Preciso sistema di valutazione automatizzata oggettiva del disturbo dello spettro autistico da una grande coorte esistente

Il disturbo dello spettro autistico (ASD) è un comune disturbo dello sviluppo neurologico altamente ereditabile con elevata eterogeneità genetica e clinica. A causa della sua elevata prevalenza, compromissione a lungo termine, eziologie poco chiare e mancanza di un rilevamento, prevenzione e trattamento biologico efficaci per questo disturbo, questo disturbo catastrofico è stato considerato prioritario per la genetica molecolare e la ricerca sul cervello. Il principale PI Gau ha stabilito una coorte di oltre 900 probandi ASD e le loro famiglie con dati clinici, neuropsicologici, di immagine e genetici. Con l'avanzamento della salute delle cifre, questo progetto integrato mira a sviluppare e potenzialmente commercializzare un sistema di valutazione oggettivo e automatizzato per la diagnosi precoce dell'ASD basato su dati clinici, comportamentali, neuropsicologici, di neuroimaging, genetici (sequenziamento dell'intero esoma, WES), metabolomica e dati microbiomici di probandi con ASD e controlli a sviluppo tipico (TDC) senza ASD

Questo progetto di 3 anni e 5 sottoprogetti (SP) si basa su un'ampia coorte esistente di > 900 probandi ASD e le loro famiglie con dati genetici, diagnosi cliniche, sintomi, psicopatologia, funzioni sociali, funzioni neuropsicologiche di alta qualità (n= 600 per CPT, 300 per CANTAB), e immagini strutturali e funzionali (n=196), dati. A causa di un budget limitato, SP1 selezionerà solo 360 ASD (età 4-25 anni) e 90 TDC per questo progetto integrato. SP1 verificherà la qualità e la presenza dei dati, seguiti dalla raccolta dei DNA di 100 ASD, dei dati MRI di 205 ASD (360-196=164, 164/0.8 (successo rate)=205) e CANTAB di 60 ASD per avere un set di dati completo di misure cliniche/fenotipo/neurocognitivo/immagine. SP1 preparerà i DNA per le analisi WES di SP2; e raccoglierà siero e feci di 360 ASD e 90 TDC e fornirà questi campioni a SP3 e SP4 per le analisi metabolomiche e microbiomiche, rispettivamente. Tutti i dati raccolti e i risultati generati da SP1-4 saranno salvati e gestiti nella banca ASD (SP1, PI principale) e analizzati da SP5 utilizzando l'apprendimento automatico AI per sviluppare la precisa piattaforma di valutazione automatica oggettiva per ASD. I temi dei cinque sottoprogetti:

Sottoprogetto 1. Stabilire la procedura standard per la raccolta dei dati e la banca clinico-biologica del disturbo dello spettro autistico inclusi dati clinici, comportamentali, cognitivi, di neuroimaging, genetici e biologici Sottoprogetto 2. Decifrare la causa genetica nel disturbo dello spettro autistico utilizzando il sequenziamento dell'intero esoma Sottoprogetto 3. Indagine sulla metabolomica del disturbo dello spettro autistico Sottoprogetto 4. Microbiota intestinale ed esiti della malattia nei bambini con disturbo dello spettro autistico Sottoprogetto 5. Un sistema di valutazione computerizzato da genoma, intestino-cervello e meccanismi metabolici