Trasporto rettale di Enterobacteriaceae produttrici di carbapenemasi al momento del ricovero in un ospedale universitario francese (Prev-CPE)

"Introduzione L'emergere e la diffusione di batteri emergenti altamente resistenti, comprese le Enterobacteriaceae produttrici di carbapenemasi (CPE), è una sfida per la salute pubblica data la loro rapida diffusione e la mancanza di antibiotici attivi contro questi batteri. La diffusione di Enterobacteriaceae produttrici di β-lattamasi (ESBLE) a spettro esteso dall'inizio degli anni 2000 solleva preoccupazioni per una potenziale diffusione simile di CPE nei prossimi anni, specialmente in ambito sanitario. La diagnosi precoce del portatore di CPE nei pazienti ospedalizzati con fattori di rischio per il trasporto di CPE è essenziale per prevenire la loro diffusione negli ospedali e per guidare la terapia antibiotica empirica per i portatori di CPE con segni di infezione grave. Tuttavia, la prevalenza della presenza di CPE al momento del ricovero in ospedale non è nota con precisione, né vi sono fattori associati alla presenza di CPE.

Pertanto, i ricercatori prevedono di effettuare uno screening sistematico per il trasporto rettale di CPE al momento del ricovero in un campione di pazienti ricoverati presso l'ospedale Bichat - Claude-Bernard.

Obiettivo primario

- Determinare la prevalenza di portatori di CPE nei pazienti ricoverati al Bichat - Claude-Bernard Hospital

Obiettivi secondari

• Determinare la prevalenza di portatori di ESBLE nei pazienti ricoverati al Bichat - Claude-Bernard Hospital
• Per determinare i fattori di rischio per il trasporto rettale di CPE e ESBLE al momento del ricovero
• Stimare il numero annuale di pazienti con CPE rettale che non sarebbero stati identificati con l'attuale politica di screening mirato
• Stimare il numero annuo di casi secondari che potrebbero essere prevenuti se fosse applicata una politica di screening universale al momento del ricovero (vale a dire per tutti i pazienti ospedalizzati, non solo quelli con fattori di rischio).
• Caratterizzare i ceppi batterici e gli enzimi identificati nel trasporto di CPE al momento del ricovero.

Materiali e metodi Lo studio sarà condotto presso un ospedale universitario pubblico a due siti da 1000 posti letto a Parigi (Francia), che fornisce cure primarie e terziarie ed è situato in un'area che serve un'ampia percentuale di pazienti nati all'estero, originari principalmente di Africa.

I criteri attuali per lo screening CPE al momento del ricovero al Bichat - Claude-Bernard Hospital includono:

• Storia di ospedalizzazione per più di 24 ore all'estero negli ultimi 12 mesi (dal 2010) o
• Viaggi all'estero senza ricovero negli ultimi 12 mesi, a seconda del reparto di ricovero e/o della presenza di fattori di rischio come rientro recente, soggiorno prolungato o viaggio nel sud-est asiatico (dal 2018)

I tamponi rettali verranno prelevati da tutti i pazienti inclusi dal personale infermieristico o dai pazienti stessi. I tamponi verranno scaricati su terreni selettivi per ESBLE (ChromID ESBLE agar - bioMérieux) e terreni selettivi per CPE (chromID® CARBA agar - bioMérieux e chromID® OXA-48TM agar - bioMérieux). Su ogni colonia sospetta verrà effettuata un'identificazione mediante spettrometria di massa MALDI-TOF e un antibiogramma su Mueller-Hinton agar. Una GeneXpert PCR (Cepheid) su colonie sospette sarà effettuata congiuntamente in caso di coltura positiva su terreno selettivo per la rilevazione di CPE. In caso di PCR GeneXpert positivo su colonie sospette, verrà eseguita una PCR GeneXpert di conferma sul campione nativo.

Dalla cartella clinica e dal questionario verranno raccolti i seguenti dati:

• Caratteristiche socio-demografiche dei pazienti: età, sesso, paese di nascita, paese di residenza principale, luogo di residenza prima del ricovero
• Caratteristiche della degenza: Data di ingresso in reparto, data di ingresso in ospedale, provenienza prima del ricovero
• Esposizione all'estero: viaggio/ricovero all'estero negli ultimi 12 mesi per il paziente, viaggio/ricovero all'estero negli ultimi 12 mesi per la/le persona/e che vivono nello stesso nucleo familiare del paziente
• Esposizione a strutture sanitarie: ricovero (> 24 ore) in una struttura sanitaria in Francia negli ultimi 12 mesi
• Esposizione agli antibiotici: trattamento antibiotico ricevuto il giorno dell'indagine o nei 3 mesi precedenti
• Screening EBSLE/CPE: portatore di CPE noto, screening rettale per CPE già effettuato dal team sanitario di reparto

La dimensione del campione è stata calcolata su un'ipotesi di prevalenza di portatori di CPE. Ipotizzando una prevalenza dello 0,5% basata sui dati della letteratura con un intervallo di confidenza al 95% di [0,1% - 0,9%], dovrebbero essere inclusi 1195 pazienti. Lo studio durerà 6 mesi con un periodo di inclusione di 6 mesi; la partecipazione di ogni paziente durerà 1 giorno.

Il risultato principale sarà il trasporto CPE; I vettori CPE saranno confrontati con i non vettori. Le variabili categoriche saranno confrontate utilizzando il test Chi-2 o il test esatto di Fisher e le variabili continue utilizzando il test t di Student o il test di Mann-Whitney. Verranno calcolati gli odds ratio (OR) e gli intervalli di confidenza al 95% (CI). Tutti i test saranno a due code e il livello di significatività sarà del 5%. Per l'analisi statistica verrà utilizzato il software open source R for Statistical Computing."