Anvendelse av Nanopore-sekvensering hos nylig diagnostiserte pasienter med akutt myeloid leukemi med blodstrømsinfeksjon

Pasienter med akutt myeloid leukemi (AML) er utsatt for blodstrøminfeksjon (BSI) på grunn av benmargssuppresjon, oral og gastrointestinal mukositt, endovaskulære rør og bruk av et stort antall bredspektrede antibiotika. Den tilhørende dødeligheten er så høy som 7,1 %-42 %. Bruk av antibiotika innen en time etter første observasjon av hypotensive symptomer kan garantere en overlevelsesrate på 79,9 %. For hver time med forsinkelse vil pasientens overlevelsesrate synke med 7,6 %. For tiden er blodkulturtestsyklusen lang og den positive raten er lav. Andre infeksjonsrelaterte indikatorer (PCT, CRP) eller neste generasjons sekvensering er ikke særlig spesifikke og lett å bli feildiagnostisert. Røntgen, CT og andre undersøkelser har kun en viss hjelpeverdi for det infiserte stedet. Vi trenger nye diagnostiske verktøy for nøyaktig å identifisere patogener. Nano-seq er en neste generasjons sekvenseringsteknologi for enkeltmolekyler, sanntidssekvensering og analyse. Med ultralang leselengde for sekvensering kan den raskt og nøyaktig identifisere BSI-patogentyper og gi passende medikamentfølsomhetsresultater basert på medikamentresistensgener for å møte behovene til 99,9 % patogenscreening. Samtidig håper vi å gjennomføre en prospektiv evaluering for å målrette mot høyrisikogrupper av AML utsatt for BSI på et tidlig stadium. Tarmen er kroppens største immunorgan og det største reservoaret av mikrobielle patogener. Utvidelsen av visse tarmmikrobiota går vanligvis foran BSI. Hvis det er en sammenheng mellom tarmmikrobiota og MDR-BSI, kan koloniseringen og endringene i tarmfloraen brukes til å forutsi risikoen for BSI hos pasienter under behandling, og forebyggende tiltak som tidlig avkolonisering eller biologisk intervensjon vil redusere risikoen. infeksjon i fremtiden. Kombinert med Nano-seq og ulike eksisterende teknologier for klinisk patogendeteksjon for å redusere forekomst og fremgang av klinisk BSI.