FLORA-projektet: på jakt efter den mikrobiella orsaken till kronisk endometrit och den mest lämpliga behandlingen för att få en framgångsrik graviditet IVF/ICSI (FLORA)

Kronisk endometrit är ett inflammatoriskt tillstånd i endometriet. Denna inflammation kan påverka fertiliteten och graviditeten negativt. Patologin observeras ofta (+-10%) hos kvinnor med fertilitetsproblem. Idag är diagnosen kronisk endometrit inte uppenbar, eftersom inga välvaliderade klassificeringsskalor finns tillgängliga. I UZ Brussel tillämpar patologiavdelningen sitt eget interna poängsystem, baserat på närvaron och positionen av plasmaceller i de histologiska bilderna.

Trots begränsad forskning hittills blev det nyligen klart att endometriet är koloniserat av mikroorganismer (mikrobiomet). Det är dock fortfarande oklart vilken roll dessa mikroorganismer spelar vid kronisk endometrit och fertilitetsproblem. Kronisk endometrit diagnostiseras ofta i samband med fertilitetsproblem, och patienten behandlas "blindt" med bredspektrumantibiotika som doxycyklin. Bredspektrumantibiotika utrotar i onödan många mikroorganismer i vår kropp, inklusive de som positivt påverkar implantationen. Den exakta orsaken till kronisk endometrit är okänd, så behandlingen förblir empirisk. Forskningen och kunskapen inom endometriemikrobiomet expanderar ständigt, främst på grund av uppkomsten av forskning om kopplingarna mellan patologier och mänsklig mikrobiota. Det blir allt tydligare att sammansättningen av mikrobiomet kan spela en avgörande roll för hälsa och sjukdom. När det gäller inverkan av endometriemikrobiomet på olika patologier, såsom kronisk endometrit och implantationsfel eller missfall, finns det fortfarande ingen konsensus. Trots flera studier på endometriemikrobiomet kan vi ännu inte definiera en normal eller frisk endometriemikrobiom.

I detta projekt vill vi utifrån olika tekniker få insikt i de mikroorganismer som finns i det kvinnliga fortplantningsorganet. Analyserna kommer att utföras på en endometriebiopsi och en vaginal pinne. Biopsien tas rutinmässigt vid Bryssel IVF för detektering av plasmaceller i anatomopatologilabbet för diagnos av kronisk endometrit. I mikrobiologilabbet kommer vi att undersöka vilka mikroorganismer som finns i det kvinnliga fortplantningsorganet med och utan den histologiska diagnosen kronisk endometrit. Detta kommer att göras baserat på de senaste analytiska teknikerna metagenomics (sekvensering) och culturomics (kultur)*. Med metagenomics detekterar vi genetiskt material från mikroorganismerna direkt i proverna, med culturomics odlar vi så många arter som möjligt från proverna med hjälp av ett komplext odlingsschema, varefter vi identifierar dessa mikroorganismer med masspektrometri. Culturomics är en ny teknik som redan har tillämpats med stor framgång utomlands på olika provtyper vilket resulterat i upptäckten av många nya bakteriearter. Denna teknik har aldrig tillämpats på vaginala pinnprover/endometriebiopsier, vilket gör det till ett mycket innovativt projekt. Teknikerna culturomics och metagenomics är komplementära till varandra för att få en mycket komplett bild av mikrobiomet.

Det kommer att utvärderas om mikrobiomet av endometriebiopsier och vaginala pinnprover kan erbjuda hjälp vid valet av ett lämpligt antibiotikum när kronisk endometrit diagnostiseras hos en patient. Vi kommer att utvärdera mikrobiomet vid baslinjen och före och efter behandling med (bredspektrum) antibiotika, för närvarande är förstahandsvalet doxycyklin. Vi ska undersöka vilken effekt antibiotikabehandlingen har på mikrobiomets sammansättning, i vilken utsträckning balansen mellan "bra och dåliga" bakterier har återställts och om de histologiska tecknen (plasmaceller) på kronisk endometrit försvinner.

De mikrobiologiska resultaten kommer att jämföras med klassificeringspoängen baserat på närvaron av plasmaceller. På detta sätt kan denna unika klassificeringspoäng, som utvecklades i anatomopatologilaboratoriet i UZ Brussel, valideras. Baserat på denna klassificeringspoäng är en robust diagnos möjlig för en sjukdom för vilken det hittills inte finns någon underbyggd diagnos.