Application du séquençage des nanopores chez les patients nouvellement diagnostiqués atteints de leucémie myéloïde aiguë et présentant une bactériémie

Les patients atteints de leucémie myéloïde aiguë (LMA) sont sujets aux infections du sang (BSI) en raison de la suppression de la moelle osseuse, de la mucosite buccale et gastro-intestinale, des tubes endovasculaires et de l'application d'un grand nombre d'antibiotiques à large spectre. Le taux de mortalité associé est aussi élevé que 7,1 %-42 %. L'utilisation d'antibiotiques dans l'heure qui suit la première observation de symptômes hypotenseurs peut garantir un taux de survie de 79,9 %. Pour chaque heure de retard, le taux de survie du patient chutera de 7,6 %. À l'heure actuelle, le cycle de test d'hémoculture est long et le taux de positivité est faible. D'autres indicateurs liés à l'infection (PCT, CRP) ou le séquençage de nouvelle génération ne sont pas très spécifiques et faciles à mal diagnostiquer. La radiographie, la tomodensitométrie et d'autres examens n'ont qu'une certaine valeur auxiliaire pour le site infecté. Nous avons besoin de nouveaux outils de diagnostic pour identifier avec précision les agents pathogènes. Nano-seq est une technologie de séquençage de nouvelle génération pour le séquençage et l'analyse de molécules uniques en temps réel. Avec une longueur de lecture de séquençage ultra-longue, il peut identifier rapidement et avec précision les types d'agents pathogènes BSI et donner des résultats de sensibilité aux médicaments appropriés basés sur les gènes de résistance aux médicaments pour répondre aux besoins de dépistage d'agents pathogènes à 99,9 %. Dans le même temps, nous espérons mener une évaluation prospective pour cibler les groupes à haut risque d'AML sujets aux BSI au stade précoce. L'intestin est le plus grand organe immunitaire du corps et le plus grand réservoir d'agents pathogènes microbiens. L'expansion de certains microbiotes intestinaux précède généralement la BSI. S'il existe une corrélation entre le microbiote intestinal et la MDR-BSI, la colonisation et les modifications de la flore intestinale peuvent être utilisées pour prédire le risque de BSI chez les patients pendant le traitement, et des mesures préventives telles qu'une décolonisation précoce ou une intervention biologique réduiront le risque d'infection à l'avenir. Combiné avec Nano-seq et diverses technologies de détection d'agents pathogènes cliniques existantes pour réduire l'apparition et la progression des BSI cliniques.