Vzorec exprese genů HNRNPH1 a HNRNPK v MPN
Vzorec exprese heterogenních jaderných ribonukleoproteinových genů H1 (HNRNPH1) a K (HNRNPK) u myeloproliferativních novotvarů
Přehled studie
Postavení
Podmínky
Detailní popis
Samoobnovující se hematopoetické pluripotentní kmenové buňky se mohou vyvinout buď do myeloidních nebo lymfoidních linií. Různorodá škála onemocnění známých jako myeloproliferativní novotvary (MPN) se vyvíjí v důsledku aberantní proliferace jedné nebo více terminálních myeloidních buněčných linií v periferní cirkulaci. MPN přicházejí ve čtyřech tradičních formách: chronická myeloidní leukémie (CML), polycythaemia vera (PV), esenciální trombocytémie (ET) a primární myelofibróza (PMF). Chronická neutrofilní leukémie (CNL), chronická eozinofilní leukémie (CEL) a MPN neklasifikovatelné byly také zahrnuty do klasifikace WHO. Zatímco PV, ET a PMF jsou BCR-ABL1 negativní, CML je BCR-ABL1 pozitivní.
V jádře eukaryotické buňky se mnoho ribonukleoproteinů (RNP) spojí do nedávno vytvořených transkriptů. Heterogenní jaderné ribonukleoproteiny (hnRNP) jsou jedním typem RNP. Nyní je známo, že některé hnRNP hrají roli ve vývoji lidských hematologických malignit. Výzkum nemocí se stále více zajímá o to, jak hnRNP řídí genovou expresi. Četné druhy rakoviny vykazují změněné hladiny exprese hnRNP, což zvyšuje možnost, že hrají roli v karcinogenezi.
Například leukemické buňky vykazovaly downregulaci heterogenního jaderného ribonukleoproteinu K (HNRNPK). Růst nádoru myeloproliferativního novotvaru in vivo byl urychlen knockdownem HNRNPK. Na druhé straně studie naznačuje, že nadměrná exprese HNRNPK by mohla urychlit rozvoj CML, a tudíž možným indikátorem progrese CML a potenciálním terapeutickým cílem by mohla být HNRNPK.
Heterogenní jaderný ribonukleoprotein H1 (HNRNPH1), jeden z prvních identifikovaných proteinů vázajících RNA (RBP), přispívá ke stabilizaci RNA, úpravě RNA a modifikaci RNA. Předchozí výzkum ukázal, že vysoké hladiny exprese HNRNPH1 vedou ke karcinogenezi jak upregulací exprese onkogenů, tak downregulací exprese tumor supresorových genů, jako jsou P53, Ron a BCL-X.
Naši studii jsme provedli s cílem studovat úroveň exprese genů heterogenního jaderného ribonukleoproteinu H1 (HNRNPH1) a K (HNRNPK) a jejich proteinů v MPN a prozkoumat asociaci HNRNPH1 a HNRNPK s molekulárně diagnostickými testy MPN.
Typ studie
Zápis (Odhadovaný)
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
- Jméno: Alaa Elminshawy, MD, MSc
- Telefonní číslo: +2 01128892117
- E-mail: alaa.elminshawy@med.aun.edu.eg
Studijní místa
-
-
-
Assiut, Egypt
- Nábor
- Assiut University Department of Clinical Pathology
-
Kontakt:
- Alaa A. El-Minshawy, MsC
- Telefonní číslo: +2 01128892117
- E-mail: alaa.elminshawy@hotmail.com
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dítě
- Dospělý
- Starší dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
Studie bude provedena na pacientech nově diagnostikovaných s jedním z myeloproliferativních novotvarů na základě kritérií WHO pro diagnostiku MPN, ať už jde o muže nebo ženy a v jakémkoli věku.
Kritéria vyloučení:
- Jiné malignity.
- Pacienti na chemoterapii nebo radioterapii.
- Autoimunitní onemocnění.
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
Intervence / Léčba |
|---|---|
|
Případy myeloproliferativních novotvarů
Případy myeloproliferativních novotvarů budou testovány na expresi genů heterogenního jaderného ribonukleoproteinu H1 (HNRNPH1) a K (HNRNPK)
|
Vzorky krve z případů myeloproliferativních novotvarů a kontrol budou testovány pomocí reverzní transkripčně-kvantitativní polymerázové řetězové reakce (RT-qPCR) na expresi genů heterogenního jaderného ribonukleoproteinu H1 (HNRNPH1) a K (HNRNPK).
|
|
Řízení
Zdravé kontroly budou testovány na expresi genů heterogenního jaderného ribonukleoproteinu H1 (HNRNPH1) a K (HNRNPK)
|
Vzorky krve z případů myeloproliferativních novotvarů a kontrol budou testovány pomocí reverzní transkripčně-kvantitativní polymerázové řetězové reakce (RT-qPCR) na expresi genů heterogenního jaderného ribonukleoproteinu H1 (HNRNPH1) a K (HNRNPK).
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Exprese genů heterogenního jaderného ribonukleoproteinu H1 (HNRNPH1) a heterogenního jaderného ribonukleoproteinu K (HNRNPK) v myeloproliferativních novotvarech (MPN)
Časové okno: dva roky
|
Hladiny exprese genů pro heterogenní jaderný ribonukleoprotein H1 (HNRNPH1) a heterogenní jaderný ribonukleoprotein K (HNRNPK) pro diagnostiku myeloproliferativních novotvarů.
|
dva roky
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Korelace mezi úrovněmi exprese genů HNRNPH1 a HNRNPK a molekulárně diagnostickými testy na myeloproliferativní novotvary
Časové okno: Dva roky
|
Korelace mezi úrovněmi exprese genů HNRNPH1 a HNRNPK a molekulárně diagnostickými testy na myeloproliferativní novotvary, jako je chromozom Philadelphia nebo mutace exonu 12 JAK2 V617F nebo JAK2 nebo mutace CALR nebo MPL podle případu
|
Dva roky
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Alaa Elminshawy, MD, Mac, Assiut university
Publikace a užitečné odkazy
Obecné publikace
- Arber DA, Orazi A, Hasserjian R, Thiele J, Borowitz MJ, Le Beau MM, Bloomfield CD, Cazzola M, Vardiman JW. The 2016 revision to the World Health Organization classification of myeloid neoplasms and acute leukemia. Blood. 2016 May 19;127(20):2391-405. doi: 10.1182/blood-2016-03-643544. Epub 2016 Apr 11.
- Tefferi A, Thiele J, Vardiman JW. The 2008 World Health Organization classification system for myeloproliferative neoplasms: order out of chaos. Cancer. 2009 Sep 1;115(17):3842-7. doi: 10.1002/cncr.24440.
- Gallardo M, Lee HJ, Zhang X, Bueso-Ramos C, Pageon LR, McArthur M, Multani A, Nazha A, Manshouri T, Parker-Thornburg J, Rapado I, Quintas-Cardama A, Kornblau SM, Martinez-Lopez J, Post SM. hnRNP K Is a Haploinsufficient Tumor Suppressor that Regulates Proliferation and Differentiation Programs in Hematologic Malignancies. Cancer Cell. 2015 Oct 12;28(4):486-499. doi: 10.1016/j.ccell.2015.09.001. Epub 2015 Sep 24.
- Dreyfuss G, Matunis MJ, Pinol-Roma S, Burd CG. hnRNP proteins and the biogenesis of mRNA. Annu Rev Biochem. 1993;62:289-321. doi: 10.1146/annurev.bi.62.070193.001445. No abstract available.
- Du Q, Wang L, Zhu H, Zhang S, Xu L, Zheng W, Liu X. The role of heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K in the progression of chronic myeloid leukemia. Med Oncol. 2010 Sep;27(3):673-9. doi: 10.1007/s12032-009-9267-z. Epub 2009 Aug 4.
- Han SP, Tang YH, Smith R. Functional diversity of the hnRNPs: past, present and perspectives. Biochem J. 2010 Sep 15;430(3):379-92. doi: 10.1042/BJ20100396.
- Garneau D, Revil T, Fisette JF, Chabot B. Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F/H proteins modulate the alternative splicing of the apoptotic mediator Bcl-x. J Biol Chem. 2005 Jun 17;280(24):22641-50. doi: 10.1074/jbc.M501070200. Epub 2005 Apr 18.
- Decorsiere A, Cayrel A, Vagner S, Millevoi S. Essential role for the interaction between hnRNP H/F and a G quadruplex in maintaining p53 pre-mRNA 3'-end processing and function during DNA damage. Genes Dev. 2011 Feb 1;25(3):220-5. doi: 10.1101/gad.607011.
- Braun S, Enculescu M, Setty ST, Cortes-Lopez M, de Almeida BP, Sutandy FXR, Schulz L, Busch A, Seiler M, Ebersberger S, Barbosa-Morais NL, Legewie S, Konig J, Zarnack K. Decoding a cancer-relevant splicing decision in the RON proto-oncogene using high-throughput mutagenesis. Nat Commun. 2018 Aug 17;9(1):3315. doi: 10.1038/s41467-018-05748-7.
- Panelli D, Lorusso FP, Papa F, Panelli P, Stella A, Caputi M, Sardanelli AM, Papa S. The mechanism of alternative splicing of the X-linked NDUFB11 gene of the respiratory chain complex I, impact of rotenone treatment in neuroblastoma cells. Biochim Biophys Acta. 2013 Feb;1829(2):211-8. doi: 10.1016/j.bbagrm.2012.12.001. Epub 2012 Dec 12.
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Primární dokončení (Odhadovaný)
Dokončení studie (Odhadovaný)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- HNRNPH1 & HNRNPK in MPNs
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Popis plánu IPD
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .