Plasma värd-mikrobproteomik för att förutsäga komplikationer vid högriskfebril neutropeni
En Multicenter Prospektiv Observationsstudie om Plasma Proteomisk Profilering av Mänskliga och Mikrobiella Proteiner för Tidig Identifiering av Biomarkörkombinationer (Combityper) Förknippade med Komplikationer hos Onkohematologiska Patienter med Febril Neutropeni
Febril neutropeni (FN) är ett vanligt onkologiskt akutillstånd hos patienter med hematologiska maligniteter, associerat med hög morbiditet och mortalitet. Tidig identifiering av patienter med högre risk för komplikationer som sepsis eller septisk chock är avgörande för att optimera antimikrobiell behandling.
Denna studie syftar till att karakterisera det humana och mikrobiella plasmaproteomet med högupplöst masspektrometri för att identifiera biomarkörkombinationer ("combityper") som kan förutsäga komplikationer hos onkohematologiska patienter med FN.
En kohort på 350 vuxna patienter med högrisk-FN och initialt okomplicerad klinisk presentation kommer att rekryteras från tre tertiärsjukhus. Plasmaprov kommer att samlas in vid feberdebut (före antibiotikainitiering) och efter 48 timmar. Proteomdata kommer att integreras med klinisk information med multivariata och maskininlärningsmodeller för att utveckla en prediktiv modell för komplikationer.
Studieöversikt
Status
Betingelser
Intervention / Behandling
Detaljerad beskrivning
Denna multicenter, prospektiva, observationsstudie kommer att utvärdera om kombinerade proteomprofiler av värd- och mikrobiellt ursprung kan förutsäga komplikationer hos patienter med hematologiska maligniteter som presenterar högrisk febri neutropeni (FN).
FN definieras som en oraltemperatur ≥38,3 °C en gång eller ≥38,0 °C i ≥1 timme hos patienter med ett absolut neutrofilantal (ANC) <500 celler/mm³ eller förväntas sjunka under denna tröskel inom 48 timmar. Trots empiriska bredspektrumantibiotika utvecklar upp till 50 % av dessa patienter sepsis, och 10 % övergår till septisk chock.
Nuvarande biomarkörer såsom C-reaktivt protein (CRP) eller prokalcitonin (PCT) har begränsad specificitet i denna immunsupprimerade population. Denna studie föreslår ett nytt integrerat proteomtillvägagångssätt baserat på masspektrometri för att samtidigt kvantifiera värd- och mikrobiella proteiner i plasma, med identifiering av molekylära mönster associerade med dåliga utfall.
Plasmaprov (10 ml, EDTA) kommer att tas vid två tidpunkter: den första febrila episoden (före antibiotikabehandling) och 48 timmar senare. Proteinerna kommer att bearbetas med PreOmics® ENRICHplus-teknik och analyseras via LC-MS/MS på en Evosep One-timsTOF Pro2-plattform. Differentiellt uttryckta proteiner kommer att identifieras med ett dataoberoende inhämtningsarbetsflöde (DIA-PASEF) och valideras i en delmängd av 200 patienter genom målinriktad masspektrometri.
Kliniska, analytiska och mikrobiologiska data kommer att samlas in via REDCap-plattformen. Maskininlärningsmodeller (XGBoost, SHAP-tolkbarhet) kommer att användas för att generera en prediktiv riskmodell för komplikationer, som integrerar proteom- och kliniska data.
Denna studie förväntas etablera ett nytt beslutsstödsverktyg för tidig identifiering av högrisk FN-patienter, vilket underlättar personaliserade antimikrobiella strategier och förbättrad prognos.
Studietyp
Inskrivning (Beräknad)
Kontakter och platser
Studiekontakt
- Namn: Jesús Francisco Bermejo Martín, MD PhD
- Telefonnummer: +34923 29 45 41
- E-post: jfbermejo@usal.es
Studera Kontakt Backup
- Namn: Nadia García Mateo, PhD
- Telefonnummer: +34923 29 45 41
- E-post: nadiagarciamateo@ibsal.es
Studieorter
-
-
Barcelona
-
Barcelona, Barcelona, Spanien
- Har inte rekryterat ännu
- Hospital Universitari Vall d'Hebron
-
-
Salamanca
-
Salamanca, Salamanca, Spanien, 37007
- Rekrytering
- Complejo Asistencial Universitario de Salamanca
-
Kontakt:
- Jesús Francisco Bermejo Martín, PhD
- Telefonnummer: +34923 29 45 41
- E-post: jfbermejo@usal.es
-
-
Sevilla
-
Seville, Sevilla, Spanien
- Har inte rekryterat ännu
- Hospital Universitario Virgen Macarena
-
-
Deltagandekriterier
Urvalskriterier
Åldrar som är berättigade till studier
- Vuxen
- Äldre vuxen
Tar emot friska volontärer
Testmetod
Studera befolkning
Beskrivning
Inklusionskriterier:
- Vuxna (≥18 år).
- Skriftligt informerat samtycke lämnat av patient eller laglig företrädare.
- Diagnos av hematologisk malignitet under induktionskemoterapi, efter allogen hematopoetisk stamcellstransplantation eller CAR-T-terapi.
- Högrisk febri neutropeni (ANC ≤ 100 celler/mm³, förväntad varaktighet ≥ 7 dagar, eller signifikanta komorbiditeter).
- Feber definierad som oral temperatur ≥38,3 °C en gång eller ≥38,0 °C i ≥1 timme.
Inlagd på sjukhus eller kräver omedelbar inläggning vid tidpunkten för FN-diagnos.
- Inledande okomplicerad klinisk presentation, utan tidigare infektion eller kolonisering av multiresistenta bakterier.
- Behörig för initial monoterapi med bredspektrum empiriskt antibiotikum.
- Tillgänglig för seriell plasmaprovtagning och klinisk uppföljning.
Exklusionskriterier:
- Ålder <18 år.
- Lågrisk FN enligt MASCC/CISNE-kriterier.
- Inledande prov insamlat efter antibiotikabehandling.
- Avböjer eller oförmögen att lämna informerat samtycke.
- Alla tillstånd som förhindrar säker deltagande eller tillförlitlig provinsamling.
- Feber inducerad av icke-infektiösa orsaker (betraktas som justeringsfaktor, inte exklusion).
Studieplan
Hur är studien utformad?
Designdetaljer
Kohorter och interventioner
Grupp / Kohort |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
Kohort med hög risk för febril neutropeni
Vuxna onko-hematologiska inlagda patienter som uppfyller inklusionskriterierna; två plasmaprovtagningar vid feberdebut och efter 48 h.
|
Insamling av 10 ml perifert blod i EDTA-rör vid feberdebut (före antibiotikabehandling) och 48 timmar senare för proteomisk och genomisk analys.
Prover bearbetas för att erhålla plasma och DNA, som kommer att användas för masspektrometribaserad proteomik och potentiella metagenomiska studier.
|
Vad mäter studien?
Primära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
Identifiering av plasma värd-mikrobiella proteomiska signaturer (combityper) associerade med större komplikationer vid febril neutropeni.
Tidsram: Inom 7 dagar från feberdebut.
|
Utvärdering av proteomiska profiler (mänskliga och mikrobiella) associerade med hemodynamisk instabilitet, sepsis, septisk chock eller död.
|
Inom 7 dagar från feberdebut.
|
Sekundära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
Dynamiska förändringar i plasmaproteomet över 48 timmar
Tidsram: 0-48 timmar
|
Bedömning av longitudinella variationer i värd- och mikrobiella proteinhalter mellan baslinjen och 48 timmar.
|
0-48 timmar
|
|
Prediktiva prestanda för identifierade kombinationstyper kontra konventionella biomarkörer (CRP, PCT)
Tidsram: Upp till 7 dagar.
|
Jämförelse av ROC-AUC för nya proteomiska modeller mot nuvarande inflammatoriska markörer.
|
Upp till 7 dagar.
|
|
Korrelation mellan mikrobiella proteomprofiler och mikrobiologiskt dokumenterade infektioner
Tidsram: Under sjukhusvistelsen (upp till 30 dagar).
|
Samband mellan detekterade mikrobiella peptider och bekräftade patogener.
|
Under sjukhusvistelsen (upp till 30 dagar).
|
|
Utveckling av en prediktiv modell för komplikationer
Tidsram: Studiens varaktighet (36 månader).
|
En prediktiv riskmodell för komplikationer kommer att utvecklas med hjälp av maskininlärningsalgoritmer (XGBoost) baserat på integrationen av plasma proteomdata och relevanta kliniska parametrar som samlats in vid feberdebut och under uppföljningen.
Modellen kommer att tränas och valideras internt inom hela studiepopulationen med hjälp av korsvalideringstekniker för att optimera prediktiv prestanda och minimera överanpassning.
|
Studiens varaktighet (36 månader).
|
|
Validering av utvalda proteinbiomarkörer med målstyrd masspektrometri
Tidsram: Vid studiens slut (månad 36).
|
Utvalda proteinbiomarkörer som tidigare identifierats genom proteomisk profilering i upptäcktsfasen kommer att valideras med riktad LC-MS/MS-masspektrometri i plasmaprov från 200 patienter inom studiekoorten.
Denna valideringsfas kommer att utvärdera de utvalda biomarkörernas analytiska prestanda (inklusive reproducerbarhet, noggrannhet och känslighet) samt deras kliniska relevans för att förutsäga komplikationer såsom hemodynamisk instabilitet, sepsis, septisk chock eller död.
Detta utfall kan inte delas upp i separata utfall, eftersom biomarköruttrycket kommer att analyseras som en helhet, med tanke på att biomarkörerna associerade med komplikationer hos onkohematologiska patienter med febril neutropeni kommer att vara okända fram till att försöket börjar.
Detta utfall kommer att avgöra genomförbarheten av att implementera de identifierade biomarkörerna som prognostiska verktyg i rutinmässig klinisk praxis för tidig riskstratifiering av patienter.
|
Vid studiens slut (månad 36).
|
Samarbetspartners och utredare
Utredare
- Huvudutredare: Jesús Francisco Bermejo Martín, MD PhD, Centro Asistencial Universitario de Salamanca (CAUSA)
Studieavstämningsdatum
Studera stora datum
Studiestart (Faktisk)
Primärt slutförande (Beräknad)
Avslutad studie (Beräknad)
Studieregistreringsdatum
Först inskickad
Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna
Första postat (Faktisk)
Uppdateringar av studier
Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)
Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna
Senast verifierad
Mer information
Termer relaterade till denna studie
Nyckelord
Ytterligare relevanta MeSH-villkor
- Cytopeni
- Patologiska processer
- Neoplasmer efter plats
- Neoplasmer
- Infektioner
- Systemiskt inflammatoriskt svarssyndrom
- Inflammation
- Leukocytstörningar
- Hematologiska sjukdomar
- Leukopeni
- Chock
- Agranulocytos
- Neutropeni
- Patologiska tillstånd, tecken och symtom
- Hemiska och lymfsjukdomar
- Hematologiska neoplasmer
- Sepsis
- Chock, septisk
- Febril neutropeni
Andra studie-ID-nummer
- COMBITYPES-FN
Plan för individuella deltagardata (IPD)
Planerar du att dela individuella deltagardata (IPD)?
IPD-planbeskrivning
Efter anonymisering kommer individuella deltagardata som stöder publikationerna att göras tillgängliga. Dessa data inkluderar demografiska och kliniska variabler som samlats in i REDCap. En datordbok, eCRF och – när det är möjligt – analysskript (R/Python) samt FAIR-kompatibla metadata kommer också att tillhandahållas.
Data kommer att lagras inom projektets kontrollerade infrastruktur (XNAT/Core-lab) och, för kontrollerad spridning, inom IBSAL:s Zenodo-gemenskap, med DOI-tilldelning och reglerad åtkomst, i enlighet med GDPR/LOPDGDD och studieprotokollet som godkänts av forskningsetikkommittén.
Tidsram för IPD-delning
Kriterier för IPD Sharing Access
IPD-delning som stöder informationstyp
- STUDY_PROTOCOL
- ICF
- CSR
Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument
Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt
Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt
Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .