HNRNPH1- ja HNRNPK-geenien ekspressiomalli MPN:issä
Heterogeenisten ydinribonukleoproteiini H1 (HNRNPH1) ja K (HNRNPK) geenien ilmentymismalli myeloproliferatiivisissa kasvaimissa
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Yksityiskohtainen kuvaus
Itsestään uusiutuvat hematopoieettiset pluripotentit kantasolut voivat kehittyä joko myeloidisiksi tai lymfoidisiksi linjoiksi. Monipuolinen joukko sairauksia, jotka tunnetaan myeloproliferatiivisina kasvaimina (MPN), kehittyy johtuen yhden tai useamman terminaalisen myeloidisolulinjan poikkeavasta lisääntymisestä perifeerisessä verenkierrossa. MPN:itä on neljässä perinteisessä muodossa: krooninen myelooinen leukemia (CML), polycythaemia vera (PV), essentiaalinen trombosytemia (ET) ja primaarinen myelofibroosi (PMF). WHO:n luokitukseen sisältyivät myös krooninen neutrofiilinen leukemia (CNL), krooninen eosinofiilinen leukemia (CEL) ja MPN, jota ei voida luokitella. Vaikka PV, ET ja PMF ovat BCR-ABL1-negatiivisia, CML on BCR-ABL1-positiivinen.
Eukaryoottisolun ytimessä monet ribonukleoproteiinit (RNP:t) kerääntyvät äskettäin tuotettuihin transkripteihin. Heterogeeniset tuman ribonukleoproteiinit (hnRNP:t) ovat yksi RNP-tyyppi. Joillakin hnRNP:illä tiedetään nyt olevan rooli ihmisen hematologisten pahanlaatuisten kasvainten kehittymisessä. Sairaustutkimus on alkanut kiinnostua enemmän siitä, kuinka hnRNP:t säätelevät geeniekspressiota. Useilla syövillä on muuttuneita hnRNP:n ilmentymistasoja, mikä lisää mahdollisuutta, että niillä on osansa karsinogeneesissä.
Esimerkiksi leukemiasolut osoittivat heterogeenisen tuman ribonukleoproteiini K:n (HNRNPK) heikentymistä. In vivo myeloproliferatiivisen kasvaimen kasvaimen kasvua kiihdytti HNRNPK-knockdown. Toisaalta yksi tutkimus viittaa siihen, että HNRNPK:n yli-ilmentyminen voisi kiihdyttää KML:n kehittymistä ja siten mahdollinen indikaattori KML:n etenemisestä ja mahdollinen terapeuttinen kohde voisi olla HNRNPK.
Lisäksi yksi varhaisimmista tunnistetuista RNA:ta sitovista proteiineista (RBP), heterogeeninen ydinribonukleoproteiini H1 (HNRNPH1), edistää RNA:n stabilointia, RNA:n muokkausta ja RNA:n modifiointia. Aiemmat tutkimukset ovat osoittaneet, että korkeat HNRNPH1:n ilmentymistasot johtavat karsinogeneesiin sekä lisäämällä onkogeenien ekspressiota että vähentämällä kasvainsuppressorigeenien, kuten P53, Ron ja BCL-X, ekspressiota.
Teimme tutkimuksemme tavoitteena tutkia heterogeenisten ydinribonukleoproteiini H1 (HNRNPH1) ja K (HNRNPK) geenien ja niiden proteiinien ilmentymistasoa MPN:issä sekä tutkia HNRNPH1:n ja HNRNPK:n yhteyttä MPN:ien molekyylidiagnostisiin testeihin.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
- Nimi: Alaa Elminshawy, MD, MSc
- Puhelinnumero: +2 01128892117
- Sähköposti: alaa.elminshawy@med.aun.edu.eg
Opiskelupaikat
-
-
-
Assiut, Egypti
- Rekrytointi
- Assiut University Department of Clinical Pathology
-
Ottaa yhteyttä:
- Alaa A. El-Minshawy, MsC
- Puhelinnumero: +2 01128892117
- Sähköposti: alaa.elminshawy@hotmail.com
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Lapsi
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
Tutkimus suoritetaan potilailla, joilla on äskettäin diagnosoitu jokin myeloproliferatiivisista kasvaimista WHO:n MPN-diagnoosin kriteerien perusteella, olivatpa miehet tai naiset ja minkä ikäisiä tahansa.
Poissulkemiskriteerit:
- Muut pahanlaatuiset kasvaimet.
- Potilaat, jotka saavat kemoterapiaa tai sädehoitoa.
- Autoimmuunisairaudet.
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Myeloproliferatiiviset kasvaimet Tapaukset
Myeloproliferatiiviset kasvaimet Tapaukset testataan heterogeenisten tuman ribonukleoproteiini H1 (HNRNPH1) ja K (HNRNPK) geenien ilmentymisen suhteen
|
Verinäytteet myeloproliferatiivisten kasvainten tapauksista ja kontrollit testataan käänteistranskriptio-kvantitatiivisella polymeraasiketjureaktiolla (RT-qPCR) heterogeenisten tuman ribonukleoproteiini H1 (HNRNPH1) ja K (HNRNPK) geenien ilmentymisen suhteen.
|
|
Säätimet
Terveet kontrollit testataan heterogeenisten tuman ribonukleoproteiini H1 (HNRNPH1) ja K (HNRNPK) geenien ilmentymisen suhteen
|
Verinäytteet myeloproliferatiivisten kasvainten tapauksista ja kontrollit testataan käänteistranskriptio-kvantitatiivisella polymeraasiketjureaktiolla (RT-qPCR) heterogeenisten tuman ribonukleoproteiini H1 (HNRNPH1) ja K (HNRNPK) geenien ilmentymisen suhteen.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Heterogeenisen tuman ribonukleoproteiini H1 (HNRNPH1) ja heterogeenisen ydinribonukleoproteiini K (HNRNPK) geenien ilmentyminen myeloproliferatiivisissa kasvaimissa (MPN)
Aikaikkuna: kaksi vuotta
|
Heterogeenisen ydinribonukleoproteiini H1 (HNRNPH1) ja heterogeenisen ydinribonukleoproteiini K (HNRNPK) geenien ilmentymistasot myeloproliferatiivisten kasvainten diagnosointiin.
|
kaksi vuotta
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Korrelaatio HNRNPH1- ja HNRNPK-geenien ilmentymistasojen ja myeloproliferatiivisten kasvainten molekyylidiagnostisten testien välillä
Aikaikkuna: Kaksi vuotta
|
Korrelaatio HNRNPH1- ja HNRNPK-geenien ilmentymistasojen ja myeloproliferatiivisten kasvainten, kuten Philadelphia-kromosomin tai JAK2 V617F- tai JAK2-eksoni 12-mutaation tai CALR- tai MPL-mutaation, molekyylidiagnostisten testien välillä tapauksen mukaan
|
Kaksi vuotta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Tutkijat
- Päätutkija: Alaa Elminshawy, MD, Mac, Assiut University
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Yleiset julkaisut
- Arber DA, Orazi A, Hasserjian R, Thiele J, Borowitz MJ, Le Beau MM, Bloomfield CD, Cazzola M, Vardiman JW. The 2016 revision to the World Health Organization classification of myeloid neoplasms and acute leukemia. Blood. 2016 May 19;127(20):2391-405. doi: 10.1182/blood-2016-03-643544. Epub 2016 Apr 11.
- Tefferi A, Thiele J, Vardiman JW. The 2008 World Health Organization classification system for myeloproliferative neoplasms: order out of chaos. Cancer. 2009 Sep 1;115(17):3842-7. doi: 10.1002/cncr.24440.
- Gallardo M, Lee HJ, Zhang X, Bueso-Ramos C, Pageon LR, McArthur M, Multani A, Nazha A, Manshouri T, Parker-Thornburg J, Rapado I, Quintas-Cardama A, Kornblau SM, Martinez-Lopez J, Post SM. hnRNP K Is a Haploinsufficient Tumor Suppressor that Regulates Proliferation and Differentiation Programs in Hematologic Malignancies. Cancer Cell. 2015 Oct 12;28(4):486-499. doi: 10.1016/j.ccell.2015.09.001. Epub 2015 Sep 24.
- Dreyfuss G, Matunis MJ, Pinol-Roma S, Burd CG. hnRNP proteins and the biogenesis of mRNA. Annu Rev Biochem. 1993;62:289-321. doi: 10.1146/annurev.bi.62.070193.001445. No abstract available.
- Du Q, Wang L, Zhu H, Zhang S, Xu L, Zheng W, Liu X. The role of heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K in the progression of chronic myeloid leukemia. Med Oncol. 2010 Sep;27(3):673-9. doi: 10.1007/s12032-009-9267-z. Epub 2009 Aug 4.
- Han SP, Tang YH, Smith R. Functional diversity of the hnRNPs: past, present and perspectives. Biochem J. 2010 Sep 15;430(3):379-92. doi: 10.1042/BJ20100396.
- Garneau D, Revil T, Fisette JF, Chabot B. Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F/H proteins modulate the alternative splicing of the apoptotic mediator Bcl-x. J Biol Chem. 2005 Jun 17;280(24):22641-50. doi: 10.1074/jbc.M501070200. Epub 2005 Apr 18.
- Decorsiere A, Cayrel A, Vagner S, Millevoi S. Essential role for the interaction between hnRNP H/F and a G quadruplex in maintaining p53 pre-mRNA 3'-end processing and function during DNA damage. Genes Dev. 2011 Feb 1;25(3):220-5. doi: 10.1101/gad.607011.
- Braun S, Enculescu M, Setty ST, Cortes-Lopez M, de Almeida BP, Sutandy FXR, Schulz L, Busch A, Seiler M, Ebersberger S, Barbosa-Morais NL, Legewie S, Konig J, Zarnack K. Decoding a cancer-relevant splicing decision in the RON proto-oncogene using high-throughput mutagenesis. Nat Commun. 2018 Aug 17;9(1):3315. doi: 10.1038/s41467-018-05748-7.
- Panelli D, Lorusso FP, Papa F, Panelli P, Stella A, Caputi M, Sardanelli AM, Papa S. The mechanism of alternative splicing of the X-linked NDUFB11 gene of the respiratory chain complex I, impact of rotenone treatment in neuroblastoma cells. Biochim Biophys Acta. 2013 Feb;1829(2):211-8. doi: 10.1016/j.bbagrm.2012.12.001. Epub 2012 Dec 12.
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- HNRNPH1 & HNRNPK in MPNs
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
IPD-suunnitelman kuvaus
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .