Plasma gastheer-microbioom proteomics om complicaties te voorspellen bij hoog-risico febriele neutropenie
Een multicenter prospectief observationeel onderzoek naar de plasma proteomische profilering van humane en microbiële eiwitten voor de vroege identificatie van biomarkercombinaties (Combitypes) geassocieerd met complicaties bij oncohematologische patiënten met febriele neutropenie
Febriele neutropenie (FN) is een veelvoorkomende oncologische noodsituatie bij patiënten met hematologische maligniteiten, geassocieerd met hoge morbiditeit en mortaliteit. Vroege identificatie van patiënten met een hoger risico op complicaties zoals sepsis of septische shock is cruciaal om het antimicrobiële beheer te optimaliseren.
Deze studie heeft als doel het menselijke en microbiële plasma-proteoom te karakteriseren met behulp van hoge-resolutie massaspectrometrie om biomarkercombinaties ("combitypes") te identificeren die in staat zijn complicaties te voorspellen bij oncohematologische patiënten met FN.
Een cohort van 350 volwassen patiënten met hoogrisico FN en aanvankelijk ongecompliceerde klinische presentatie zal worden opgenomen in drie tertiaire ziekenhuizen. Plasma-monsters zullen worden verzameld bij het begin van de koorts (vóór het starten van antibiotica) en na 48 uur. Proteomische gegevens zullen worden geïntegreerd met klinische informatie met behulp van multivariate en machine learning-modellen om een voorspellend model voor complicaties te ontwikkelen.
Studie Overzicht
Toestand
Conditie
Interventie / Behandeling
Gedetailleerde beschrijving
Deze multicenter, prospectieve, observationele studie zal evalueren of gecombineerde proteomische profielen van gastheer- en microbiële oorsprong complicaties kunnen voorspellen bij patiënten met hematologische maligniteiten die zich presenteren met hoog-risico febriele neutropenie (FN).
FN wordt gedefinieerd als een orale temperatuur ≥38,3 °C eenmaal of ≥38,0 °C gedurende ≥1 uur bij patiënten met een absoluut neutrofiel aantal (ANC) <500 cellen/mm³ of waarvan verwacht wordt dat dit binnen 48 uur onder deze drempelwaarde daalt. Ondanks empirische breedspectrumantibiotica ontwikkelt tot 50% van deze patiënten sepsis en 10% vordert tot septische shock.
Huidige biomarkers zoals C-reactief proteïne (CRP) of procalcitonine (PCT) hebben beperkte specificiteit in deze immuungecompromitteerde populatie. Deze studie stelt een nieuwe integratieve proteomische benadering voor op basis van massaspectrometrie om simultaan gastheer- en microbiële eiwitten in plasma te kwantificeren, waarbij moleculaire patronen geassocieerd met slechte uitkomsten worden geïdentificeerd.
Plasmamonsters (10 mL, EDTA) zullen op twee tijdstippen worden verkregen: tijdens de eerste febriele episode (vóór antibioticatoediening) en 48 uur later. Eiwitten zullen worden verwerkt met PreOmics® ENRICHplus-technologie en geanalyseerd via LC-MS/MS op een Evosep One-timsTOF Pro2-platform. Differentieel tot expressie gebrachte eiwitten zullen worden geïdentificeerd met een data-onafhankelijke acquisitie (DIA-PASEF) workflow en gevalideerd in een subset van 200 patiënten via gerichte massaspectrometrie.
Klinische, analytische en microbiologische data zullen worden verzameld via het REDCap-platform. Machine learning-modellen (XGBoost, SHAP-interpreteerbaarheid) zullen worden gebruikt om een voorspellend risicomodel voor complicaties te genereren, waarbij proteomische en klinische data worden geïntegreerd.
Van deze studie wordt verwacht dat deze een nieuw beslissingsondersteunend instrument zal vestigen voor de vroege identificatie van hoog-risico FN-patiënten, wat gepersonaliseerde antimicrobiële strategieën en verbeterde prognose vergemakkelijkt.
Studietype
Inschrijving (Geschat)
Contacten en locaties
Studiecontact
- Naam: Jesús Francisco Bermejo Martín, MD PhD
- Telefoonnummer: +34923 29 45 41
- E-mail: jfbermejo@usal.es
Studie Contact Back-up
- Naam: Nadia García Mateo, PhD
- Telefoonnummer: +34923 29 45 41
- E-mail: nadiagarciamateo@ibsal.es
Studie Locaties
-
-
Barcelona
-
Barcelona, Barcelona, Spanje
- Nog niet aan het werven
- Hospital Universitari Vall d'Hebron
-
-
Salamanca
-
Salamanca, Salamanca, Spanje, 37007
- Werving
- Complejo Asistencial Universitario de Salamanca
-
Contact:
- Jesús Francisco Bermejo Martín, PhD
- Telefoonnummer: +34923 29 45 41
- E-mail: jfbermejo@usal.es
-
-
Sevilla
-
Seville, Sevilla, Spanje
- Nog niet aan het werven
- Hospital Universitario Virgen Macarena
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
- Volwassen
- Oudere volwassene
Accepteert gezonde vrijwilligers
Bemonsteringsmethode
Studie Bevolking
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- Volwassenen (≥18 jaar).
- Schriftelijke geïnformeerde toestemming verstrekt door patiënt of wettelijke vertegenwoordiger.
- Diagnose van hematologische maligniteit onder inductiechemotherapie, na allogene hematopoëtische stamceltransplantatie, of CAR-T-therapie.
- Hoogrisico febriele neutropenie (ANC ≤ 100 cellen/mm³, verwachte duur ≥ 7 dagen, of significante comorbiditeiten).
- Koorts gedefinieerd als orale temperatuur ≥38,3 °C eenmalig of ≥38,0 °C gedurende ≥1 uur.
Gehospitaliseerd of directe opname vereist ten tijde van FN-diagnose.
- Initiële ongecompliceerde klinische presentatie, zonder eerdere infectie of kolonisatie door multiresistente bacteriën.
- In aanmerking komend voor initiële monotherapie met breedspectrum empirisch antibioticum.
- Beschikbaarheid voor seriële plasmamonsters en klinische follow-up.
Exclusiecriteria:
- Leeftijd <18 jaar.
- Laagrisico FN volgens MASCC/CISNE-criteria.
- Initieel monster verzameld na antibioticatoediening.
- Weigering of onvermogen om geïnformeerde toestemming te verstrekken.
- Elke aandoening die veilige deelname of betrouwbare monstername verhindert.
- Koorts veroorzaakt door niet-infectieuze oorzaken (beschouwd als aanpassingsfactor, geen exclusie).
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
Hoogrisico FN-cohort
Volwassen onco-hematologische patiënten die voldoen aan de inclusiecriteria; twee plasmaafnames bij koortsbegin en na 48 uur.
|
Afname van 10 mL perifeer bloed in EDTA-buizen bij koortsaanvang (vóór start van antibiotica) en 48 uur later voor proteomische en genomische analyse.
Monsters worden verwerkt om plasma en DNA te verkrijgen, die zullen worden gebruikt voor op massaspectrometrie gebaseerde proteomica en potentiële metagenomische studies.
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Identificatie van plasma gastheer-microbieel proteomische handtekeningen (combitypen) geassocieerd met belangrijke complicaties bij febriele neutropenie.
Tijdsspanne: Binnen 7 dagen na het begin van koorts.
|
Evaluatie van proteomische profielen (menselijk en microbiologisch) geassocieerd met hemodynamische instabiliteit, sepsis, septische shock of overlijden.
|
Binnen 7 dagen na het begin van koorts.
|
Secundaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Dynamische veranderingen in plasma proteoom over 48 uur
Tijdsspanne: 0-48 uur
|
Beoordeling van longitudinale variaties in gastheer- en microbiële eiwitniveaus tussen baseline en 48 uur.
|
0-48 uur
|
|
Voorspellende prestaties van geïdentificeerde combitypes versus conventionele biomarkers (CRP, PCT)
Tijdsspanne: Tot 7 dagen.
|
Vergelijking van ROC-AUC voor nieuwe proteomische modellen met huidige inflammatoire markers.
|
Tot 7 dagen.
|
|
Correlatie tussen microbiële proteoomprofielen en microbiologisch gedocumenteerde infecties
Tijdsspanne: Tijdens de ziekenhuisopname (tot 30 dagen).
|
Verband tussen gedetecteerde microbiële peptiden en bevestigde ziekteverwekkers.
|
Tijdens de ziekenhuisopname (tot 30 dagen).
|
|
Ontwikkeling van een voorspellend model voor complicaties
Tijdsspanne: Studieduur (36 maanden).
|
Er zal een voorspellend risicomodel voor complicaties worden ontwikkeld met behulp van machine-learning algoritmen (XGBoost), gebaseerd op de integratie van plasma-proteomische gegevens en relevante klinische parameters die bij koortsaanvang en tijdens de follow-up zijn verzameld.
Het model zal worden getraind en intern gevalideerd binnen de volledige studiecohort met behulp van kruisvalidatietechnieken om de voorspellende prestaties te optimaliseren en overfitting te minimaliseren.
|
Studieduur (36 maanden).
|
|
Validatie van geselecteerde proteïne biomarkers door gerichte massaspectrometrie
Tijdsspanne: Einde van de studie (maand 36).
|
Geselecteerde eiwitbiomarkers die eerder zijn geïdentificeerd via proteomische profilering in de ontdekkingsfase, zullen worden gevalideerd met behulp van gerichte LC-MS/MS-massaspectrometrie in plasmonsters van 200 patiënten binnen de studiecohort.
Deze validatiefase zal de analytische prestaties (inclusief reproduceerbaarheid, nauwkeurigheid en gevoeligheid) van de geselecteerde biomarkers beoordelen, evenals hun klinische relevantie bij het voorspellen van complicaties zoals hemodynamische instabiliteit, sepsis, septische shock of overlijden.
Dit resultaat kan niet worden opgesplitst in afzonderlijke resultaten, aangezien de biomarker-expressie als geheel zal worden geanalyseerd, gegeven het feit dat tot het begin van de studie de biomarkers die geassocieerd zijn met complicaties bij oncohematologische patiënten met febriele neutropenie onbekend zullen zijn.
Dit resultaat zal de haalbaarheid bepalen van het implementeren van de geïdentificeerde biomarkers als prognostische hulpmiddelen in de routinematige klinische praktijk voor de vroege risicostratificatie van patiënten.
|
Einde van de studie (maand 36).
|
Medewerkers en onderzoekers
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: Jesús Francisco Bermejo Martín, MD PhD, Centro Asistencial Universitario de Salamanca (CAUSA)
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
Primaire voltooiing (Geschat)
Studie voltooiing (Geschat)
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Werkelijk)
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Trefwoorden
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
- Cytopenie
- Pathologische processen
- Neoplasmata per site
- Neoplasmata
- Infecties
- Systemisch ontstekingsreactiesyndroom
- Ontsteking
- Leukocytenstoornissen
- Hematologische ziekten
- Leukopenie
- Schok
- Agranulocytose
- Neutropenie
- Pathologische aandoeningen, tekenen en symptomen
- Hemische en lymfatische ziekten
- Hematologische neoplasmata
- Sepsis
- Schok, septisch
- Febriele neutropenie
Andere studie-ID-nummers
- COMBITYPES-FN
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
Beschrijving IPD-plan
Na anonimisatie zullen de individuele deelnemersgegevens die de publicaties ondersteunen beschikbaar worden gesteld. Deze gegevens omvatten demografische en klinische variabelen die in REDCap zijn verzameld. Een gegevenswoordenboek, eCRF, en - waar mogelijk - analysescripts (R/Python) en FAIR-conforme metadata zullen ook worden verstrekt.
De gegevens worden gehost binnen de gecontroleerde infrastructuur van het project (XNAT/Core-lab) en, voor gecontroleerde verspreiding, binnen de Zenodo-gemeenschap van IBSAL, met DOI-toewijzing en gereguleerde toegang, in overeenstemming met de GDPR/LOPDGDD en het onderzoeksprotocol zoals goedgekeurd door de ethische commissie voor onderzoek.
IPD-tijdsbestek voor delen
IPD-toegangscriteria voor delen
IPD delen Ondersteunend informatietype
- LEERPROTOCOOL
- ICF
- MVO
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .