Præcis objektivt automatiseret vurderingssystem for autismespektrumforstyrrelser fra en eksisterende stor kohorte

Autismespektrumforstyrrelse (ASD) er en almindelig meget arvelig neuroudviklingslidelse med høj genetisk og klinisk heterogenitet. På grund af dens høje udbredelse, langvarige svækkelse, uklare ætiologier og mangel på effektiv påvisning, forebyggelse og biologisk behandling af denne lidelse, er denne katastrofale lidelse blevet prioriteret til molekylærgenetisk forskning og hjerneforskning. Den primære PI Gau har etableret en kohorte af mere end 900 ASD probands og deres familier med kliniske, neuropsykologiske, billed- og genetiske data. Med fremskridtene inden for ciffersundhed har dette integrerede projekt til formål at udvikle og potentielt kommercialisere et objektivt, automatiseret vurderingssystem til tidlig diagnose af ASD baseret på klinisk, adfærdsmæssig, neuropsykologisk, neuroimaging, genetisk (whole exome sequencing, WES), metabolomics og mikrobiomikdata for probander med ASD og typisk udviklende kontroller (TDC) uden ASD

Dette 3-årige, 5 delprojekter (SP) projekt er baseret på en eksisterende stor kohorte på > 900 ASD probands og deres familier med genetiske data af høj kvalitet, kliniske diagnoser, symptomer, psykopatologi, sociale funktioner, neuropsykologiske funktioner (n= 600 for CPT, 300 for CANTAB), og strukturelle og funktionelle billeder (n=196), data. På grund af et begrænset budget vil SP1 kun vælge 360 ​​ASD (aldre 4-25 år) og 90 TDC til dette integrerede projekt. SP1 vil kontrollere kvaliteten og tilstedeværelsen af ​​dataene efterfulgt af genindsamling af DNA'er på 100 ASD, MR-data på 205 ASD (360-196=164, 164/0,8(vellykket) rate)=205) og CANTAB på 60 ASD for at have et komplet datasæt af kliniske/fænotype/neurokognitions-/billedemål. SP1 vil forberede DNA'er til SP2's WES-analyser; og vil indsamle serum og afføring af 360 ASD og 90 TDC og levere disse prøver til SP3 og SP4 til henholdsvis metabolomiske og mikrobiotiske analyser. Alle de indsamlede data og resultater genereret fra SP1-4 vil blive gemt og administreret i ASD-banken (SP1, hoved-PI) og analyseret af SP5 ved hjælp af AI-maskinlæring for at udvikle den præcise objektive automatiske vurderingsplatform for ASD. Emnerne for de fem delprojekter:

Delprojekt 1. Etablering af standardproceduren for dataindsamling og klinisk-biologisk bank af autismespektrumforstyrrelser inklusive kliniske, adfærdsmæssige, kognitive, neuroimaging, genetiske og biologiske data. Delprojekt 2. Dechiffrering af genetisk årsag ved autistisk spektrumforstyrrelse ved hjælp af hel exome-sekventering Delprojekt 3. Metabolomisk undersøgelse af autismespektrumforstyrrelse Delprojekt 4. Tarmmikrobiota og sygdomsudfald hos børn med autismespektrumforstyrrelse Delprojekt 5. Et computerstyret vurderingssystem fra genom, tarm-hjerne og metaboliske mekanismer