Exakt objektivt automatiserat bedömningssystem för autismspektrumstörning från en befintlig stor kohort

Autismspektrumstörning (ASD) är en vanlig mycket ärftlig neuroutvecklingsstörning med hög genetisk och klinisk heterogenitet. På grund av dess höga förekomst, långvariga funktionsnedsättningar, oklara etiologier och bristen på effektiv upptäckt, förebyggande och biologisk behandling av denna sjukdom har denna katastrofala störning prioriterats för molekylärgenetisk forskning och hjärnforskning. Den huvudsakliga PI Gau har etablerat en kohort av mer än 900 ASD probands och deras familjer med kliniska, neuropsykologiska, bild och genetiska data. Med framsteg inom siffror hälsa, syftar detta integrerade projekt till att utveckla och potentiellt kommersialisera ett objektivt, automatiserat bedömningssystem för tidig diagnos av ASD baserat på klinisk, beteendemässig, neuropsykologisk, neuroimaging, genetisk (hel exomesekvensering, WES), metabolomik och mikrobiomikdata för proband med ASD och typiskt utvecklande kontroller (TDC) utan ASD

Detta 3-åriga, 5 delprojekt (SP)-projekt är baserat på en befintlig stor kohort av > 900 ASD-proband och deras familjer med högkvalitativ genetisk data, kliniska diagnoser, symtom, psykopatologi, sociala funktioner, neuropsykologiska funktioner (n= 600 för CPT, 300 för CANTAB), och strukturella och funktionella bilder (n=196), data. På grund av en begränsad budget kommer SP1 endast att välja 360 ASD (åldrar 4-25 år) och 90 TDC för detta integrerade projekt. SP1 kommer att kontrollera kvaliteten och närvaron av data följt av att samla in DNA:n på 100 ASD, MRI-data på 205 ASD (360-196=164, 164/0,8 (framgångsrik) rate)=205), och CANTAB på 60 ASD för att ha en komplett datauppsättning av kliniska/fenotyp/neurokognitions/bildmått. SP1 kommer att förbereda DNA för SP2:s WES-analyser; och kommer att samla in serum och avföring av 360 ASD och 90 TDC och tillhandahålla dessa prover till SP3 och SP4 för metabolomik respektive mikrobiomikanalys. All data som samlas in och resultat som genereras från SP1-4 kommer att sparas och hanteras i ASD-banken (SP1, huvud-PI) och analyseras av SP5 med hjälp av AI-maskininlärning för att utveckla den exakta objektiva automatiska bedömningsplattformen för ASD. Ämnen för de fem delprojekten:

Delprojekt 1. Fastställande av standardproceduren för datainsamling och klinisk-biologisk bank av autismspektrumstörning inklusive kliniska, beteendemässiga, kognitiva, neuroimaging, genetiska och biologiska data. Delprojekt 2. Dechiffrera genetisk orsak vid autistisk spektrumstörning med hjälp av hel exomsekvensering Delprojekt 3. Metabolomisk utredning av autismspektrumstörning Delprojekt 4. Tarmmikrobiota och sjukdomsutfall hos barn med autismspektrumstörning Delprojekt 5. Ett datoriserat bedömningssystem från genom, tarm-hjärna och metabola mekanismer