Паттерн экспрессии генов HNRNPH1 и HNRNPK в MPN
Паттерн экспрессии генов гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина H1 (HNRNPH1) и K (HNRNPK) в миелопролиферативных новообразованиях
Обзор исследования
Статус
Подробное описание
Самообновляющиеся гемопоэтические плюрипотентные стволовые клетки могут развиваться либо в миелоидные, либо в лимфоидные клетки. Широкий спектр заболеваний, известных как миелопролиферативные новообразования (МПН), развивается из-за аберрантной пролиферации одной или нескольких терминальных миелоидных клеточных линий в периферическом кровообращении. MPN бывают четырех традиционных форм: хронический миелоидный лейкоз (CML), истинная полицитемия (PV), эссенциальная тромбоцитемия (ET) и первичный миелофиброз (PMF). Хронический нейтрофильный лейкоз (ХНЛ), хронический эозинофильный лейкоз (ХЭЛ) и неклассифицируемый МПН также были включены в классификацию ВОЗ. В то время как PV, ET и PMF являются BCR-ABL1-отрицательными, CML является BCR-ABL1-положительным.
В ядре эукариотической клетки многие рибонуклеопротеины (РНП) собираются на недавно произведенных транскриптах. Гетерогенные ядерные рибонуклеопротеины (hnRNP) представляют собой один из типов RNP. В настоящее время известно, что некоторые hnRNP играют роль в развитии гематологических злокачественных новообразований человека. Исследования заболеваний все больше интересуются тем, как hnRNPs контролируют экспрессию генов. Многие виды рака демонстрируют измененные уровни экспрессии hnRNP, что повышает вероятность того, что они играют роль в канцерогенезе.
Например, клетки лейкемии показали подавление гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина К (HNRNPK). Рост опухоли миелопролиферативного новообразования in vivo ускорялся при нокдауне HNRNPK. С другой стороны, исследование предполагает, что гиперэкспрессия HNRNPK может ускорить развитие CML, и, таким образом, возможным индикатором прогрессирования CML и потенциальной терапевтической мишенью может быть HNRNPK.
Более того, один из первых идентифицированных РНК-связывающих белков (RBPs), гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин H1 (HNRNPH1), способствует стабилизации РНК, редактированию РНК и модификации РНК. Предыдущие исследования показали, что высокие уровни экспрессии HNRNPH1 приводят к канцерогенезу как за счет усиления экспрессии онкогенов, так и за счет подавления экспрессии генов-супрессоров опухолей, таких как P53, Ron и BCL-X.
Мы провели наше исследование с целью изучения уровня экспрессии генов гетерогенных ядерных рибонуклеопротеинов H1 (HNRNPH1) и K (HNRNPK) и их белков в MPN, а также изучения ассоциации HNRRNPH1 и HNRNPK с молекулярно-диагностическими тестами MPN.
Тип исследования
Регистрация (Оцененный)
Контакты и местонахождение
Контакты исследования
- Имя: Alaa Elminshawy, MD, MSc
- Номер телефона: +2 01128892117
- Электронная почта: alaa.elminshawy@med.aun.edu.eg
Места учебы
-
-
-
Assiut, Египет
- Рекрутинг
- Assiut University Department of Clinical Pathology
-
Контакт:
- Alaa A. El-Minshawy, MsC
- Номер телефона: +2 01128892117
- Электронная почта: alaa.elminshawy@hotmail.com
-
-
Критерии участия
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
- Ребенок
- Взрослый
- Пожилой взрослый
Принимает здоровых добровольцев
Метод выборки
Исследуемая популяция
Описание
Критерии включения:
Исследование будет проводиться на пациентах, у которых впервые диагностировано одно из миелопролиферативных новообразований на основе критериев ВОЗ для диагностики МПН, будь то мужчины или женщины любого возраста.
Критерий исключения:
- Другие злокачественные новообразования.
- Пациенты, проходящие химиотерапию или лучевую терапию.
- Аутоиммунные заболевания.
Учебный план
Как устроено исследование?
Детали дизайна
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
Миелопролиферативные новообразования Случаи
Случаи миелопролиферативных новообразований будут проверены на экспрессию генов гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина H1 (HNRNPH1) и K (HNRNPK).
|
Образцы крови от пациентов с миелопролиферативными новообразованиями и контрольной группы будут протестированы с помощью количественной полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией (RT-qPCR) на экспрессию генов гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина H1 (HNRNPH1) и K (HNRNPK).
|
|
Элементы управления
Здоровые контроли будут проверены на экспрессию генов гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина H1 (HNRNPH1) и K (HNRNPK).
|
Образцы крови от пациентов с миелопролиферативными новообразованиями и контрольной группы будут протестированы с помощью количественной полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией (RT-qPCR) на экспрессию генов гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина H1 (HNRNPH1) и K (HNRNPK).
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Экспрессия генов гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина H1 (HNRNPH1) и гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина K (HNRNPK) в миелопролиферативных новообразованиях (МПН)
Временное ограничение: два года
|
Уровни экспрессии генов гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина H1 (HNRNPH1) и гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина K (HNRNPK) для диагностики миелопролиферативных новообразований.
|
два года
|
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Корреляция между уровнями экспрессии генов HNRRNPH1 и HNRNPK и тестами молекулярной диагностики миелопролиферативных новообразований
Временное ограничение: Два года
|
Корреляция между уровнями экспрессии генов HNRNPH1 и HNRNPK и молекулярными диагностическими тестами для миелопролиферативных новообразований, таких как филадельфийская хромосома или мутация JAK2 V617F или экзона 12 JAK2 или мутация CALR или MPL в зависимости от случая
|
Два года
|
Соавторы и исследователи
Спонсор
Следователи
- Главный следователь: Alaa Elminshawy, MD, Mac, Assiut University
Публикации и полезные ссылки
Общие публикации
- Arber DA, Orazi A, Hasserjian R, Thiele J, Borowitz MJ, Le Beau MM, Bloomfield CD, Cazzola M, Vardiman JW. The 2016 revision to the World Health Organization classification of myeloid neoplasms and acute leukemia. Blood. 2016 May 19;127(20):2391-405. doi: 10.1182/blood-2016-03-643544. Epub 2016 Apr 11.
- Tefferi A, Thiele J, Vardiman JW. The 2008 World Health Organization classification system for myeloproliferative neoplasms: order out of chaos. Cancer. 2009 Sep 1;115(17):3842-7. doi: 10.1002/cncr.24440.
- Gallardo M, Lee HJ, Zhang X, Bueso-Ramos C, Pageon LR, McArthur M, Multani A, Nazha A, Manshouri T, Parker-Thornburg J, Rapado I, Quintas-Cardama A, Kornblau SM, Martinez-Lopez J, Post SM. hnRNP K Is a Haploinsufficient Tumor Suppressor that Regulates Proliferation and Differentiation Programs in Hematologic Malignancies. Cancer Cell. 2015 Oct 12;28(4):486-499. doi: 10.1016/j.ccell.2015.09.001. Epub 2015 Sep 24.
- Dreyfuss G, Matunis MJ, Pinol-Roma S, Burd CG. hnRNP proteins and the biogenesis of mRNA. Annu Rev Biochem. 1993;62:289-321. doi: 10.1146/annurev.bi.62.070193.001445. No abstract available.
- Du Q, Wang L, Zhu H, Zhang S, Xu L, Zheng W, Liu X. The role of heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K in the progression of chronic myeloid leukemia. Med Oncol. 2010 Sep;27(3):673-9. doi: 10.1007/s12032-009-9267-z. Epub 2009 Aug 4.
- Han SP, Tang YH, Smith R. Functional diversity of the hnRNPs: past, present and perspectives. Biochem J. 2010 Sep 15;430(3):379-92. doi: 10.1042/BJ20100396.
- Garneau D, Revil T, Fisette JF, Chabot B. Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F/H proteins modulate the alternative splicing of the apoptotic mediator Bcl-x. J Biol Chem. 2005 Jun 17;280(24):22641-50. doi: 10.1074/jbc.M501070200. Epub 2005 Apr 18.
- Decorsiere A, Cayrel A, Vagner S, Millevoi S. Essential role for the interaction between hnRNP H/F and a G quadruplex in maintaining p53 pre-mRNA 3'-end processing and function during DNA damage. Genes Dev. 2011 Feb 1;25(3):220-5. doi: 10.1101/gad.607011.
- Braun S, Enculescu M, Setty ST, Cortes-Lopez M, de Almeida BP, Sutandy FXR, Schulz L, Busch A, Seiler M, Ebersberger S, Barbosa-Morais NL, Legewie S, Konig J, Zarnack K. Decoding a cancer-relevant splicing decision in the RON proto-oncogene using high-throughput mutagenesis. Nat Commun. 2018 Aug 17;9(1):3315. doi: 10.1038/s41467-018-05748-7.
- Panelli D, Lorusso FP, Papa F, Panelli P, Stella A, Caputi M, Sardanelli AM, Papa S. The mechanism of alternative splicing of the X-linked NDUFB11 gene of the respiratory chain complex I, impact of rotenone treatment in neuroblastoma cells. Biochim Biophys Acta. 2013 Feb;1829(2):211-8. doi: 10.1016/j.bbagrm.2012.12.001. Epub 2012 Dec 12.
Даты записи исследования
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
Первичное завершение (Оцененный)
Завершение исследования (Оцененный)
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Первый опубликованный (Действительный)
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последняя проверка
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
- HNRNPH1 & HNRNPK in MPNs
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
Описание плана IPD
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .