Associatie van aan autofagie gerelateerde genen, LncRNA en SNP's met colorectale kanker bij de Egyptische bevolking
- Bepaling van serumexpressieniveau van HOTTIP en EIF4EBP1 (eukaryote translatie-initiatiefactor 4E-bindend eiwit 1).
- Onderzoek naar de SNP HOTTIP rs1859168 en de associatie met CRC-gevoeligheid.
- Bepaling van het serumgehalte van Interleukine -6 en de relatie met andere bestudeerde genen.
- Correlatie van de expressie van deze genen met verschillende stadia van CRC om de prognostische waarde van elk van hen te bepalen.
Studie Overzicht
Toestand
Conditie
Interventie / Behandeling
Gedetailleerde beschrijving
Colorectale kanker (CRC) is een veel voorkomende tumor in het spijsverteringskanaal 1. Het is de derde belangrijkste doodsoorzaak ter wereld. Het totale overlevingspercentage na 5 jaar is minder dan 40% en het aantal gevallen neemt toe 2. De prognose en therapie zijn echter niet significant verbeterd. Daarom is een goede selectie van patiënten voor agressieve behandeling noodzakelijk, nieuwe therapeutische en prognostische strategieën zijn dringend nodig 3.
Autofagie is een pad voor zelfvertering, waarbij ongewenste cytoplasmatische componenten worden gerecycled 4. Onder normale omstandigheden is autofagie essentieel voor cellulaire homeostase 5. Autofagie heeft een dubbele rol in kankercellen, stimulatie of onderdrukking, met effecten op progressie en oncogenese 6. Recent onderzoek heeft aangetoond dat autofagie een belangrijk doelwit is voor het beheersen van kanker, afhankelijk van het stadium en het type tumor 7. Diverse moleculaire mechanismen dragen bij aan de weerstand van kankercellen tegen behandeling 8. Onder deze mechanismen lijkt autofagie van cruciaal belang te zijn 9.
EIF4EBP1 (eukaryote translatie-initiatiefactor 4E-bindend eiwit 1) wordt gecodeerd door het EIF4EBP1-gen. Het werkt als een effector in de mTOR-route (zoogdierdoelwit van rapamycine) die bij activering EIF4EBP1 wordt gefosforyleerd en celproliferatie bevordert 10. Studies hebben gesuggereerd dat EIF4EBP1 carcinogenese bevordert, zoals bij hepatocellulair carcinoom. De rol ervan bij CRC is echter niet opgehelderd 10.
Lange niet-coderende RNA's (lncRNA's) zijn een groep RNA, 200 nucleotiden lang 11,. Expressie van lncRNA's is ontdekt in meerdere tumoren, die werken als oncogenen. 'HOXA (hydrogenase transcriptioneel regulerend eiwit) transcript aan de distale punt' (HOTTIP) heeft de laatste tijd aandacht gekregen. Het wordt opgereguleerd in CRC-weefsel en reguleert genen via epigenetische modificatie. Daarom zou het een kandidaat kunnen zijn voor kankervorming en therapie van CRC 12.
Expressie van lncRNA's kan worden beïnvloed door single nucleotide polymorphisms (SNP's), de meest voorkomende genetische variatie in menselijke genomen13. rs1859168 werd gemeld als een potentieel functioneel polymorfisme op HOTTIP dat zijn expressieniveau verandert 14. Ook werd onlangs gemeld dat HOTTIP de expressie van interleukine 6 verbetert, wat de immuunontsnapping van kankercellen versterkt 15.
Studietype
Inschrijving (Werkelijk)
Contacten en locaties
Studie Locaties
-
-
-
Assiut, Egypte
- Assiut University
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
Accepteert gezonde vrijwilligers
Bemonsteringsmethode
Studie Bevolking
Gezonde controles ( n = 74) kwamen qua leeftijd en geslacht zoveel mogelijk overeen met casussen.
-Darmkankerpatiënten (n = 74) van stadium I-III met de volgende criteria:-
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- Geen seksuele voorkeur.
- Leeftijd (25-65 jaar).
- Colorectaal carcinoom bevestigd door histopathologisch onderzoek
Uitsluitingscriteria:
- -patiënten die een behandeling hebben ondergaan.
- Gevallen met andere orgaankankers.
- Geschiedenis van chemotherapie en radiotherapie.
- Systemische ziekten zoals nierfalen, diabetes mellitus en hypertensie.
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
- Observatiemodellen: Case-control
- Tijdsperspectieven: Dwarsdoorsnede
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
patiënten met colorectale kanker
Patiënten met colorectale kanker ( n = 30 ) vanaf stadium I-III met de volgende criteria: - A. Inclusiecriteria:
|
5 ml vers bloedmonster, normaal en CRC-weefsel
|
|
Gezonde controles ( n = 30)
qua leeftijd en geslacht zoveel mogelijk afgestemd op de casussen.
|
5 ml vers bloedmonster, normaal en CRC-weefsel
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
HOTTIP-genexpressie
Tijdsspanne: 2 jaar
|
Schatting van het expressieniveau van HOTTIP in mononucleaire cellen en weefsel uit perifeer bloed, met als doel mogelijk minder invasieve prognostische markers voor colorectale kanker te gebruiken.
|
2 jaar
|
Secundaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
EIF4EBP
Tijdsspanne: 2 jaar
|
Schatting van het expressieniveau van EIF4EBP in mononucleaire cellen en weefsel uit perifeer bloed
|
2 jaar
|
Medewerkers en onderzoekers
Sponsor
Medewerkers
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: Esraa H Mohamed, Master, Assistant lecturer of Medical Microbiology and Immunology
Publicaties en nuttige links
Algemene publicaties
- Chisanga D, Keerthikumar S, Pathan M, Ariyaratne D, Kalra H, Boukouris S, Mathew NA, Al Saffar H, Gangoda L, Ang CS, Sieber OM, Mariadason JM, Dasgupta R, Chilamkurti N, Mathivanan S. Colorectal cancer atlas: An integrative resource for genomic and proteomic annotations from colorectal cancer cell lines and tissues. Nucleic Acids Res. 2016 Jan 4;44(D1):D969-74. doi: 10.1093/nar/gkv1097. Epub 2015 Oct 22.
- Katheder NS, Khezri R, O'Farrell F, Schultz SW, Jain A, Rahman MM, Schink KO, Theodossiou TA, Johansen T, Juhasz G, Bilder D, Brech A, Stenmark H, Rusten TE. Microenvironmental autophagy promotes tumour growth. Nature. 2017 Jan 19;541(7637):417-420. doi: 10.1038/nature20815. Epub 2017 Jan 11.
- Rahman MA, Rhim H. Therapeutic implication of autophagy in neurodegenerative diseases. BMB Rep. 2017 Jul;50(7):345-354. doi: 10.5483/bmbrep.2017.50.7.069.
- Uddin MS, Stachowiak A, Mamun AA, Tzvetkov NT, Takeda S, Atanasov AG, Bergantin LB, Abdel-Daim MM, Stankiewicz AM. Autophagy and Alzheimer's Disease: From Molecular Mechanisms to Therapeutic Implications. Front Aging Neurosci. 2018 Jan 30;10:04. doi: 10.3389/fnagi.2018.00004. eCollection 2018.
- Avalos Y, Canales J, Bravo-Sagua R, Criollo A, Lavandero S, Quest AF. Tumor suppression and promotion by autophagy. Biomed Res Int. 2014;2014:603980. doi: 10.1155/2014/603980. Epub 2014 Sep 18.
- Abdullah LN, Chow EK. Mechanisms of chemoresistance in cancer stem cells. Clin Transl Med. 2013 Jan 17;2(1):3. doi: 10.1186/2001-1326-2-3.
- Ojha R, Bhattacharyya S, Singh SK. Autophagy in Cancer Stem Cells: A Potential Link Between Chemoresistance, Recurrence, and Metastasis. Biores Open Access. 2015 Jan 1;4(1):97-108. doi: 10.1089/biores.2014.0035. eCollection 2015.
- Cha YL, Li PD, Yuan LJ, Zhang MY, Zhang YJ, Rao HL, Zhang HZ, Zheng XF, Wang HY. EIF4EBP1 overexpression is associated with poor survival and disease progression in patients with hepatocellular carcinoma. PLoS One. 2015 Feb 6;10(2):e0117493. doi: 10.1371/journal.pone.0117493. eCollection 2015.
- Bonasio R, Shiekhattar R. Regulation of transcription by long noncoding RNAs. Annu Rev Genet. 2014;48:433-55. doi: 10.1146/annurev-genet-120213-092323. Epub 2014 Sep 18.
- Wang KC, Yang YW, Liu B, Sanyal A, Corces-Zimmerman R, Chen Y, Lajoie BR, Protacio A, Flynn RA, Gupta RA, Wysocka J, Lei M, Dekker J, Helms JA, Chang HY. A long noncoding RNA maintains active chromatin to coordinate homeotic gene expression. Nature. 2011 Apr 7;472(7341):120-4. doi: 10.1038/nature09819. Epub 2011 Mar 20.
- Lv Z, Xu Q, Yuan Y. A systematic review and meta-analysis of the association between long non-coding RNA polymorphisms and cancer risk. Mutat Res Rev Mutat Res. 2017 Jan-Mar;771:1-14. doi: 10.1016/j.mrrev.2016.10.002. Epub 2016 Nov 5.
- Hu P, Qiao O, Wang J, Li J, Jin H, Li Z, Jin Y. rs1859168 A > C polymorphism regulates HOTTIP expression and reduces risk of pancreatic cancer in a Chinese population. World J Surg Oncol. 2017 Aug 17;15(1):155. doi: 10.1186/s12957-017-1218-0.
- Shang A, Wang W, Gu C, Chen C, Zeng B, Yang Y, Ji P, Sun J, Wu J, Lu W, Sun Z, Li D. Correction to: Long non-coding RNA HOTTIP enhances IL-6 expression to potentiate immune escape of ovarian cancer cells by upregulating the expression of PD-L1 in neutrophils. J Exp Clin Cancer Res. 2020 Dec 4;39(1):272. doi: 10.1186/s13046-020-01755-z.
- Vorobiova OA. [Participation of the supraoptic nucleus of the anterior hypothalamus in controlling the gonadotropic functions of the pituitary]. Fiziol Zh. 1974 May-Jun;20(3):334-8. No abstract available. Ukrainian.
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
Primaire voltooiing (Werkelijk)
Studie voltooiing (Werkelijk)
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Werkelijk)
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Trefwoorden
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- Esraa Hassan MD Protocol
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
Beschrijving IPD-plan
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
product vervaardigd in en geëxporteerd uit de V.S.
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .