Wzór ekspresji genów HNRNPH1 i HNRNPK w MPN
Wzorzec ekspresji genów heterogennej jądrowej rybonukleoproteiny H1 (HNRNPH1) i K (HNRNPK) w nowotworach mieloproliferacyjnych
Przegląd badań
Status
Interwencja / Leczenie
Szczegółowy opis
Samoodnawiające się pluripotencjalne komórki macierzyste układu krwiotwórczego mogą rozwinąć się w linie mieloidalne lub limfoidalne. Zróżnicowany zakres chorób znanych jako nowotwory mieloproliferacyjne (MPN) rozwija się z powodu nieprawidłowej proliferacji jednej lub więcej linii komórek końcowych szpiku w krążeniu obwodowym. MPN występują w czterech tradycyjnych postaciach: przewlekła białaczka szpikowa (CML), czerwienica prawdziwa (PV), nadpłytkowość samoistna (ET) i pierwotne zwłóknienie szpiku (PMF). Przewlekła białaczka neutrofilowa (CNL), przewlekła białaczka eozynofilowa (CEL) i MPN niesklasyfikowane również zostały uwzględnione w klasyfikacji WHO. Podczas gdy PV, ET i PMF są BCR-ABL1 ujemne, CML jest BCR-ABL1 dodatnie.
W jądrze komórki eukariotycznej wiele rybonukleoprotein (RNP) gromadzi się w niedawno wytworzonych transkryptach. Heterogeniczne jądrowe rybonukleoproteiny (hnRNP) są jednym z typów RNP. Obecnie wiadomo, że niektóre hnRNP odgrywają rolę w rozwoju ludzkich nowotworów hematologicznych. Badania nad chorobami stają się coraz bardziej zainteresowane tym, jak hnRNP kontrolują ekspresję genów. Liczne nowotwory wykazują zmienione poziomy ekspresji hnRNPs, co stwarza prawdopodobieństwo, że odgrywają one rolę w karcynogenezie.
Na przykład komórki białaczkowe wykazywały obniżenie poziomu heterogennej jądrowej rybonukleoproteiny K (HNRNPK). Wzrost nowotworu mieloproliferacyjnego in vivo został przyspieszony przez knockdown HNRNPK. Z drugiej strony, badanie sugeruje, że nadekspresja HNRNPK może przyspieszyć rozwój CML, a zatem możliwym wskaźnikiem progresji CML i potencjalnym celem terapeutycznym może być HNRNPK.
Co więcej, jedno z najwcześniej zidentyfikowanych białek wiążących RNA (RBP), heterogenna jądrowa rybonukleoproteina H1 (HNRNPH1), przyczynia się do stabilizacji RNA, edycji RNA i modyfikacji RNA. Wcześniejsze badania wykazały, że wysoki poziom ekspresji HNRNPH1 prowadzi do karcynogenezy zarówno poprzez zwiększenie ekspresji onkogenów, jak i obniżenie ekspresji genów supresorowych nowotworów, takich jak P53, Ron i BCL-X.
Nasze badanie przeprowadziliśmy w celu zbadania poziomu ekspresji genów heterogennej jądrowej rybonukleoproteiny H1 (HNRNPH1) i K (HNRNPK) oraz ich białek w MPN oraz zbadania powiązania HNRNPH1 i HNRNPK z molekularnymi testami diagnostycznymi MPN.
Typ studiów
Zapisy (Szacowany)
Kontakty i lokalizacje
Kontakt w sprawie studiów
- Nazwa: Alaa Elminshawy, MD, MSc
- Numer telefonu: +2 01128892117
- E-mail: alaa.elminshawy@med.aun.edu.eg
Lokalizacje studiów
-
-
-
Assiut, Egipt
- Rekrutacyjny
- Assiut University Department of Clinical Pathology
-
Kontakt:
- Alaa A. El-Minshawy, MsC
- Numer telefonu: +2 01128892117
- E-mail: alaa.elminshawy@hotmail.com
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
- Dziecko
- Dorosły
- Starszy dorosły
Akceptuje zdrowych ochotników
Metoda próbkowania
Badana populacja
Opis
Kryteria przyjęcia:
Badanie zostanie przeprowadzone na pacjentach ze świeżo rozpoznanym jednym z nowotworów mieloproliferacyjnych w oparciu o Kryteria WHO do rozpoznawania MPN niezależnie od wieku.
Kryteria wyłączenia:
- Inne nowotwory.
- Pacjenci w trakcie chemioterapii lub radioterapii.
- Choroby autoimmunologiczne.
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
Interwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Przypadki nowotworów mieloproliferacyjnych
Nowotwory mieloproliferacyjne Przypadki będą badane pod kątem ekspresji genów heterogennej jądrowej rybonukleoproteiny H1 (HNRNPH1) i K (HNRNPK)
|
Próbki krwi z przypadków nowotworów mieloproliferacyjnych i grupy kontrolne zostaną przebadane za pomocą ilościowej reakcji łańcuchowej polimerazy z odwrotną transkrypcją (RT-qPCR) pod kątem ekspresji genów heterogennej jądrowej rybonukleoproteiny H1 (HNRNPH1) i K (HNRNPK).
|
|
Sterownica
Zdrowe kontrole zostaną przetestowane pod kątem ekspresji heterogennych genów rybonukleoproteiny jądrowej H1 (HNRNPH1) i K (HNRNPK)
|
Próbki krwi z przypadków nowotworów mieloproliferacyjnych i grupy kontrolne zostaną przebadane za pomocą ilościowej reakcji łańcuchowej polimerazy z odwrotną transkrypcją (RT-qPCR) pod kątem ekspresji genów heterogennej jądrowej rybonukleoproteiny H1 (HNRNPH1) i K (HNRNPK).
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Ekspresja genów heterogennej jądrowej rybonukleoproteiny H1 (HNRNPH1) i heterogennej jądrowej rybonukleoproteiny K (HNRNPK) w nowotworach mieloproliferacyjnych (MPN)
Ramy czasowe: dwa lata
|
Poziomy ekspresji genów heterogennej jądrowej rybonukleoproteiny H1 (HNRNPH1) i heterogennej jądrowej rybonukleoproteiny K (HNRNPK) do diagnostyki nowotworów mieloproliferacyjnych.
|
dwa lata
|
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Korelacja między poziomami ekspresji genów HNRNPH1 i HNRNPK a molekularnymi testami diagnostycznymi w kierunku nowotworów mieloproliferacyjnych
Ramy czasowe: Dwa lata
|
Korelacja poziomów ekspresji genów HNRNPH1 i HNRNPK z molekularnymi testami diagnostycznymi w kierunku nowotworów mieloproliferacyjnych, takich jak chromosom Philadelphia lub mutacja JAK2 V617F lub JAK2 ekson 12 lub mutacja CALR lub MPL w zależności od przypadku
|
Dwa lata
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Śledczy
- Główny śledczy: Alaa Elminshawy, MD, Mac, Assiut University
Publikacje i pomocne linki
Publikacje ogólne
- Arber DA, Orazi A, Hasserjian R, Thiele J, Borowitz MJ, Le Beau MM, Bloomfield CD, Cazzola M, Vardiman JW. The 2016 revision to the World Health Organization classification of myeloid neoplasms and acute leukemia. Blood. 2016 May 19;127(20):2391-405. doi: 10.1182/blood-2016-03-643544. Epub 2016 Apr 11.
- Tefferi A, Thiele J, Vardiman JW. The 2008 World Health Organization classification system for myeloproliferative neoplasms: order out of chaos. Cancer. 2009 Sep 1;115(17):3842-7. doi: 10.1002/cncr.24440.
- Gallardo M, Lee HJ, Zhang X, Bueso-Ramos C, Pageon LR, McArthur M, Multani A, Nazha A, Manshouri T, Parker-Thornburg J, Rapado I, Quintas-Cardama A, Kornblau SM, Martinez-Lopez J, Post SM. hnRNP K Is a Haploinsufficient Tumor Suppressor that Regulates Proliferation and Differentiation Programs in Hematologic Malignancies. Cancer Cell. 2015 Oct 12;28(4):486-499. doi: 10.1016/j.ccell.2015.09.001. Epub 2015 Sep 24.
- Dreyfuss G, Matunis MJ, Pinol-Roma S, Burd CG. hnRNP proteins and the biogenesis of mRNA. Annu Rev Biochem. 1993;62:289-321. doi: 10.1146/annurev.bi.62.070193.001445. No abstract available.
- Du Q, Wang L, Zhu H, Zhang S, Xu L, Zheng W, Liu X. The role of heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K in the progression of chronic myeloid leukemia. Med Oncol. 2010 Sep;27(3):673-9. doi: 10.1007/s12032-009-9267-z. Epub 2009 Aug 4.
- Han SP, Tang YH, Smith R. Functional diversity of the hnRNPs: past, present and perspectives. Biochem J. 2010 Sep 15;430(3):379-92. doi: 10.1042/BJ20100396.
- Garneau D, Revil T, Fisette JF, Chabot B. Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F/H proteins modulate the alternative splicing of the apoptotic mediator Bcl-x. J Biol Chem. 2005 Jun 17;280(24):22641-50. doi: 10.1074/jbc.M501070200. Epub 2005 Apr 18.
- Decorsiere A, Cayrel A, Vagner S, Millevoi S. Essential role for the interaction between hnRNP H/F and a G quadruplex in maintaining p53 pre-mRNA 3'-end processing and function during DNA damage. Genes Dev. 2011 Feb 1;25(3):220-5. doi: 10.1101/gad.607011.
- Braun S, Enculescu M, Setty ST, Cortes-Lopez M, de Almeida BP, Sutandy FXR, Schulz L, Busch A, Seiler M, Ebersberger S, Barbosa-Morais NL, Legewie S, Konig J, Zarnack K. Decoding a cancer-relevant splicing decision in the RON proto-oncogene using high-throughput mutagenesis. Nat Commun. 2018 Aug 17;9(1):3315. doi: 10.1038/s41467-018-05748-7.
- Panelli D, Lorusso FP, Papa F, Panelli P, Stella A, Caputi M, Sardanelli AM, Papa S. The mechanism of alternative splicing of the X-linked NDUFB11 gene of the respiratory chain complex I, impact of rotenone treatment in neuroblastoma cells. Biochim Biophys Acta. 2013 Feb;1829(2):211-8. doi: 10.1016/j.bbagrm.2012.12.001. Epub 2012 Dec 12.
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe (Szacowany)
Ukończenie studiów (Szacowany)
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
- HNRNPH1 & HNRNPK in MPNs
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Opis planu IPD
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .