Nauwkeurig objectief geautomatiseerd beoordelingssysteem van autismespectrumstoornis van een bestaand groot cohort

Autismespectrumstoornis (ASS) is een veel voorkomende, zeer erfelijke neurologische ontwikkelingsstoornis met een hoge genetische en klinische heterogeniteit. Vanwege de hoge prevalentie, langdurige stoornissen, onduidelijke etiologieën en een gebrek aan effectieve detectie, preventie en biologische behandeling van deze aandoening, heeft deze catastrofale aandoening prioriteit gekregen voor moleculair genetisch onderzoek en hersenonderzoek. De belangrijkste PI Gau heeft een cohort samengesteld van meer dan 900 ASS-probands en hun families met klinische, neuropsychologische, beeld- en genetische gegevens. Met de vooruitgang op het gebied van digitale gezondheid, heeft dit geïntegreerde project tot doel een objectief, geautomatiseerd beoordelingssysteem voor vroege diagnose van ASS te ontwikkelen en mogelijk te commercialiseren op basis van de klinische, gedrags-, neuropsychologische, neuroimaging, genetische (whole exome sequencing, WES), metabolomics en microbiomische gegevens van probands met ASS en typisch ontwikkelende controles (TDC) zonder ASS

Dit 3-jarige project met 5 subprojecten (SP) is gebaseerd op een bestaand groot cohort van > 900 ASS-probands en hun families met hoogwaardige genetische gegevens, klinische diagnoses, symptomen, psychopathologie, sociale functies, neuropsychologische functies (n= 600 voor CPT, 300 voor CANTAB), en structurele en functionele afbeeldingen (n=196), gegevens. Vanwege een beperkt budget selecteert SP1 slechts 360 ASD (4-25 jaar oud) en 90 TDC voor dit geïntegreerde project. SP1 controleert de kwaliteit en aanwezigheid van de gegevens, gevolgd door het verzamelen van DNA's van 100 ASS, MRI-gegevens van 205 ASS (360-196=164, 164/0,8 (succesvol frequentie)=205), en CANTAB van 60 ASS om een ​​complete dataset van klinische/fenotype/neurocognitie/beeldmetingen te hebben. SP1 zal DNA's voorbereiden voor de WES-analyses van SP2; en verzamelt serum en ontlasting van 360 ASD en 90 TDC en levert deze monsters aan SP3 en SP4 voor respectievelijk metabolomics- en microbiomics-analyses. Alle verzamelde gegevens en gegenereerde resultaten van SP1-4 worden opgeslagen en beheerd in de ASD-bank (SP1, hoofd-PI) en geanalyseerd door SP5 met behulp van AI-machine learning om het precieze objectieve automatische beoordelingsplatform voor ASS te ontwikkelen. De onderwerpen van de vijf deelprojecten:

Deelproject 1. Vaststellen van de standaardprocedure voor gegevensverzameling en klinisch-biologische bank van autismespectrumstoornis inclusief klinische, gedrags-, cognitieve, neuroimaging, genetische en biologische gegevens Deelproject 2. Ontcijferen van genetische oorzaak bij autistische spectrumstoornis met behulp van hele exome-sequencing Deelproject 3. Metabolomica-onderzoek naar autismespectrumstoornis Deelproject 4. Intestinale microbiota en ziekte-uitkomst bij kinderen met een autismespectrumstoornis Deelproject 5. Een geautomatiseerd beoordelingssysteem van genoom-, darm-hersen- en metabole mechanismen