Projekt FLORA: Hledání mikrobiální příčiny chronické endometritidy a nejvhodnější léčby k získání úspěšného těhotenství IVF/ICSI (FLORA)

Chronická endometritida je zánětlivý stav endometria. Tento zánět může negativně ovlivnit plodnost a těhotenství. Patologie je často (+-10 %) pozorována u žen s problémy s plodností. Dnes není diagnóza chronické endometritidy zřejmá, protože nejsou k dispozici žádné dobře validované klasifikační škály. V UZ Brusel patologické oddělení používá vlastní interní skórovací systém založený na přítomnosti a poloze plazmatických buněk v histologických snímcích.

Navzdory zatím omezenému výzkumu se nedávno ukázalo, že endometrium je kolonizováno mikroorganismy (mikrobiom). Stále však není jasné, jakou roli tyto mikroorganismy hrají při chronické endometritidě a problémech s plodností. Chronická endometritida je často diagnostikována v souvislosti s problémy s plodností a pacientka je léčena „naslepo“ širokospektrými antibiotiky, jako je doxycyklin. Širokospektrá antibiotika v našem těle zbytečně likvidují řadu mikroorganismů, včetně těch, které pozitivně ovlivňují implantaci. Přesná příčina chronické endometritidy není známa, takže léčba zůstává empirická. Výzkum a znalosti v endometriálním mikrobiomu se neustále rozšiřují, zejména díky vzestupu výzkumu vazeb mezi patologií a lidskou mikrobiotou. Je stále jasnější, že složení mikrobiomu může hrát zásadní roli ve zdraví a nemoci. Pokud jde o vliv endometriálního mikrobiomu na různé patologické stavy, jako je chronická endometritida a selhání implantace nebo potrat, stále neexistuje konsensus. Navzdory četným studiím o endometriálním mikrobiomu zatím nejsme schopni definovat normální nebo zdravý endometriální mikrobiom.

V tomto projektu chceme na základě různých technik získat náhled na mikroorganismy, které se vyskytují v ženském reprodukčním traktu. Analýzy budou provedeny na endometriální biopsii a vaginálním výtěru. Biopsie se rutinně odebírá na bruselském IVF pro detekci plazmatických buněk v anatomické patologické laboratoři pro diagnostiku chronické endometritidy. V mikrobiologické laboratoři budeme zkoumat, které mikroorganismy jsou přítomny v ženském reprodukčním traktu s histologickou diagnózou chronické endometritidy a bez ní. To bude provedeno na základě nejmodernějších analytických technik metagenomika (sekvenování) a kulturomika (kultura)*. Pomocí metagenomiky zjišťujeme genetický materiál mikroorganismů přímo ve vzorcích, pomocí kulturomiky vypěstujeme ze vzorků co nejvíce druhů pomocí komplexního kultivačního plánu, po kterém tyto mikroorganismy identifikujeme pomocí hmotnostní spektrometrie. Kulturomika je nová technika, která již byla s velkým úspěchem v zahraničí aplikována na různé typy vzorků, což vedlo k objevu mnoha nových bakteriálních druhů. Tato technika nebyla nikdy aplikována na vaginální výtěry / ​​endometriální biopsie, což z ní činí velmi inovativní projekt. Techniky kulturomika a metagenomika se vzájemně doplňují při získávání velmi úplného obrazu mikrobiomu.

Bude hodnoceno, zda mikrobiom endometriálních biopsií a vaginálních výtěrů může nabídnout pomoc při volbě vhodného antibiotika při diagnóze chronické endometritidy u pacientky. Zhodnotíme mikrobiom na začátku a před a po léčbě (širokospektrými) antibiotiky, v současnosti je první volbou doxycyklin. Budeme zkoumat, jaký vliv má antibiotická léčba na složení mikrobiomu, do jaké míry se podařilo obnovit rovnováhu mezi „dobrými a špatnými“ bakteriemi a zda mizí histologické známky (plazmatické buňky) chronické endometritidy.

Mikrobiologické výsledky budou porovnány s klasifikačním skóre na základě přítomnosti plazmatických buněk. Tímto způsobem lze ověřit toto unikátní klasifikační skóre, které bylo vyvinuto v anatomickopatologické laboratoři UZ Brusel. Na základě tohoto klasifikačního skóre je možná robustní diagnóza pro onemocnění, pro které není dosud k dispozici žádná podložená diagnóza.