Proteomika osocza gospodarz-mikroorganizm do przewidywania powikłań w wysokiego ryzyka gorączkowej neutropenii
Wieloośrodkowe prospektywne badanie obserwacyjne dotyczące profilowania plazmatycznego białek ludzkich i mikrobiologicznych dla wczesnej identyfikacji kombinacji biomarkerów (Combitypes) związanych z powikłaniami u pacjentów onkohematologicznych z gorączkową neutropenią
Gorączkowa neutropenia (FN) to częsty stan nagły w onkologii u pacjentów z nowotworami hematologicznymi, związany z wysoką zachorowalnością i śmiertelnością. Wczesne zidentyfikowanie pacjentów z wyższym ryzykiem powikłań, takich jak posocznica lub wstrząs septyczny, ma kluczowe znaczenie dla optymalizacji leczenia przeciwdrobnoustrojowego.
Niniejsze badanie ma na celu scharakteryzowanie ludzkiego i mikrobiologicznego proteomu osocza przy użyciu spektrometrii mas wysokiej rozdzielczości w celu zidentyfikowania kombinacji biomarkerów („combitypów”) zdolnych do przewidywania powikłań u pacjentów onkohematologicznych z FN.
Kohortę 350 dorosłych pacjentów z wysokim ryzykiem FN i początkowo niepowikłanym obrazem klinicznym zostanie włączona w trzech szpitalach trzeciego stopnia referencyjności. Próbki osocza będą pobierane w momencie wystąpienia gorączki (przed rozpoczęciem antybiotykoterapii) oraz po 48 godzinach. Dane proteomiczne zostaną zintegrowane z informacjami klinicznymi przy użyciu modeli wielowymiarowych i uczenia maszynowego w celu opracowania modelu predykcyjnego dla powikłań.
Przegląd badań
Status
Warunki
Interwencja / Leczenie
Szczegółowy opis
To wieloośrodkowe, prospektywne, obserwacyjne badanie oceni, czy połączone profile proteomiczne pochodzenia gospodarza i mikrobiologicznego mogą przewidywać powikłania u pacjentów z nowotworami hematologicznymi z wysokim ryzykiem gorączki neutropenicznej (FN).
FN definiuje się jako temperaturę w jamie ustnej ≥38,3 °C raz lub ≥38,0 °C przez ≥1 godzinę u pacjentów z bezwzględną liczbą neutrofili (ANC) <500 komórek/mm³ lub oczekiwanym spadkiem poniżej tego progu w ciągu 48 godzin. Pomimo empirycznej antybiotykoterapii szerokowidmowej, nawet 50% tych pacjentów rozwija sepsę, a 10% przechodzi w wstrząs septyczny.
Obecne biomarkery, takie jak białko C-reaktywne (CRP) lub prokalcytonina (PCT), mają ograniczoną swoistość w tej populacji z obniżoną odpornością. Badanie proponuje nowatorskie, integracyjne podejście proteomiczne oparte na spektrometrii mas do jednoczesnego ilościowego oznaczania białek gospodarza i mikrobiologicznych w osoczu, identyfikując wzorce molekularne związane z niekorzystnymi wynikami.
Próbki osocza (10 ml, EDTA) będą pobierane w dwóch punktach czasowych: podczas pierwszego epizodu gorączkowego (przed podaniem antybiotyku) oraz 48 godzin później. Białka będą przetwarzane przy użyciu technologii PreOmics® ENRICHplus i analizowane za pomocą LC-MS/MS na platformie Evosep One-timsTOF Pro2. Różnicowo ekspresjonowane białka zostaną zidentyfikowane przy użyciu niezależnego od danych procesu akwizycji (DIA-PASEF) i zweryfikowane w podgrupie 200 pacjentów poprzez ukierunkowaną spektrometrię mas.
Dane kliniczne, analityczne i mikrobiologiczne będą gromadzone za pośrednictwem platformy REDCap. Modele uczenia maszynowego (XGBoost, interpretowalność SHAP) zostaną wykorzystane do stworzenia predykcyjnego modelu ryzyka powikłań, integrującego dane proteomiczne i kliniczne.
Oczekuje się, że badanie pozwoli opracować nowe narzędzie wspomagania decyzji do wczesnej identyfikacji pacjentów z wysokim ryzykiem FN, ułatwiając spersonalizowane strategie przeciwdrobnoustrojowe i poprawę rokowania.
Typ studiów
Zapisy (Szacowany)
Kontakty i lokalizacje
Kontakt w sprawie studiów
- Nazwa: Jesús Francisco Bermejo Martín, MD PhD
- Numer telefonu: +34923 29 45 41
- E-mail: jfbermejo@usal.es
Kopia zapasowa kontaktu do badania
- Nazwa: Nadia García Mateo, PhD
- Numer telefonu: +34923 29 45 41
- E-mail: nadiagarciamateo@ibsal.es
Lokalizacje studiów
-
-
Barcelona
-
Barcelona, Barcelona, Hiszpania
- Jeszcze nie rekrutacja
- Hospital Universitari Vall d'Hebron
-
-
Salamanca
-
Salamanca, Salamanca, Hiszpania, 37007
- Rekrutacyjny
- Complejo Asistencial Universitario de Salamanca
-
Kontakt:
- Jesús Francisco Bermejo Martín, PhD
- Numer telefonu: +34923 29 45 41
- E-mail: jfbermejo@usal.es
-
-
Sevilla
-
Seville, Sevilla, Hiszpania
- Jeszcze nie rekrutacja
- Hospital Universitario Virgen Macarena
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
- Dorosły
- Starszy dorosły
Akceptuje zdrowych ochotników
Metoda próbkowania
Badana populacja
Opis
Kryteria włączenia:
- Dorośli (≥18 lat).
- Pisemną świadomą zgodę dostarczoną przez pacjenta lub przedstawiciela ustawowego.
- Rozpoznanie choroby hematologicznej poddawanej chemioterapii indukcyjnej, po allogenicznym przeszczepie krwiotwórczych komórek macierzystych lub terapii CAR-T.
- Wysokie ryzyko gorączki neutropenicznej (ANC ≤ 100 komórek/mm³, oczekiwany czas trwania ≥ 7 dni lub istotne choroby współistniejące).
- Gorączka zdefiniowana jako temperatura w jamie ustnej ≥38,3 °C jednorazowo lub ≥38,0 °C przez ≥1 godzinę.
Hospitalizacja lub wymagająca natychmiastowej hospitalizacji w momencie rozpoznania gorączki neutropenicznej.
- Początkowa nieskomplikowana prezentacja kliniczna, bez wcześniejszego zakażenia lub kolonizacji przez bakterie wielolekooporne.
- Kwalifikujący się do początkowego leczenia monoterapią empirycznym antybiotykiem o szerokim spektrum działania.
- Dostępność do serii pobrań osocza i obserwacji klinicznej.
Kryteria wyłączenia:
- Wiek <18 lat.
- Niskie ryzyko gorączki neutropenicznej według kryteriów MASCC/CISNE.
- Początkowa próbka pobrana po podaniu antybiotyku.
- Odmowa lub niemożność udzielenia świadomej zgody.
- Każdy stan uniemożliwiający bezpieczny udział lub wiarygodne pobranie próbek.
- Gorączka wywołana przyczynami niezakaźnymi (uwzględniana jako czynnik korygujący, a nie wykluczający).
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
Interwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Kohorta wysokiego ryzyka FN
Dorośli pacjenci hematologiczno-onkologiczni spełniający kryteria włączenia; dwa pobrania osocza w momencie wystąpienia gorączki i po 48 h.
|
Pobranie 10 ml krwi obwodowej do probówek z EDTA w momencie wystąpienia gorączki (przed rozpoczęciem antybiotykoterapii) i 48 godzin później do analizy proteomicznej i genomowej.
Próbki są przetwarzane w celu uzyskania osocza i DNA, które zostaną wykorzystane do proteomiki opartej na spektrometrii mas oraz potencjalnych badań metagenomowych.
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Identyfikacja plazmatycznych proteomicznych sygnatur gospodarz-drobnoustroje (kombitypy) związanych z głównymi powikłaniami w przebiegu gorączki neutropenicznej.
Ramy czasowe: W ciągu 7 dni od wystąpienia gorączki.
|
Ocena profili proteomicznych (ludzkich i mikrobiologicznych) związanych z niestabilnością hemodynamiczną, sepsą, wstrząsem septycznym lub śmiercią.
|
W ciągu 7 dni od wystąpienia gorączki.
|
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Dynamiczne zmiany w proteomie osocza w ciągu 48 godzin
Ramy czasowe: 0-48 godzin
|
Ocena podłużnych zmian w poziomach białek gospodarza i drobnoustrojów między punktem wyjściowym a 48 godziną.
|
0-48 godzin
|
|
Wydajność predykcyjna zidentyfikowanych kombitypów w porównaniu z konwencjonalnymi biomarkerami (CRP, PCT)
Ramy czasowe: Do 7 dni.
|
Porównanie ROC-AUC dla nowych modeli proteomicznych z obecnymi markerami zapalnymi.
|
Do 7 dni.
|
|
Korelacja między profilami proteomicznymi drobnoustrojów a udokumentowanymi mikrobiologicznie infekcjami
Ramy czasowe: Podczas hospitalizacji (do 30 dni).
|
Związek między wykrytymi peptydami drobnoustrojowymi a potwierdzonymi patogenami.
|
Podczas hospitalizacji (do 30 dni).
|
|
Opracowanie modelu predykcyjnego dla powikłań
Ramy czasowe: Czas trwania badania (36 miesięcy).
|
Model predykcyjny ryzyka powikłań zostanie opracowany przy użyciu algorytmów uczenia maszynowego (XGBoost) w oparciu o integrację danych proteomicznych z osocza oraz istotnych parametrów klinicznych zebranych w momencie wystąpienia gorączki i podczas obserwacji. Model zostanie wytrenowany i wewnętrznie zwalidowany w ramach całej kohorty badawczej przy użyciu technik walidacji krzyżowej w celu optymalizacji wydajności predykcyjnej i minimalizacji przeuczenia.
|
Czas trwania badania (36 miesięcy).
|
|
Walidacja wybranych biomarkerów białkowych za pomocą ukierunkowanej spektrometrii masowej
Ramy czasowe: Do końca badania (miesiąc 36).
|
Wybrane białkowe biomarkery wcześniej zidentyfikowane podczas profilowania proteomicznego w fazie odkrycia zostaną zwalidowane przy użyciu ukierunkowanej spektrometrii mas LC-MS/MS w próbkach osocza od 200 pacjentów z kohorty badawczej.
Ta faza walidacji oceni parametry analityczne (w tym powtarzalność, dokładność i czułość) wybranych biomarkerów, a także ich znaczenie kliniczne w przewidywaniu powikłań, takich jak niestabilność hemodynamiczna, sepsa, wstrząs septyczny lub zgon.
Tego wyniku nie można podzielić na osobne, ponieważ ekspresja biomarkerów będzie analizowana jako całość, z uwagi na fakt, że do rozpoczęcia badania biomarkery związane z powikłaniami u pacjentów onkohematologicznych z gorączkową neutropenią będą nieznane.
Wynik ten określi wykonalność wdrożenia zidentyfikowanych biomarkerów jako narzędzi prognostycznych w rutynowej praktyce klinicznej do wczesnej stratyfikacji ryzyka u pacjentów.
|
Do końca badania (miesiąc 36).
|
Współpracownicy i badacze
Śledczy
- Główny śledczy: Jesús Francisco Bermejo Martín, MD PhD, Centro Asistencial Universitario de Salamanca (CAUSA)
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe (Szacowany)
Ukończenie studiów (Szacowany)
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Dodatkowe istotne warunki MeSH
- Cytopenia
- Procesy patologiczne
- Nowotwory według lokalizacji
- Nowotwory
- Infekcje
- Zespół ogólnoustrojowej reakcji zapalnej
- Zapalenie
- Zaburzenia leukocytów
- Choroby hematologiczne
- Leukopenia
- Zaszokować
- Agranulocytoza
- Neutropenia
- Stany patologiczne, oznaki i objawy
- Choroby hemowe i limfatyczne
- Nowotwory hematologiczne
- Posocznica
- Szok, septyczny
- Gorączka neutropeniczna
Inne numery identyfikacyjne badania
- COMBITYPES-FN
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Opis planu IPD
Po anonimizacji udostępnione zostaną dane na poziomie poszczególnych uczestników, wspierające publikacje. Dane te obejmują zmienne demograficzne i kliniczne zebrane w REDCap. Dostarczony zostanie również słownik danych, eCRF oraz - jeśli to możliwe - skrypty analityczne (R/Python) i metadane zgodne z zasadami FAIR.
Dane będą przechowywane w kontrolowanej infrastrukturze projektu (XNAT/Core-lab), a w celu kontrolowanego rozpowszechniania - w społeczności Zenodo IBSAL, z przypisaniem DOI i regulowanym dostępem, zgodnie z RODO/LOPDGDD oraz protokołem badania zatwierdzonym przez Komisję Etyki Badań Naukowych.
Ramy czasowe udostępniania IPD
Kryteria dostępu do udostępniania IPD
Typ informacji pomocniczych dotyczących udostępniania IPD
- PROTOKÓŁ BADANIA
- ICF
- CSR
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .