Rektal transport av karbapenemase-produserende-Enterobacteriaceae ved innleggelse til et fransk universitetssykehus (Prev-CPE)

"Innledning Fremveksten og spredningen av nye svært resistente bakterier, inkludert karbapenemase-produserende Enterobacteriaceae (CPE), er en folkehelseutfordring gitt deres raske spredning og mangel på aktive antibiotika mot disse bakteriene. Spredningen av utvidet spektrum β-laktamase-produserende Enterobacteriaceae (ESBLE) siden tidlig på 2000-tallet vekker bekymring for en potensiell lignende spredning av CPE i de kommende årene, spesielt i helsevesenet. Tidlig påvisning av CPE-bære hos sykehusinnlagte pasienter med risikofaktorer for CPE-bæring er avgjørende for å forhindre spredning av dem på sykehus, samt for å veilede empirisk antibiotikabehandling for CPE-bærere med tegn på alvorlig infeksjon. Prevalensen av CPE-transport ved innleggelse på sykehus er imidlertid ikke nøyaktig kjent, og det er heller ikke faktorer forbundet med CPE-transport.

Derfor planlegger etterforskerne å gjennomføre en systematisk screening for rektal transport av CPE ved innleggelse hos et utvalg pasienter innlagt på sykehuset Bichat - Claude-Bernard.

Hovedmål

- For å bestemme utbredelsen av CPE-bæring hos pasienter innlagt på Bichat - Claude-Bernard Hospital

Sekundære mål

• For å bestemme prevalensen av ESBLE-bæring hos pasienter innlagt på Bichat - Claude-Bernard Hospital
• For å bestemme risikofaktorene for rektal transport av CPE og ESBLE ved innleggelse
• Å estimere det årlige antallet pasienter med rektal CPE som ikke ville blitt identifisert med gjeldende målrettede screeningspolicy
• Å estimere det årlige antallet sekundære tilfeller som kunne forhindres som kunne forhindres hvis en universell screeningpolicy ble brukt ved innleggelse (dvs. for alle sykehuspasienter, ikke bare de med risikofaktorer).
• Å karakterisere bakteriestammene og enzymene identifisert i CPE-transport ved innleggelse.

Materialer og metoder Studien vil bli utført ved et to-steds 1000-sengers offentlig universitetssykehus i Paris (Frankrike), som gir primær- og tertiærpleie og er lokalisert i et område som betjener en stor andel utenlandsfødte pasienter, som hovedsakelig kommer fra Afrika.

Gjeldende kriterier for CPE-screening ved innleggelse til Bichat - Claude-Bernard Hospital inkluderer:

• Historie om sykehusinnleggelse i mer enn 24 timer i utlandet de siste 12 månedene (siden 2010) eller
• Reise til utlandet uten sykehusinnleggelse de siste 12 månedene, avhengig av sykehusinnleggelsesavdelingen og/eller tilstedeværelsen av risikofaktorer som nylig hjemkomst, forlenget opphold eller reiser i Sørøst-Asia (siden 2018)

Rektale vattpinner vil bli tatt av alle inkluderte pasienter av pleiepersonell eller av pasientene selv. Vatter vil bli tømt på selektive medier for ESBLE (ChromID ESBLE agar - bioMérieux) og selektive medier for CPE (chromID® CARBA agar - bioMérieux og chromID® OXA-48TM agar - bioMérieux). En identifikasjon ved MALDI-TOF massespektrometri og et antibiogram på Mueller-Hinton agar vil bli utført på hver mistenkt koloni. En GeneXpert PCR (Cepheid) på mistenkte kolonier vil bli utført i fellesskap ved positiv kultur på selektivt medium for påvisning av CPE. Ved positiv GeneXpert PCR på mistenkte kolonier, vil en bekreftende GeneXpert PCR bli utført på den opprinnelige prøven.

Følgende data vil bli samlet inn fra medisinske journaler og ved spørreskjema:

• Sosiodemografiske kjennetegn ved pasienter: Alder, kjønn, fødeland, hovedbostedsland, bosted før sykehusinnleggelse
• Kjennetegn på sykehusopphold: Innleggelsesdato på avdeling, dato for innleggelse på sykehus, opprinnelse før innleggelse
• Eksponering i utlandet: Reise/sykehus i utlandet siste 12 måneder for pasienten, reise/sykehusinnleggelse i utlandet siste 12 måneder for personen(e) som bor i samme husstand som pasienten
• Eksponering for helseinstitusjoner: Sykehusinnleggelse (> 24 timer) i et helseinstitusjon i Frankrike de siste 12 månedene
• Antibiotikaeksponering: Antibiotisk behandling mottatt på undersøkelsesdagen eller de siste 3 månedene
• EBSLE/CPE-screening: Kjent CPE-vogn, endetarmsscreening for CPE allerede tatt av avdelingens helseteam

Prøvestørrelsen ble beregnet ut fra en hypotese om en prevalens av CPE-bæring. Forutsatt en prevalens på 0,5 % basert på litteraturdata med et 95 % konfidensintervall på [0,1 % - 0,9 %], bør 1195 pasienter inkluderes. Studien vil vare i 6 måneder med en inklusjonsperiode på 6 måneder; hver pasients deltakelse vil vare 1 dag.

Hovedresultatet vil være CPE-transport; CPE-bærere vil bli sammenlignet med ikke-bærere. Kategoriske variabler vil bli sammenlignet ved å bruke Chi-2-testen eller Fishers eksakte test og kontinuerlige variabler ved å bruke Students t-test eller Mann-Whitney-testen. Oddsforhold (OR) og 95 % konfidensintervaller (CI) vil bli beregnet. Alle tester vil være tosidige og signifikansnivået vil være 5 %. Åpen kildekode-programvaren R for Statistical Computing vil bli brukt for den statistiske analysen."