Rektal transport af carbapenemase-producerende enterobacteriaceae ved indlæggelse på et fransk universitetshospital (Prev-CPE)

"Introduktion Fremkomsten og spredningen af ​​nye meget resistente bakterier, herunder carbapenemase-producerende Enterobacteriaceae (CPE), er en folkesundhedsudfordring på grund af deres hurtige spredning og manglen på aktive antibiotika mod disse bakterier. Spredningen af ​​udvidet spektrum β-lactamase-producerende Enterobacteriaceae (ESBLE) siden begyndelsen af ​​2000'erne rejser bekymringer om en potentiel lignende spredning af CPE i de kommende år, især i sundhedssektoren. Tidlig påvisning af CPE-bære hos indlagte patienter med risikofaktorer for CPE-bæring er afgørende for at forhindre deres spredning på hospitaler samt for at vejlede empirisk antibiotikabehandling for CPE-bærere med tegn på alvorlig infektion. Imidlertid kendes forekomsten af ​​CPE-transport ved indlæggelse på hospitalet ikke præcist, og der er heller ikke faktorer forbundet med CPE-transport.

Derfor planlægger efterforskerne at udføre en systematisk screening for rektal transport af CPE ved indlæggelse i en prøve af patienter indlagt på Bichat - Claude-Bernard Hospital.

Primært mål

- At bestemme prævalensen af ​​CPE-bære hos patienter indlagt på Bichat - Claude-Bernard Hospital

Sekundære mål

• For at bestemme prævalensen af ​​ESBLE-transport hos patienter indlagt på Bichat - Claude-Bernard Hospital
• At bestemme risikofaktorerne for rektal transport af CPE og ESBLE ved indlæggelse
• At estimere det årlige antal patienter med rektal CPE, som ikke ville være blevet identificeret med den nuværende målrettede screeningspolitik
• At estimere det årlige antal sekundære tilfælde, der kunne forhindres, og som kunne forhindres, hvis en universel screeningspolitik blev anvendt ved indlæggelsen (dvs. for alle indlagte patienter, ikke kun dem med risikofaktorer).
• At karakterisere de bakteriestammer og enzymer, der identificeres i CPE-transport ved indlæggelse.

Materialer og metoder Undersøgelsen vil blive udført på et to-sites 1000-sengs offentligt universitetshospital i Paris (Frankrig), som yder primær og tertiær pleje og er beliggende i et område, der betjener en stor del af udenlandskfødte patienter, der hovedsageligt stammer fra Afrika.

De nuværende kriterier for CPE-screening ved indlæggelse på Bichat - Claude-Bernard Hospital inkluderer:

• Anamnese med indlæggelse i mere end 24 timer i udlandet inden for de sidste 12 måneder (siden 2010) eller
• Rejser til udlandet uden hospitalsindlæggelse inden for de sidste 12 måneder, afhængigt af indlæggelsesafdelingen og/eller tilstedeværelsen af ​​risikofaktorer såsom nylig hjemkomst, forlænget ophold eller rejser i Sydøstasien (siden 2018)

Rektale podninger vil blive taget fra alle inkluderede patienter af plejepersonalet eller af patienterne selv. Podninger vil blive udledt på selektive medier for ESBLE (ChromID ESBLE agar - bioMérieux) og selektive medier for CPE (chromID® CARBA agar - bioMérieux og chromID® OXA-48TM agar - bioMérieux). En identifikation ved MALDI-TOF massespektrometri og et antibiogram på Mueller-Hinton agar vil blive udført på hver mistænkt koloni. En GeneXpert PCR (Cepheid) på mistænkte kolonier vil blive udført i fællesskab i tilfælde af en positiv dyrkning på selektivt medium til påvisning af CPE. I tilfælde af en positiv GeneXpert PCR på mistænkte kolonier, vil en bekræftende GeneXpert PCR blive udført på den native prøve.

Følgende data vil blive indsamlet fra lægejournaler og via spørgeskema:

• Sociodemografiske karakteristika for patienter: Alder, køn, fødeland, hovedbopælsland, bopæl før indlæggelse
• Karakteristika for hospitalsophold: dato for indlæggelse på afdelingen, dato for indlæggelse på hospitalet, oprindelse før indlæggelse
• Eksponering i udlandet: Rejse/indlæggelse i udlandet inden for de seneste 12 måneder for patienten, rejse/indlæggelse i udlandet inden for de seneste 12 måneder for den/de, der bor i samme husstand som patienten
• Eksponering for sundhedsfaciliteter: Hospitalsindlæggelse (> 24 timer) på en sundhedsfacilitet i Frankrig inden for de sidste 12 måneder
• Antibiotisk eksponering: Antibiotisk behandling modtaget på undersøgelsesdagen eller inden for de foregående 3 måneder
• EBSLE/CPE-screening: Kendt CPE-vogn, rektal screening for CPE, som allerede er taget af afdelingens sundhedsteam

Prøvestørrelsen blev beregnet ud fra en hypotese om en prævalens af CPE-transport. Forudsat en prævalens på 0,5 % baseret på litteraturdata med et 95 % konfidensinterval på [0,1 % - 0,9 %], bør 1195 patienter inkluderes. Undersøgelsen vil vare 6 måneder med en inklusionsperiode på 6 måneder; hver patients deltagelse vil vare 1 dag.

Hovedresultatet vil være CPE-transport; CPE-bærere vil blive sammenlignet med ikke-bærere. Kategoriske variabler vil blive sammenlignet ved hjælp af Chi-2-testen eller Fishers eksakte test og kontinuerte variabler ved hjælp af Students t-test eller Mann-Whitney-testen. Oddsforhold (OR) og 95 % konfidensintervaller (CI) vil blive beregnet. Alle tests vil være to-halede, og signifikansniveauet vil være 5%. Open source-softwaren R for Statistical Computing vil blive brugt til den statistiske analyse."