Přesný objektivní automatizovaný hodnotící systém poruchy autistického spektra ze stávající velké kohorty

Porucha autistického spektra (ASD) je běžná vysoce dědičná neurovývojová porucha s vysokou genetickou a klinickou heterogenitou. Vzhledem k vysoké prevalenci, dlouhodobému postižení, nejasné etiologii a nedostatku účinné detekce, prevence a biologické léčby této poruchy byla tato katastrofická porucha upřednostněna pro molekulárně genetický výzkum a výzkum mozku. Hlavní PI Gau vytvořil kohortu více než 900 probandů ASD a jejich rodin s klinickými, neuropsychologickými, obrazovými a genetickými daty. S pokrokem v oblasti digitálního zdraví si tento integrovaný projekt klade za cíl vyvinout a potenciálně komercializovat objektivní, automatizovaný hodnotící systém pro včasnou diagnostiku ASD založený na klinické, behaviorální, neuropsychologické, neurozobrazovací, genetické (celoexomové sekvenování, WES), metabolomice a mikrobiomická data probandů s ASD a typicky vyvíjející se kontroly (TDC) bez ASD

Tento 3letý projekt 5 dílčích projektů (SP) je založen na existující velké kohortě > 900 probandů ASD a jejich rodin s vysoce kvalitními genetickými daty, klinickými diagnózami, symptomy, psychopatologií, sociálními funkcemi, neuropsychologickými funkcemi (n= 600 pro CPT, 300 pro CANTAB) a strukturální a funkční snímky (n=196), data. Kvůli omezenému rozpočtu vybere SP1 pro tento integrovaný projekt pouze 360 ​​ASD (ve věku 4–25 let) a 90 TDC. SP1 zkontroluje kvalitu a přítomnost dat a poté znovu shromáždí DNA 100 ASD, data MRI 205 ASD (360-196=164, 164/0,8 (úspěšné) četnost)=205) a CANTAB 60 ASD, abychom měli úplný soubor údajů o klinických/fenotypových/neurokogničních/obrazových měřeních. SP1 připraví DNA pro analýzy WES SP2; a odebere sérum a stolici 360 ASD a 90 TDC a poskytne tyto vzorky SP3 a SP4 pro metabolomické a mikrobiomické analýzy. Všechna shromážděná data a výsledky generované z SP1-4 budou uloženy a spravovány v ASD bance (SP1, hlavní PI) a analyzovány SP5 pomocí strojového učení AI k vývoji přesné objektivní platformy automatického hodnocení pro ASD. Témata pěti podprojektů:

Podprojekt 1. Stanovení standardního postupu pro sběr dat a klinicko-biologickou banku poruch autistického spektra včetně klinických, behaviorálních, kognitivních, neurozobrazovacích, genetických a biologických dat Podprojekt 2. Dešifrování genetické příčiny u poruch autistického spektra pomocí sekvenování celého exomu Podprojekt 3. Metabolomické zkoumání poruch autistického spektra podprojekt 4. Střevní mikroflóra a výsledek onemocnění u dětí s poruchou autistického spektra podprojekt 5. Počítačový hodnotící systém z genomu, střeva-mozku a metabolických mechanismů