Przenoszenie doodbytnicze pałeczek Enterobacteriaceae wytwarzających karbapenemazy przy przyjęciu do francuskiego Uniwersyteckiego Szpitala Klinicznego (Prev-CPE)

„Wstęp Pojawienie się i rozprzestrzenianie nowych wysoce opornych bakterii, w tym Enterobacteriaceae (CPE) wytwarzających karbapenemazy, stanowi wyzwanie dla zdrowia publicznego, biorąc pod uwagę ich szybkie rozprzestrzenianie się i brak aktywnych antybiotyków przeciwko tym bakteriom. Rozprzestrzenianie się Enterobacteriaceae (ESBLE) wytwarzających β-laktamazy o rozszerzonym spektrum od początku XXI wieku budzi obawy co do potencjalnego podobnego rozprzestrzeniania się CPE w nadchodzących latach, zwłaszcza w placówkach opieki zdrowotnej. Wczesne wykrycie nosicielstwa CPE u hospitalizowanych pacjentów z czynnikami ryzyka nosicielstwa CPE jest niezbędne, aby zapobiec ich rozprzestrzenianiu się w szpitalach, a także poprowadzić empiryczną antybiotykoterapię u nosicieli CPE z objawami ciężkiej infekcji. Jednak częstość występowania CPE przy przyjęciu do szpitala nie jest dokładnie znana, podobnie jak czynniki związane z nosicielstwem CPE.

W związku z tym badacze planują przeprowadzenie systematycznego badania przesiewowego w kierunku nosicielstwa odbytniczego CPE przy przyjęciu na próbie pacjentów hospitalizowanych w szpitalu Bichat - Claude-Bernard.

Podstawowy cel

- Określenie częstości występowania nosicielstwa CPE u pacjentów przyjmowanych do Bichat - Claude-Bernard Hospital

Cele drugorzędne

• Określenie częstości występowania nosicielstwa ESBLE u pacjentów przyjmowanych do Bichat - Claude-Bernard Hospital
• Określenie czynników ryzyka nosicielstwa odbytniczego CPE i ESBLE przy przyjęciu
• Oszacowanie rocznej liczby pacjentów z CPE w odbytnicy, którzy nie zostaliby zidentyfikowani przy obecnej ukierunkowanej polityce badań przesiewowych
• Oszacowanie rocznej liczby przypadków wtórnych, którym można by zapobiec, gdyby przy przyjęciu zastosowano powszechną politykę badań przesiewowych (tj. dla wszystkich hospitalizowanych pacjentów, a nie tylko tych z czynnikami ryzyka).
• Scharakteryzowanie szczepów bakteryjnych i enzymów zidentyfikowanych w nosicielstwie CPE przy przyjęciu.

Materiał i metody Badanie zostanie przeprowadzone w dwuośrodkowym publicznym Szpitalu Uniwersyteckim na 1000 łóżek w Paryżu (Francja), który zapewnia opiekę podstawową i trzeciorzędową i jest zlokalizowany w rejonie obsługującym dużą część pacjentów urodzonych za granicą, pochodzących głównie z Afryka.

Obecne kryteria badań przesiewowych CPE przy przyjęciu do szpitala Bichat - Claude-Bernard obejmują:

• Historia hospitalizacji powyżej 24 godzin za granicą w ciągu ostatnich 12 miesięcy (od 2010 r.) lub
• Wyjazd za granicę bez hospitalizacji w ciągu ostatnich 12 miesięcy, w zależności od oddziału hospitalizacji i/lub obecności czynników ryzyka, takich jak niedawny powrót, dłuższy pobyt lub podróż w Azji Południowo-Wschodniej (od 2018 r.)

Wymazy z odbytu będą pobierane od wszystkich włączonych pacjentów przez personel pielęgniarski lub przez samych pacjentów. Wymazy zostaną pobrane na podłoża selektywne dla ESBLE (agar ChromID ESBLE - bioMérieux) i podłoża selektywne dla CPE (agar chromID® CARBA - bioMérieux i agar chromID® OXA-48TM - bioMérieux). Na każdej podejrzanej kolonii zostanie przeprowadzona identyfikacja za pomocą spektrometrii mas MALDI-TOF i antybiogram na agarze Muellera-Hintona. GeneXpert PCR (cefeidy) na podejrzanych koloniach zostanie przeprowadzony wspólnie w przypadku pozytywnej hodowli na selektywnym podłożu w celu wykrycia CPE. W przypadku pozytywnego wyniku testu GeneXpert PCR na podejrzanych koloniach, na próbce natywnej zostanie przeprowadzony potwierdzający test GeneXpert PCR.

Następujące dane będą zbierane z dokumentacji medycznej i kwestionariusza:

• Charakterystyka społeczno-demograficzna pacjentów: wiek, płeć, kraj urodzenia, główny kraj zamieszkania, miejsce zamieszkania przed hospitalizacją
• Charakterystyka pobytu w szpitalu: Data przyjęcia na oddział, data przyjęcia do szpitala, pochodzenie przed przyjęciem
• Narażenie za granicą: Podróż/pobyt w szpitalu za granicą w ciągu ostatnich 12 miesięcy dla pacjenta, podróż/pobyt w szpitalu za granicą w ciągu ostatnich 12 miesięcy dla osoby(osób) mieszkającej(ych) w tym samym gospodarstwie domowym co pacjent
• Narażenie w placówkach służby zdrowia: Hospitalizacja (>24h) w placówce służby zdrowia we Francji w ciągu ostatnich 12 miesięcy
• Ekspozycja na antybiotyki: Leczenie antybiotykami otrzymane w dniu badania lub w ciągu ostatnich 3 miesięcy
• Badanie przesiewowe EBSLE/CPE: Znany nosiciel CPE, badanie przesiewowe odbytu w kierunku CPE już podjęte przez oddziałowy zespół opieki zdrowotnej

Liczebność próby obliczono na podstawie hipotezy występowania nosicielstwa CPE. Zakładając częstość występowania na poziomie 0,5% na podstawie danych literaturowych z 95% przedziałem ufności [0,1% - 0,9%], należy uwzględnić 1195 pacjentów. Badanie potrwa 6 miesięcy z okresem włączenia 6 miesięcy; udział każdego pacjenta będzie trwał 1 dzień.

Głównym rezultatem będzie przewóz CPE; Nośnicy CPE zostaną porównani z osobami niebędącymi przewoźnikami. Zmienne kategorialne zostaną porównane za pomocą testu Chi-2 lub testu dokładnego Fishera, a zmienne ciągłe za pomocą testu t-Studenta lub testu Manna-Whitneya. Zostaną obliczone ilorazy szans (OR) i 95% przedziały ufności (CI). Wszystkie testy będą dwustronne, a poziom istotności wyniesie 5%. Do analizy statystycznej zostanie użyte oprogramowanie typu open source R for Statistical Computing”.