Aplikace sekvenování nanoporů u nově diagnostikovaných pacientů s akutní myeloidní leukémií s infekcí krevního řečiště

Pacienti s akutní myeloidní leukémií (AML) jsou náchylní k infekci krevního řečiště (BSI) v důsledku útlumu kostní dřeně, orální a gastrointestinální mukozitidy, endovaskulárních trubic a aplikace velkého množství širokospektrých antibiotik. Související úmrtnost je až 7,1 % - 42 %. Užívání antibiotik do jedné hodiny po prvním pozorování hypotenzních příznaků může zaručit 79,9% míru přežití. Za každou hodinu zpoždění poklesne míra přežití pacienta o 7,6 %. V současné době je cyklus hemokulturních testů dlouhý a míra pozitivity je nízká. Jiné indikátory související s infekcí (PCT, CRP) nebo sekvenování nové generace nejsou vysoce specifické a lze je snadno chybně diagnostikovat. RTG, CT a další vyšetření mají pro infikované místo jen určitou pomocnou hodnotu. Potřebujeme nové diagnostické nástroje k přesné identifikaci patogenů. Nano-seq je sekvenační technologie nové generace pro sekvenování a analýzu jedné molekuly v reálném čase. Díky ultra dlouhé délce čtení sekvenování může rychle a přesně identifikovat typy patogenů BSI a poskytnout vhodné výsledky citlivosti na léky na základě genů rezistence na léky, aby vyhovovaly potřebám 99,9% screeningu patogenů. Zároveň doufáme, že provedeme prospektivní hodnocení zaměřené na vysoce rizikové skupiny AML náchylné k BSI v rané fázi. Střevo je největším imunitním orgánem těla a největším rezervoárem mikrobiálních patogenů. Expanze určité střevní mikroflóry obvykle předchází BSI. Pokud existuje korelace mezi střevní mikroflórou a MDR-BSI, kolonizace a změny střevní flóry mohou být použity k predikci rizika BSI u pacientů během léčby a preventivní opatření, jako je včasná dekolonizace nebo biologická intervence, sníží riziko infekce v budoucnu. V kombinaci s Nano-seq a různými stávajícími technologiemi detekce klinických patogenů ke snížení výskytu a progrese klinické BSI.