Autofagiaan liittyvien geenien, LncRNA:n ja SNP:iden yhdistäminen kolorektaalisyövän kanssa Egyptin väestössä
- HOTTIP:n ja EIF4EBP1:n (eukaryoottisen translaation aloitustekijän 4E:tä sitovan proteiinin 1) seerumin ilmentymistason määrittäminen.
- SNP HOTTIP rs1859168:n ja sen yhteyden CRC-herkkyyteen tutkiminen.
- Interleukiini-6:n seerumitason määrittäminen ja sen suhde muihin tutkittuihin geeneihin.
- Näiden geenien ilmentymisen korrelaatio CRC:n eri vaiheiden kanssa kunkin niistä prognostisen arvon määrittämiseksi.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Ehdot
Yksityiskohtainen kuvaus
Kolorektaalisyöpä (CRC) on yleinen ruoansulatuskanavan kasvain 1. Se on kolmanneksi yleisin kuolinsyy maailmassa. Viiden vuoden kokonaiseloonjäämisaste on alle 40 %, ja esiintyvyys on nousussa 2. Ennuste ja hoito eivät kuitenkaan ole parantuneet merkittävästi. Siksi potilaiden oikea valinta aggressiivista hoitoa varten on välttämätöntä, uusia terapeuttisia ja prognostisia strategioita tarvitaan kiireesti 3.
Autofagia on itsesulatusreitti, jossa ei-toivotut sytoplasmiset komponentit kierrätetään 4.Normaaleissa olosuhteissa autofagia on välttämätön solujen homeostaasille 5. Autofagialla on kaksi roolia syöpäsoluissa, stimulaatio tai suppressio, ja sillä on vaikutuksia etenemiseen ja onkogeneesiin 6. Viimeaikaiset tutkimukset ovat osoittaneet, että autofagia on tärkeä kohde syövän hallinnassa kasvaimen vaiheesta ja tyypistä riippuen 7.Monimuotoiset molekyylimekanismit vaikuttavat syöpäsolujen vastustuskykyyn hoitoon 8. Näistä mekanismeista autofagia näyttää olevan kriittinen 9.
EIF4EBP1 (eukaryoottinen translaation aloitustekijä 4E:tä sitova proteiini 1) on EIF4EBP1-geenin koodaama. Se toimii efektorina mTOR-reitillä (rapamysiinin mammilian kohde), joka aktivoituessaan fosforyloituu edistäen solujen lisääntymistä 10. Tutkimukset ovat ehdottaneet, että EIF4EBP1 edistää karsinogeneesiä, kuten hepatosellulaarisessa karsinoomassa. Sen roolia CRC:ssä ei kuitenkaan ole selvitetty 10.
Pitkät ei-koodaavat RNA:t (lncRNA:t) ovat ryhmä RNA:ta, 200 nukleotidia ja pituus 11,. LncRNA:iden ilmentymistä on havaittu useissa kasvaimissa, jotka toimivat onkogeeneinä. "HOXA (hydrogenase transkription säätelevä proteiini) transkriptio distaalisessa kärjessä" (HOTTIP) on saanut huomiota viime aikoina. Se on ylössäädelty CRC-kudoksessa säätelemällä geenejä epigeneettisen modifikaation kautta. Siksi se voi olla ehdokas syövän muodostumiseen ja CRC 12:n hoitoon.
LncRNA:iden ilmentymiseen voivat vaikuttaa yksittäisen nukleotidin polymorfismit (SNP:t), jotka ovat yleisin geneettinen muunnelma ihmisen genomissa13. rs1859168 raportoitiin HOTTIP:n mahdollisena funktionaalisena polymorfismina, joka muuttaa sen ilmentymistasoa 14. Äskettäin raportoitiin myös, että HOTTIP tehostaa interleukiini 6:n ilmentymistä, mikä tehostaa syöpäsolujen immuunijärjestelmää 15.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Todellinen)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskelupaikat
-
-
-
Assiut, Egypti
- Assiut University
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Terveet kontrollit (n = 74) sopivat iän ja sukupuolen suhteen mahdollisimman hyvin tapauksiin.
- paksusuolen ja peräsuolen syöpäpotilaat (n = 74) vaiheesta I-III seuraavilla kriteereillä:
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Ei seksihalukkuutta.
- Ikä (25-65 vuotta).
- Kolorektaalinen karsinooma vahvistettu histopatologisella tutkimuksella
Poissulkemiskriteerit:
- -potilaat, jotka ovat saaneet mitään hoitoa.
- Tapaukset, joissa on muita elinten syöpiä.
- Kemoterapian ja sädehoidon historia.
- Systeemiset sairaudet, kuten munuaisten vajaatoiminta, diabetes mellitus ja verenpainetauti.
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Havaintomallit: Case-Control
- Aikanäkymät: Poikkileikkaus
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
paksusuolen syöpäpotilaat
Kolorektaalisyöpäpotilaat (n = 30) vaiheesta I-III seuraavilla kriteereillä: a. Sisällyttämiskriteerit:
|
5 ml tuoretta verinäytettä, normaalia ja CRC-kudosta
|
|
Terveet kontrollit (n = 30)
iän ja sukupuolen suhteen mahdollisimman hyvin tapauksiin.
|
5 ml tuoretta verinäytettä, normaalia ja CRC-kudosta
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
HOTTIP-geenin ilmentyminen
Aikaikkuna: 2 vuotta
|
Arvio HOTTIP:n ilmentymistasosta perifeerisen veren mononukleaarisissa soluissa ja kudoksissa tavoitteena käyttää mahdollisimman vähemmän invasiivisia prognostisia markkereita paksusuolen syöpää varten.
|
2 vuotta
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
EIF4EBP
Aikaikkuna: 2 vuotta
|
EIF4EBP:n ilmentymistason arviointi perifeerisen veren mononukleaarisissa soluissa ja kudoksissa
|
2 vuotta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Yhteistyökumppanit
Tutkijat
- Päätutkija: Esraa H Mohamed, Master, Assistant lecturer of Medical Microbiology and Immunology
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Yleiset julkaisut
- Chisanga D, Keerthikumar S, Pathan M, Ariyaratne D, Kalra H, Boukouris S, Mathew NA, Al Saffar H, Gangoda L, Ang CS, Sieber OM, Mariadason JM, Dasgupta R, Chilamkurti N, Mathivanan S. Colorectal cancer atlas: An integrative resource for genomic and proteomic annotations from colorectal cancer cell lines and tissues. Nucleic Acids Res. 2016 Jan 4;44(D1):D969-74. doi: 10.1093/nar/gkv1097. Epub 2015 Oct 22.
- Katheder NS, Khezri R, O'Farrell F, Schultz SW, Jain A, Rahman MM, Schink KO, Theodossiou TA, Johansen T, Juhasz G, Bilder D, Brech A, Stenmark H, Rusten TE. Microenvironmental autophagy promotes tumour growth. Nature. 2017 Jan 19;541(7637):417-420. doi: 10.1038/nature20815. Epub 2017 Jan 11.
- Rahman MA, Rhim H. Therapeutic implication of autophagy in neurodegenerative diseases. BMB Rep. 2017 Jul;50(7):345-354. doi: 10.5483/bmbrep.2017.50.7.069.
- Uddin MS, Stachowiak A, Mamun AA, Tzvetkov NT, Takeda S, Atanasov AG, Bergantin LB, Abdel-Daim MM, Stankiewicz AM. Autophagy and Alzheimer's Disease: From Molecular Mechanisms to Therapeutic Implications. Front Aging Neurosci. 2018 Jan 30;10:04. doi: 10.3389/fnagi.2018.00004. eCollection 2018.
- Avalos Y, Canales J, Bravo-Sagua R, Criollo A, Lavandero S, Quest AF. Tumor suppression and promotion by autophagy. Biomed Res Int. 2014;2014:603980. doi: 10.1155/2014/603980. Epub 2014 Sep 18.
- Abdullah LN, Chow EK. Mechanisms of chemoresistance in cancer stem cells. Clin Transl Med. 2013 Jan 17;2(1):3. doi: 10.1186/2001-1326-2-3.
- Ojha R, Bhattacharyya S, Singh SK. Autophagy in Cancer Stem Cells: A Potential Link Between Chemoresistance, Recurrence, and Metastasis. Biores Open Access. 2015 Jan 1;4(1):97-108. doi: 10.1089/biores.2014.0035. eCollection 2015.
- Cha YL, Li PD, Yuan LJ, Zhang MY, Zhang YJ, Rao HL, Zhang HZ, Zheng XF, Wang HY. EIF4EBP1 overexpression is associated with poor survival and disease progression in patients with hepatocellular carcinoma. PLoS One. 2015 Feb 6;10(2):e0117493. doi: 10.1371/journal.pone.0117493. eCollection 2015.
- Bonasio R, Shiekhattar R. Regulation of transcription by long noncoding RNAs. Annu Rev Genet. 2014;48:433-55. doi: 10.1146/annurev-genet-120213-092323. Epub 2014 Sep 18.
- Wang KC, Yang YW, Liu B, Sanyal A, Corces-Zimmerman R, Chen Y, Lajoie BR, Protacio A, Flynn RA, Gupta RA, Wysocka J, Lei M, Dekker J, Helms JA, Chang HY. A long noncoding RNA maintains active chromatin to coordinate homeotic gene expression. Nature. 2011 Apr 7;472(7341):120-4. doi: 10.1038/nature09819. Epub 2011 Mar 20.
- Lv Z, Xu Q, Yuan Y. A systematic review and meta-analysis of the association between long non-coding RNA polymorphisms and cancer risk. Mutat Res Rev Mutat Res. 2017 Jan-Mar;771:1-14. doi: 10.1016/j.mrrev.2016.10.002. Epub 2016 Nov 5.
- Hu P, Qiao O, Wang J, Li J, Jin H, Li Z, Jin Y. rs1859168 A > C polymorphism regulates HOTTIP expression and reduces risk of pancreatic cancer in a Chinese population. World J Surg Oncol. 2017 Aug 17;15(1):155. doi: 10.1186/s12957-017-1218-0.
- Shang A, Wang W, Gu C, Chen C, Zeng B, Yang Y, Ji P, Sun J, Wu J, Lu W, Sun Z, Li D. Correction to: Long non-coding RNA HOTTIP enhances IL-6 expression to potentiate immune escape of ovarian cancer cells by upregulating the expression of PD-L1 in neutrophils. J Exp Clin Cancer Res. 2020 Dec 4;39(1):272. doi: 10.1186/s13046-020-01755-z.
- Vorobiova OA. [Participation of the supraoptic nucleus of the anterior hypothalamus in controlling the gonadotropic functions of the pituitary]. Fiziol Zh. 1974 May-Jun;20(3):334-8. No abstract available. Ukrainian.
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Opintojen valmistuminen (Todellinen)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- Esraa Hassan MD Protocol
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
IPD-suunnitelman kuvaus
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Yhdysvalloissa valmistettu ja sieltä viety tuote
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .