Sistema de Avaliação Automatizada Objetiva e Precisa do Transtorno do Espectro do Autismo de uma Grande Coorte Existente

O transtorno do espectro do autismo (TEA) é um transtorno do neurodesenvolvimento altamente hereditário comum com alta heterogeneidade genética e clínica. Devido à sua alta prevalência, comprometimento a longo prazo, etiologias incertas e falta de detecção, prevenção e tratamento biológico eficazes para esse distúrbio, esse distúrbio catastrófico foi priorizado para pesquisas genéticas moleculares e cerebrais. O principal PI Gau estabeleceu uma coorte de mais de 900 probandos de TEA e suas famílias com dados clínicos, neuropsicológicos, de imagem e genéticos. Com o avanço da saúde digital, este projeto integrado visa desenvolver e potencialmente comercializar um sistema de avaliação objetivo e automatizado para o diagnóstico precoce de TEA com base em critérios clínicos, comportamentais, neuropsicológicos, de neuroimagem, genéticos (sequenciamento completo do exoma, WES), metabolômicos e dados microbiômicos de probandos com TEA e controles com desenvolvimento típico (TDC) sem TEA

Este projeto de 3 anos e 5 subprojetos (SP) é baseado em uma grande coorte existente de > 900 probandos de TEA e suas famílias com dados genéticos de alta qualidade, diagnósticos clínicos, sintomas, psicopatologia, funções sociais, funções neuropsicológicas (n = 600 para CPT, 300 para CANTAB) e imagens estruturais e funcionais (n=196), dados. Devido a um orçamento limitado, o SP1 selecionará apenas 360 ASD (idades de 4 a 25 anos) e 90 TDC para este projeto integrado. O SP1 verificará a qualidade e a presença dos dados seguidos pela coleta de DNAs de 100 ASD, dados de ressonância magnética de 205 ASD (360-196 = 164, 164/0,8 (com sucesso rate) = 205) e CANTAB de 60 ASD para ter um conjunto de dados completo de medidas clínicas/fenótipo/neurocognição/imagem. O SP1 preparará DNAs para as análises WES do SP2; e coletará soro e fezes de 360 ​​ASD e 90 TDC e fornecerá essas amostras para SP3 e SP4 para análises metabolômicas e microbiômicas, respectivamente. Todos os dados coletados e resultados gerados no SP1-4 serão salvos e gerenciados no banco ASD (SP1, PI principal) e analisados ​​pelo SP5 usando aprendizado de máquina de IA para desenvolver a plataforma de avaliação automática objetiva precisa para ASD. Os tópicos dos cinco subprojetos:

Subprojeto 1. Estabelecer o procedimento padrão para coleta de dados e banco clínico-biológico do transtorno do espectro autista, incluindo dados clínicos, comportamentais, cognitivos, de neuroimagem, genéticos e biológicos. Investigação metabolômica do transtorno do espectro autista Subprojeto 4. Microbiota intestinal e evolução da doença em crianças com transtorno do espectro autista Subprojeto 5. Um sistema computadorizado de avaliação do genoma, intestino-cérebro e mecanismos metabólicos