Rektální přeprava karbapenemáz produkujících Enterobacteriaceae při přijetí do francouzské univerzitní fakultní nemocnice (Prev-CPE)

„Úvod Vznik a šíření vznikajících vysoce odolných bakterií, včetně Enterobacteriaceae (CPE) produkujících karbapenemázu, je výzvou pro veřejné zdraví vzhledem k jejich rychlému šíření a nedostatku aktivních antibiotik proti těmto bakteriím. Šíření rozšířeného spektra Enterobacteriaceae produkujících β-laktamázu (ESBLE) od počátku 21. století vyvolává obavy z možného podobného rozšíření CPE v nadcházejících letech, zejména ve zdravotnictví. Včasná detekce nosičství CPE u hospitalizovaných pacientů s rizikovými faktory pro přenos CPE je zásadní pro prevenci jejich šíření v nemocnicích a také pro vedení empirické antibiotické terapie u nosičů CPE se známkami těžké infekce. Prevalence přenosu CPE při přijetí do nemocnice však není přesně známa, stejně jako faktory spojené s přenosem CPE.

Vyšetřovatelé proto plánují provést systematický screening na rektální přenos CPE při přijetí u vzorku pacientů hospitalizovaných v nemocnici Bichat - Claude-Bernard.

Primární cíl

- Zjistit prevalenci přenosu CPE u pacientů přijatých do nemocnice Bichat - Claude-Bernard

Sekundární cíle

• Zjistit prevalenci přepravy ESBLE u pacientů přijatých do nemocnice Bichat - Claude-Bernard
• Stanovit rizikové faktory pro rektální přenos CPE a ESBLE při přijetí
• Odhadnout roční počet pacientů s rektální CPE, kteří by nebyli identifikováni se současnou politikou cíleného screeningu
• Odhadnout roční počet sekundárních případů, kterým by se dalo předejít a kterým by se dalo předejít, kdyby se při přijetí uplatňovala univerzální screeningová politika (tj. pro všechny hospitalizované pacienty, nejen pro ty s rizikovými faktory).
• Charakterizovat bakteriální kmeny a enzymy identifikované v CPE přepravě při přijetí.

Materiály a metody Studie bude provedena ve dvoumístné veřejné fakultní nemocnici s 1000 lůžky v Paříži (Francie), která poskytuje primární a terciární péči a nachází se v oblasti sloužící velké části pacientů narozených v zahraničí, pocházejících převážně z Afrika.

Současná kritéria pro screening CPE při přijetí do nemocnice Bichat - Claude-Bernard Hospital zahrnují:

• Anamnéza hospitalizace nad 24 hodin v zahraničí za posledních 12 měsíců (od roku 2010) popř.
• Cestování do zahraničí bez hospitalizace v posledních 12 měsících v závislosti na hospitalizačním oddělení a/nebo přítomnosti rizikových faktorů, jako je nedávný návrat, prodloužený pobyt nebo cestování v jihovýchodní Asii (od roku 2018)

Všem zařazeným pacientům budou odebrány rektální výtěry ošetřujícím personálem nebo samotnými pacienty. Výtěry budou naneseny na selektivní média pro ESBLE (agar ChromID ESBLE - bioMérieux) a selektivní média pro CPE (agar chromID® CARBA - bioMérieux a agar chromID® OXA-48TM - bioMérieux). U každé podezřelé kolonie bude provedena identifikace hmotnostní spektrometrií MALDI-TOF a antibiogram na Mueller-Hintonově agaru. GeneXpert PCR (Cepheid) na podezřelých koloniích bude provedena společně v případě pozitivní kultivace na selektivním médiu pro detekci CPE. V případě pozitivní GeneXpert PCR na podezřelých koloniích bude na nativním vzorku provedena potvrzující GeneXpert PCR.

Ze zdravotních záznamů a pomocí dotazníku budou shromažďovány následující údaje:

• Sociodemografické charakteristiky pacientů: věk, pohlaví, země narození, země hlavního bydliště, místo pobytu před hospitalizací
• Charakteristika pobytu v nemocnici: Datum nástupu na oddělení, datum nástupu do nemocnice, původ před přijetím
• Expozice v zahraničí: Cestování/hospitace do zahraničí za posledních 12 měsíců pro pacienta, cestování/hospitalizace do zahraničí za posledních 12 měsíců pro osobu(y) žijící ve společné domácnosti s pacientem
• Expozice zdravotnickým zařízením: Hospitalizace (> 24 hodin) ve zdravotnickém zařízení ve Francii za posledních 12 měsíců
• Expozice antibiotik: Léčba antibiotiky přijatá v den průzkumu nebo v předchozích 3 měsících
• Screening EBSLE/CPE: Známý nosič CPE, rektální screening na CPE, který již provedl tým zdravotníků na oddělení

Velikost vzorku byla vypočtena na základě hypotézy o prevalenci přenosu CPE. Za předpokladu prevalence 0,5 % na základě literárních údajů s 95% intervalem spolehlivosti [0,1 % - 0,9 %] by mělo být zahrnuto 1195 pacientů. Studium bude trvat 6 měsíců s dobou zařazení 6 měsíců; účast každého pacienta bude trvat 1 den.

Hlavním výsledkem bude přeprava CPE; Nosiče CPE budou porovnávány s neoperátory. Kategoriální proměnné budou porovnávány pomocí Chi-2 testu nebo Fisherova exaktního testu a spojité proměnné pomocí Studentova t-testu nebo Mann-Whitneyho testu. Budou vypočítány poměry šancí (OR) a 95% intervaly spolehlivosti (CI). Všechny testy budou dvoustranné a hladina významnosti bude 5 %. Pro statistickou analýzu bude použit open-source software R for Statistical Computing."