Plazmatická hostitelsko-mikrobiální proteomika pro predikci komplikací u vysoce rizikové febrilní neutropenie
Multicentrická prospektivní observační studie plazmatického proteomického profilování lidských a mikrobiálních proteinů pro včasnou identifikaci kombinací biomarkerů (kombitypů) spojených s komplikacemi u onkohematologických pacientů s febrilní neutropenií
Febrilní neutropenie (FN) je běžná onkologická urgentní situace u pacientů s hematologickými malignitami, spojená s vysokou morbiditou a mortalitou. Včasná identifikace pacientů s vyšším rizikem komplikací, jako je sepse nebo septický šok, je klíčová pro optimalizaci antimikrobiální léčby.
Tato studie si klade za cíl charakterizovat lidský a mikrobiální plazmatický proteom pomocí vysokoúčinné hmotnostní spektrometrie, aby identifikovala kombinace biomarkerů ("combitypy") schopné předpovídat komplikace u onkohematologických pacientů s FN.
Kohorta 350 dospělých pacientů s vysokorizikovou FN a zpočátku nekomplikovaným klinickým obrazem bude zařazena ve třech terciárních nemocnicích. Vzorky plazmy budou odebrány při nástupu horečky (před zahájením antibiotické léčby) a po 48 hodinách. Proteomická data budou integrována s klinickými informacemi pomocí multivariačních a strojových učicích modelů k vývoji prediktivního modelu pro komplikace.
Přehled studie
Postavení
Podmínky
Detailní popis
Tato multicentrická, prospektivní, observační studie vyhodnotí, zda kombinované proteomické profily hostitelského a mikrobiálního původu mohou předpovídat komplikace u pacientů s hematologickými malignitami s vysokorizikovou febrilní neutropenií (FN).
FN je definována jako orální teplota ≥38,3 °C jednou nebo ≥38,0 °C po dobu ≥1 hodiny u pacientů s absolutním počtem neutrofilů (ANC) <500 buněk/mm³ nebo u nichž se očekává pokles pod tuto hranici do 48 hodin. Navzdory empirické širokospektrální antibiotické léčbě se u až 50 % těchto pacientů vyvine sepse a 10 % přejde do septického šoku.
Stávající biomarkery, jako je C-reaktivní protein (CRP) nebo prokalcitonin (PCT), mají u této imunokompromitované populace omezenou specificitu. Tato studie navrhuje nový integrativní proteomický přístup založený na hmotnostní spektrometrii pro současné kvantifikování hostitelských a mikrobiálních proteinů v plazmě, identifikující molekulární vzorce spojené s nepříznivými výsledky.
Vzorky plazmy (10 ml, EDTA) budou získány ve dvou časových bodech: při prvním febrilním epizodě (před podáním antibiotik) a 48 hodin poté. Proteiny budou zpracovány pomocí technologie PreOmics® ENRICHplus a analyzovány pomocí LC-MS/MS na platformě Evosep One-timsTOF Pro2. Diferencovaně exprimované proteiny budou identifikovány pomocí pracovního postupu datově nezávislé akvizice (DIA-PASEF) a ověřeny v podskupině 200 pacientů cílenou hmotnostní spektrometrií.
Klinická, analytická a mikrobiologická data budou shromažďována prostřednictvím platformy REDCap. Pro vytvoření prediktivního rizikového modelu pro komplikace, integrujícího proteomická a klinická data, budou použity modely strojového učení (XGBoost, SHAP interpretabilita).
Očekává se, že tato studie vytvoří nový nástroj pro podporu rozhodování pro časnou identifikaci pacientů s vysokorizikovou FN, což usnadní personalizované antimikrobiální strategie a zlepšení prognózy.
Typ studie
Zápis (Odhadovaný)
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
- Jméno: Jesús Francisco Bermejo Martín, MD PhD
- Telefonní číslo: +34923 29 45 41
- E-mail: jfbermejo@usal.es
Studijní záloha kontaktů
- Jméno: Nadia García Mateo, PhD
- Telefonní číslo: +34923 29 45 41
- E-mail: nadiagarciamateo@ibsal.es
Studijní místa
-
-
Barcelona
-
Barcelona, Barcelona, Španělsko
- Hospital Universitari Vall d'Hebron
-
-
Salamanca
-
Salamanca, Salamanca, Španělsko, 37007
- Complejo Asistencial Universitario de Salamanca
-
Kontakt:
- Jesús Francisco Bermejo Martín, PhD
- Telefonní číslo: +34923 29 45 41
- E-mail: jfbermejo@usal.es
-
-
Sevilla
-
Seville, Sevilla, Španělsko
- Hospital Universitario Virgen Macarena
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dospělý
- Starší dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Inkluzní kritéria:
- Dospělí (≥18 let).
- Písemný informovaný souhlas poskytnutý pacientem nebo zákonným zástupcem.
- Diagnóza hematologické malignity podstupující indukční chemoterapii, po alogenní transplantaci hematopoetických kmenových buněk nebo CAR-T terapii.
- Vysokoriziková febrilní neutropenie (ANC ≤ 100 buněk/mm³, očekávané trvání ≥ 7 dní, nebo významné komorbidity).
- Horečka definovaná jako orální teplota ≥38,3 °C jednorázově nebo ≥38,0 °C po dobu ≥1 hodiny.
Hospitalizovaný nebo vyžadující okamžitou hospitalizaci v době diagnózy FN.
- Počáteční nekomplikovaný klinický obraz, bez předchozí infekce nebo kolonizace multirezistentními bakteriemi.
- Způsobilý pro počáteční monoterapii širokospektrým empirickým antibiotikem.
- Dostupnost pro sériové odběry plazmy a klinické sledování.
Exkluzní kritéria:
- Věk <18 let.
- Nízkorizikový FN podle kritérií MASCC/CISNE.
- Počáteční vzorek odebrán po podání antibiotik.
- Odmítnutí nebo neschopnost poskytnout informovaný souhlas.
- Jakýkoli stav znemožňující bezpečnou účast nebo spolehlivý odběr vzorků.
- Horečka vyvolaná neinfekčními příčinami (považováno za adjustační faktor, nikoli za vylučující kritérium).
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
Intervence / Léčba |
|---|---|
|
Kohorta s vysokým rizikem FN
Dospělí onko-hematologičtí pacienti hospitalizovaní splňující inkluzní kritéria; dva odběry plazmy při nástupu horečky a za 48 hodin.
|
Odběr 10 ml periferní krve do zkumavek s EDTA při nástupu horečky (před zahájením antibiotické léčby) a o 48 hodin později pro proteomickou a genomickou analýzu.
Vzorky jsou zpracovány k získání plazmy a DNA, které budou použity pro proteomiku založenou na hmotnostní spektrometrii a potenciální metagenomické studie.
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Identifikace plazmatických hostitelsko-mikrobiálních proteomických signatur (kombitypů) spojených s hlavními komplikacemi u febrilní neutropenie.
Časové okno: Do 7 dnů od nástupu horečky.
|
Hodnocení proteomických profilů (lidských a mikrobiálních) spojených s hemodynamickou nestabilitou, sepsí, septickým šokem nebo úmrtím.
|
Do 7 dnů od nástupu horečky.
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Dynamické změny v plazmatickém proteomu během 48 hodin
Časové okno: 0-48 hodin
|
Posouzení longitudinálních variací v hladinách hostitelských a mikrobiálních proteinů mezi výchozím stavem a 48 hodinami.
|
0-48 hodin
|
|
Prediktivní výkon identifikovaných kombitypů versus konvenční biomarkery (CRP, PCT)
Časové okno: Až 7 dní.
|
Porovnání ROC-AUC pro nové proteomické modely s aktuálními zánětlivými markery.
|
Až 7 dní.
|
|
Korelace mezi mikrobiálními proteomickými profily a mikrobiologicky dokumentovanými infekcemi
Časové okno: Během hospitalizace (až 30 dní).
|
Souvislost mezi detekovanými mikrobiálními peptidy a potvrzenými patogeny.
|
Během hospitalizace (až 30 dní).
|
|
Vývoj prediktivního modelu pro komplikace
Časové okno: Doba trvání studie (36 měsíců).
|
Prediktivní model rizik komplikací bude vyvinut pomocí algoritmů strojového učení (XGBoost) na základě integrace plazmatických proteomických dat a relevantních klinických parametrů shromážděných při nástupu horečky a během sledování.
Model bude trénován a interně validován v rámci celé kohorty studie pomocí technik křížové validace za účelem optimalizace prediktivního výkonu a minimalizace přetrénování.
|
Doba trvání studie (36 měsíců).
|
|
Validace vybraných proteinových biomarkerů pomocí cílené hmotnostní spektrometrie
Časové okno: Do konce studie (měsíc 36).
|
Vybrané proteinové biomarkery dříve identifikované prostřednictvím proteomického profilování v objevovací fázi budou validovány pomocí cílené hmotnostní spektrometrie LC-MS/MS v plazmatických vzorcích od 200 pacientů v rámci studijní kohorty.
Tato validační fáze posoudí analytickou výkonnost (včetně reprodukovatelnosti, přesnosti a citlivosti) vybraných biomarkerů, stejně jako jejich klinický význam při predikci komplikací, jako je hemodynamická nestabilita, sepse, septický šok nebo úmrtí.
Tento výsledek nelze rozdělit na samostatné, protože exprese biomarkerů bude analyzována jako celek, vzhledem k tomu, že dokud studie nezačne, budou biomarkery spojené s komplikacemi u onkohematologických pacientů s febrilní neutropenií neznámé.
Tento výsledek určí proveditelnost implementace identifikovaných biomarkerů jako prognostických nástrojů v rutinní klinické praxi pro časnou rizikovou stratifikaci pacientů.
|
Do konce studie (měsíc 36).
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Jesús Francisco Bermejo Martín, MD PhD, Centro Asistencial Universitario de Salamanca (CAUSA)
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Odhadovaný)
Primární dokončení (Odhadovaný)
Dokončení studie (Odhadovaný)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
- Cytopenie
- Patologické procesy
- Novotvary podle místa
- Novotvary
- Infekce
- Syndrom systémové zánětlivé odpovědi
- Zánět
- Poruchy leukocytů
- Hematologická onemocnění
- Leukopenie
- Šokovat
- Agranulocytóza
- Neutropenie
- Patologické stavy, příznaky a symptomy
- Hemická a lymfatická onemocnění
- Hematologické novotvary
- Sepse
- Šok, septik
- Febrilní neutropenie
Další identifikační čísla studie
- COMBITYPES-FN
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Popis plánu IPD
Po anonymizaci budou zpřístupněna data na úrovni jednotlivých účastníků, která podporují publikace. Tato data zahrnují demografické a klinické proměnné shromážděné v REDCap. Bude také poskytnut datový slovník, eCRF a - pokud možno - analytické skripty (R/Python) a metadata odpovídající principům FAIR.
Data budou hostována v rámci kontrolované infrastruktury projektu (XNAT/Core-lab) a pro kontrolované šíření v komunitě Zenodo IBSAL, s přidělením DOI a regulovaným přístupem, v souladu s GDPR/LOPDGDD a studijním protokolem schváleným Etickou komisí pro výzkum.
Časový rámec sdílení IPD
Kritéria přístupu pro sdílení IPD
Typ podpůrných informací pro sdílení IPD
- PROTOKOL STUDY
- ICF
- CSR
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .