Système d'évaluation automatisé objectif précis des troubles du spectre autistique à partir d'une grande cohorte existante

Le trouble du spectre autistique (TSA) est un trouble neurodéveloppemental commun hautement héréditaire avec une grande hétérogénéité génétique et clinique. En raison de sa prévalence élevée, de ses déficiences à long terme, de ses étiologies peu claires et de l'absence de détection, de prévention et de traitement biologique efficaces pour ce trouble, ce trouble catastrophique a été priorisé pour la recherche en génétique moléculaire et sur le cerveau. Le principal PI Gau a établi une cohorte de plus de 900 proposants TSA et leurs familles avec des données cliniques, neuropsychologiques, d'image et génétiques. Avec l'avancée de la santé numérique, ce projet intégré vise à développer et potentiellement commercialiser un système d'évaluation objectif et automatisé pour le diagnostic précoce des TSA basé sur les critères cliniques, comportementaux, neuropsychologiques, neuro-imagerie, génétiques (séquençage de l'exome entier, WES), métabolomique et données microbiomiques des proposants atteints de TSA et des témoins en développement typique (TDC) sans TSA

Ce projet de 3 ans et 5 sous-projets (SP) est basé sur une grande cohorte existante de > 900 proposants TSA et leurs familles avec des données génétiques de haute qualité, des diagnostics cliniques, des symptômes, une psychopathologie, des fonctions sociales, des fonctions neuropsychologiques (n = 600 pour CPT, 300 pour CANTAB), et images structurelles et fonctionnelles (n=196), données. En raison d'un budget limité, SP1 ne sélectionnera que 360 ​​ASD (âgés de 4 à 25 ans) et 90 TDC pour ce projet intégré. SP1 vérifiera la qualité et la présence des données suivies par le rappel des ADN de 100 ASD, des données IRM de 205 ASD (360-196 = 164, 164/0,8 (réussite rate)=205), et CANTAB de 60 ASD pour avoir un ensemble de données complet de mesures cliniques/phénotype/neurocognition/image. SP1 préparera les ADN pour les analyses WES de SP2 ; et recueillera le sérum et les selles de 360 ​​ASD et 90 TDC et fournira ces échantillons à SP3 et SP4 pour des analyses métabolomiques et microbiomiques, respectivement. Toutes les données collectées et les résultats générés à partir de SP1-4 seront enregistrés et gérés dans la banque ASD (SP1, principal PI) et analysés par SP5 à l'aide de l'apprentissage automatique de l'IA pour développer la plate-forme d'évaluation automatique objective précise pour ASD. Les thèmes des cinq sous-projets :

Sous-projet 1. Établir la procédure standard pour la collecte de données et la banque clinico-biologique des troubles du spectre autistique, y compris les données cliniques, comportementales, cognitives, neuro-imagerie, génétiques et biologiques Sous-projet 2. Déchiffrer la cause génétique dans les troubles du spectre autistique à l'aide du séquençage de l'exome entier Enquête métabolomique sur les troubles du spectre autistique Sous-projet 4. Microbiote intestinal et évolution de la maladie chez les enfants atteints de troubles du spectre autistique Sous-projet 5. Un système d'évaluation informatisé du génome, du cerveau intestinal et des mécanismes métaboliques