Agisce come effettore nella via mTOR (bersaglio mammiliano della rapamicina) che all'attivazione, EIF4EBP1 viene fosforilata promuovendo la proliferazione cellulare 10. Gli studi hanno suggerito che EIF4EBP1 promuove la carcinogenesi come nel carcinoma epatocellulare. Tuttavia, il suo ruolo nel CRC non è stato chiarito 10.
Gli RNA lunghi non codificanti (lncRNA) sono gruppi di RNA , 200 nucleotidi di lunghezza 11,. L'espressione di lncRNA è stata scoperta in più tumori, agendo come oncogeni. Il trascritto "HOXA (proteina regolatrice trascrizionale dell'idrogenasi) sulla punta distale" (HOTTIP) ha ricevuto attenzione ultimamente. È up-regolato nel tessuto CRC, regolando i geni tramite modificazione epigenetica. Pertanto, potrebbe essere un candidato per la cancerizzazione e la terapia del CRC 12.
L'espressione degli lncRNA potrebbe essere influenzata dai polimorfismi a singolo nucleotide (SNP), la variazione genetica più comune nei genomi umani13. rs1859168 è stato segnalato come un potenziale polimorfismo funzionale su HOTTIP che altera il suo livello di espressione 14. Inoltre, è stato recentemente riportato che HOTTIP migliora l'espressione dell'interleuchina 6, che potenzia la fuga immunitaria delle cellule tumorali 15.
Tipo di studio
Iscrizione (Stimato)
Contatti e Sedi
Luoghi di studio
-
-
-
Assiut, Egitto
- Assiut University
-
-
Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
Accetta volontari sani
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Controlli sani (n = 74) abbinati quanto più possibile per età e sesso ai casi.
-Pazienti con cancro del colon-retto ( n = 74 ) dallo stadio I-III con i seguenti criteri:-
Descrizione
Criterio di inclusione:
- Nessuna predilezione sessuale.
- Età (25-65 anni).
- Carcinoma colorettale confermato dall'esame istopatologico
Criteri di esclusione:
- -pazienti che hanno ricevuto qualsiasi trattamento.
- Casi con altri tumori d'organo.
- Storia di chemioterapia e radioterapia.
- Malattie sistemiche come insufficienza renale, diabete mellito e ipertensione.
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
- Modelli osservazionali: Caso di controllo
- Prospettive temporali: Trasversale
Coorti e interventi
Gruppo / Coorte |
Intervento / Trattamento |
|---|---|
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pazienti affetti da cancro del colon-retto
Pazienti con cancro del colon-retto ( n = 30 ) dallo stadio I-III con i seguenti criteri:- UN. Criterio di inclusione:
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Test diagnostico: PBMC ed espressione tissutale di HOTTIP, EIF4EBP1 e SNP HOTTIP rs1859168 nel siero
Campione di sangue fresco da 5 ml, tessuto normale e CRC
|
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Controlli sani (n = 30)
quanto più possibile abbinati per quanto riguarda età e sesso ai casi.
|
Test diagnostico: PBMC ed espressione tissutale di HOTTIP, EIF4EBP1 e SNP HOTTIP rs1859168 nel siero
Campione di sangue fresco da 5 ml, tessuto normale e CRC
|
Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
|---|---|---|
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Espressione genica HOTTIP
Lasso di tempo: 2 anni
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Stima del livello di espressione di HOTTIP nelle cellule mononucleari e nei tessuti del sangue periferico con l'obiettivo di utilizzare marcatori prognostici meno invasivi possibili per il cancro del colon-retto.
|
2 anni
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Misure di risultato secondarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
|---|---|---|
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EIF4EBP
Lasso di tempo: 2 anni
|
Stima del livello di espressione di EIF4EBP nelle cellule e nei tessuti mononucleari del sangue periferico
|
2 anni
|
Collaboratori e investigatori
Sponsor
Collaboratori
Investigatori
- Investigatore principale: Esraa H Mohamed, Master, Assistant lecturer of Medical Microbiology and Immunology
Pubblicazioni e link utili
Pubblicazioni generali
- Chisanga D, Keerthikumar S, Pathan M, Ariyaratne D, Kalra H, Boukouris S, Mathew NA, Al Saffar H, Gangoda L, Ang CS, Sieber OM, Mariadason JM, Dasgupta R, Chilamkurti N, Mathivanan S. Colorectal cancer atlas: An integrative resource for genomic and proteomic annotations from colorectal cancer cell lines and tissues. Nucleic Acids Res. 2016 Jan 4;44(D1):D969-74. doi: 10.1093/nar/gkv1097. Epub 2015 Oct 22.
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- Wang KC, Yang YW, Liu B, Sanyal A, Corces-Zimmerman R, Chen Y, Lajoie BR, Protacio A, Flynn RA, Gupta RA, Wysocka J, Lei M, Dekker J, Helms JA, Chang HY. A long noncoding RNA maintains active chromatin to coordinate homeotic gene expression. Nature. 2011 Apr 7;472(7341):120-4. doi: 10.1038/nature09819. Epub 2011 Mar 20.
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- Shang A, Wang W, Gu C, Chen C, Zeng B, Yang Y, Ji P, Sun J, Wu J, Lu W, Sun Z, Li D. Correction to: Long non-coding RNA HOTTIP enhances IL-6 expression to potentiate immune escape of ovarian cancer cells by upregulating the expression of PD-L1 in neutrophils. J Exp Clin Cancer Res. 2020 Dec 4;39(1):272. doi: 10.1186/s13046-020-01755-z.
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Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo Inserito (Effettivo)
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Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
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Parole chiave
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Altri numeri di identificazione dello studio
- Esraa Hassan MD Protocol
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