FLORA-prosjektet: på jakt etter den mikrobielle årsaken til kronisk endometritt og den mest passende behandlingen for å oppnå en vellykket graviditet IVF/ICSI (FLORA)

Kronisk endometritt er en betennelsestilstand i endometriet. Denne betennelsen kan påvirke fruktbarhet og graviditet negativt. Patologien er hyppig (+-10%) observert hos kvinner med fertilitetsproblemer. I dag er diagnosen kronisk endometritt ikke åpenbar, siden ingen godt validerte klassifiseringsskalaer er tilgjengelige. I UZ Brussel bruker patologiavdelingen sitt eget interne scoringssystem, basert på tilstedeværelsen og plasseringen av plasmaceller i de histologiske bildene.

Til tross for begrenset forskning så langt, ble det nylig klart at endometriet er kolonisert av mikroorganismer (mikrobiomet). Det er imidlertid fortsatt uklart hvilken rolle disse mikroorganismene spiller i kronisk endometritt og fertilitetsproblemer. Kronisk endometritt diagnostiseres ofte i sammenheng med fertilitetsproblemer, og pasienten behandles 'blindt' med bredspektrede antibiotika som doksycyklin. Bredspektrede antibiotika utrydder unødvendig mange mikroorganismer i kroppen vår, inkludert de som positivt påvirker implantasjonen. Den eksakte årsaken til kronisk endometritt er ukjent, så behandlingen forblir empirisk. Forskningen og kunnskapen innen endometriemikrobiomet utvides stadig, hovedsakelig på grunn av fremveksten av forskning på koblingene mellom patologier og menneskelig mikrobiota. Det blir stadig tydeligere at sammensetningen av mikrobiomet kan spille en viktig rolle for helse og sykdom. Når det gjelder innflytelsen av endometriemikrobiomet på forskjellige patologier, som kronisk endometritt og implantasjonssvikt eller spontanabort, er det fortsatt ingen konsensus. Til tross for flere studier på endometriemikrobiomet, er vi ennå ikke i stand til å definere et normalt eller sunt endometriemikrobiom.

I dette prosjektet ønsker vi å få innsikt i mikroorganismene som finnes i den kvinnelige forplantningsveien basert på ulike teknikker. Analysene vil utføres på en endometriebiopsi og en vaginal vattpinne. Biopsien tas rutinemessig ved Brussel IVF for påvisning av plasmaceller i anatomopatologilaboratoriet for diagnostisering av kronisk endometritt. I mikrobiologilaboratoriet vil vi undersøke hvilke mikroorganismer som finnes i kvinnelige forplantningsorganer med og uten den histologiske diagnosen kronisk endometritt. Dette vil bli gjort basert på de moderne analytiske teknikkene metagenomics (sekvensering) og culturomics (kultur)*. Med metagenomics oppdager vi genetisk materiale av mikroorganismene direkte i prøvene, med culturomics dyrker vi så mange arter som mulig fra prøvene ved hjelp av en kompleks kulturplan, hvoretter vi identifiserer disse mikroorganismene ved hjelp av massespektrometri. Culturomics er en ny teknikk som allerede har blitt brukt med stor suksess i utlandet på ulike prøvetyper, noe som har resultert i oppdagelsen av mange nye bakteriearter. Denne teknikken har aldri blitt brukt på vaginale vattpinner/endometriebiopsier, noe som gjør det til et veldig innovativt prosjekt. Teknikkene culturomics og metagenomics er komplementære til hverandre for å få et veldig komplett bilde av mikrobiomet.

Det vil bli evaluert om mikrobiomet til endometriebiopsier og vaginale vattpinner kan tilby hjelp til valg av et passende antibiotikum når kronisk endometritt diagnostiseres hos en pasient. Vi vil evaluere mikrobiomet ved baseline og før og etter behandling med (bredspektret) antibiotika, foreløpig er førstevalget doksycyklin. Vi skal undersøke hvilken effekt antibiotikabehandlingen har på sammensetningen av mikrobiomet, i hvilken grad balansen mellom «gode og dårlige» bakterier er gjenopprettet og om de histologiske tegnene (plasmacellene) på kronisk endometritt forsvinner.

De mikrobiologiske resultatene vil bli sammenlignet med klassifiseringsskåren basert på tilstedeværelsen av plasmaceller. På denne måten kan denne unike klassifiseringsskåren, som ble utviklet i anatomopatologilaboratoriet til UZ Brussel, valideres. Basert på denne klassifiseringsskåren er det mulig å stille en robust diagnose for en sykdom som det foreløpig ikke foreligger noen underbygget diagnose for.