Ассоциация генов, LncRNA и SNP, связанных с аутофагией, с колоректальным раком в египетской популяции

Колоректальный рак (КРР) является распространенной опухолью пищеварительного тракта 1. Это третья по значимости причина смерти в мире. Общая 5-летняя выживаемость составляет менее 40%, а заболеваемость растет 2. Однако прогноз и терапия существенно не улучшились. Поэтому необходим правильный отбор пациентов для агрессивного лечения, срочно необходимы новые терапевтические и прогностические стратегии 3.

Аутофагия — это путь самопереваривания, при котором рециркулируются нежелательные цитоплазматические компоненты. 4. В нормальных условиях аутофагия необходима для клеточного гомеостаза. Недавние исследования установили, что аутофагия является важной мишенью для борьбы с раком в зависимости от стадии и типа опухоли. 7. Различные молекулярные механизмы способствуют устойчивости раковых клеток к лечению. 8. Среди этих механизмов аутофагия, по-видимому, имеет решающее значение.

EIF4EBP1 (эукариотический фактор инициации трансляции 4E-связывающий белок 1) кодируется геном EIF4EBP1. Он действует как эффектор в пути mTOR (мишень рапамицина у млекопитающих), который при активации фосфорилируется EIF4EBP1, способствуя пролиферации клеток 10. Исследования показали, что EIF4EBP1 способствует канцерогенезу, как и при гепатоцеллюлярной карциноме. Однако его роль в CRC не выяснена 10.

Длинные некодирующие РНК (днРНК) представляют собой группу РНК, состоящую из 11 нуклеотидов длиной 200 нуклеотидов. Экспрессия lncRNAs была обнаружена во многих опухолях, действующих как онкогены. «Транскрипт HOXA (гидрогеназный транскрипционный регуляторный белок) на дистальном кончике» (HOTTIP) недавно привлек внимание. Он активируется в ткани CRC, регулируя гены посредством эпигенетической модификации. Следовательно, он может быть кандидатом на канцеризацию и терапию CRC 12.

На экспрессию lncRNAs могут влиять однонуклеотидные полиморфизмы (SNP), наиболее распространенные генетические вариации в геномах человека13. rs1859168 был описан как потенциальный функциональный полиморфизм на HOTTIP, который изменяет уровень его экспрессии 14. Кроме того, недавно сообщалось, что HOTTIP усиливает экспрессию интерлейкина 6, что усиливает иммунный уход раковых клеток 15.