Rektal transport av karbapenemas-producerande enterobacteriaceae vid inläggning på ett franskt universitetssjukhus (Prev-CPE)

"Inledning Uppkomsten och spridningen av nya mycket resistenta bakterier, inklusive karbapenemas-producerande Enterobacteriaceae (CPE), är en folkhälsoutmaning med tanke på deras snabba spridning och bristen på aktiva antibiotika mot dessa bakterier. Spridningen av β-laktamasproducerande Enterobacteriaceae (ESBLE) med utökat spektrum sedan början av 2000-talet väcker oro för en potentiell liknande spridning av CPE under de kommande åren, särskilt inom sjukvården. Tidig upptäckt av CPE-bärare hos inlagda patienter med riskfaktorer för CPE-bärare är avgörande för att förhindra spridning på sjukhus samt för att vägleda empirisk antibiotikabehandling för CPE-bärare med tecken på allvarlig infektion. Prevalensen av CPE-transport vid inläggning på sjukhus är dock inte exakt känd, och inte heller faktorer associerade med CPE-transport.

Därför planerar utredarna att genomföra en systematisk screening för rektal transport av CPE vid intagning i ett urval av patienter inlagda på sjukhuset Bichat - Claude-Bernard Hospital.

Huvudmål

- För att fastställa förekomsten av CPE-bärare hos patienter inlagda på Bichat - Claude-Bernard Hospital

Sekundära mål

• För att bestämma prevalensen av ESBLE-transport hos patienter inlagda på Bichat - Claude-Bernard Hospital
• För att fastställa riskfaktorer för rektal transport av CPE och ESBLE vid inläggning
• Att uppskatta det årliga antalet patienter med rektal CPE som inte skulle ha identifierats med den nuvarande riktade screeningpolicyn
• Att uppskatta det årliga antalet sekundära fall som skulle kunna förhindras och som skulle kunna förhindras om en universell screeningpolicy tillämpades vid inläggningen (dvs för alla inlagda patienter, inte bara de med riskfaktorer).
• Att karakterisera de bakteriestammar och enzymer som identifieras i CPE-transport vid intagning.

Material och metoder Studien kommer att utföras på ett offentligt universitetssjukhus med två ställen med 1 000 bäddar i Paris (Frankrike), som tillhandahåller primär- och tertiärvård och är beläget i ett område som betjänar en stor andel utrikesfödda patienter, med ursprung huvudsakligen från Afrika.

Nuvarande kriterier för CPE-screening vid intagning på Bichat - Claude-Bernard Hospital inkluderar:

• Tidigare sjukhusvistelse i mer än 24 timmar utomlands under de senaste 12 månaderna (sedan 2010) eller
• Resa utomlands utan sjukhusvård under de senaste 12 månaderna, beroende på sjukhusvårdsavdelningen och/eller förekomsten av riskfaktorer som nyligen återvändande, förlängd vistelse eller resor i Sydostasien (sedan 2018)

Rektalprover kommer att tas från alla inkluderade patienter av vårdpersonal eller av patienterna själva. Svabbar kommer att tömmas på selektiva medier för ESBLE (ChromID ESBLE agar - bioMérieux) och selektiva medier för CPE (chromID® CARBA agar - bioMérieux och chromID® OXA-48TM agar - bioMérieux). En identifiering med MALDI-TOF-masspektrometri och ett antibiogram på Mueller-Hinton-agar kommer att utföras på varje misstänkt koloni. En GeneXpert PCR (Cepheid) på misstänkta kolonier kommer att genomföras gemensamt i händelse av en positiv odling på selektivt medium för detektion av CPE. Vid positiv GeneXpert PCR på misstänkta kolonier kommer en bekräftande GeneXpert PCR att utföras på det ursprungliga provet.

Följande data kommer att samlas in från medicinska journaler och genom frågeformulär:

• Sociodemografiska egenskaper hos patienter: Ålder, kön, födelseland, huvudsakliga bosättningsland, bostadsort före sjukhusvistelse
• Egenskaper för sjukhusvistelse: Datum för inläggning på avdelningen, datum för inläggning på sjukhus, ursprung före inläggning
• Exponering utomlands: Resa/sjukhusvistelse utomlands under de senaste 12 månaderna för patienten, resa/sjukhusinläggning utomlands under de senaste 12 månaderna för den/de som bor i samma hushåll som patienten
• Exponering för vårdinrättningar: Sjukhusvård (> 24 timmar) på en vårdinrättning i Frankrike under de senaste 12 månaderna
• Antibiotikaexponering: Antibiotisk behandling som erhållits på undersökningsdagen eller under de senaste 3 månaderna
• EBSLE/CPE-screening: Känd CPE-vagn, rektal screening för CPE som redan tagits av vårdavdelningen

Provstorleken beräknades på en hypotes om förekomst av CPE-transport. Om man antar en prevalens på 0,5 % baserat på litteraturdata med ett 95 % konfidensintervall på [0,1 % - 0,9 %] bör 1195 patienter inkluderas. Studien kommer att pågå i 6 månader med en inklusionsperiod på 6 månader; varje patients deltagande kommer att pågå i 1 dag.

Det huvudsakliga resultatet blir CPE-transport; CPE-bärare kommer att jämföras med icke-bärare. Kategoriska variabler kommer att jämföras med Chi-2-testet eller Fishers exakta test och kontinuerliga variabler med Students t-test eller Mann-Whitney-testet. Oddskvoter (OR) och 95 % konfidensintervall (CI) kommer att beräknas. Alla tester kommer att vara tvåsidiga och signifikansnivån blir 5 %. Programvaran med öppen källkod R for Statistical Computing kommer att användas för den statistiska analysen."