- ICH GCP
- Registr klinických studií v USA
- Klinická studie NCT07556328
Histomolekulární profilování u onemocnění tenkého střeva (Deep Bowel)
Histologické a molekulární profilování v diagnostice a léčbě onemocnění tenkého střeva - prospektivní kohortová studie (studie DeepBowel)
Přehled studie
Postavení
Detailní popis
Celiakie je chronické autoimunitní onemocnění postihující přibližně 2,4 % finské populace. Navzdory pokrokům v diagnostice zůstává histologické hodnocení duodenálních biopsií zlatým standardem pro diagnostiku ve většině případů. Histologické hodnocení je však zatíženo variabilitou mezi hodnotiteli, přičemž 10% míra diagnostických chyb byla hlášena v mezinárodních multicentrických studiích.
Tato studie bude:
- Stanovovat spolehlivé digitální morfometrické referenční hodnoty (poměr klků k krypám) pro normální sliznici tenkého střeva pomocí digitalizovaných snímků biopsií a nástrojů založených na umělé inteligenci/strojovém učení;
- Zkoumat molekulární dráhy podílející se na progresi celiakie a odpovědi na léčbu prostřednictvím sekvenování RNA (RNA-Seq transkriptomika) biopsií od pacientů s celiakií a zdravých kontrol, s referenčním srovnáním s daty z klinických studií;
- Modelovat progresi onemocnění a refrakterní poškození tenkého střeva pomocí kultur střevních organoidů odvozených z biopsií celiakálních pacientů, pacientů s refrakterní celiakií a zdravých kontrol.
Vzorky z výzkumných biopsií budou zpracovány ve Výzkumném centru pro celiakii na Tampere University pod pseudonymizací. Statistické analýzy budou prováděny ve spolupráci se statistikem studie. Všechna data budou uchovávána po dobu 15 let po dokončení studie.
Typ studie
Zápis (Odhadovaný)
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
- Jméno: Juha Taavela
- Telefonní číslo: +358443400330
- E-mail: juha.taavela@tuni.fi
Studijní místa
-
-
-
Tampere, Finsko, 33720
- Nábor
- Hatanpää Specialist Medical Care
-
Kontakt:
- Juha Taavela
- Telefonní číslo: +358443400330
- E-mail: juha.taavela@tuni.fi
-
Tampere, Finsko, 33720
- Nábor
- Tampere University Hospital (Tays)
-
Kontakt:
- Juha Taavela
- Telefonní číslo: +358443400330
- E-mail: juha.taavela@tuni.fi
-
Valkeakoski, Finsko, 33720
- Nábor
- Valkeakoski Regional Hospital
-
Kontakt:
- Juha Taavela
- Telefonní číslo: +358443400330
- E-mail: juha.taavela@otuni.fi
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dospělý
- Starší dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Věk ≥ 18 let
- Klinicky indikovaná gastroskopie (endoskopie horní části zažívacího traktu)
- Písemný informovaný souhlas získaný před výkonem
- Pro skupinu 1 (zdravé kontroly): negativní protilátky proti celiakii (proti tkáňové transglutamináze a/nebo endomyziu); žádné podezření na celiakii
- Pro skupinu 2 (diagnostika celiakie): pacienti odeslaní za účelem primární diagnostiky celiakie vyžadující biopsii duodena
- Pro skupinu 3 (refrakterní poškození): potvrzené poškození sliznice tenkého střeva nereagující na bezlepkovou dietu
Kritéria pro vyloučení:
- Pro skupinu 1 (zdravé kontroly): jiná onemocnění tenkého střeva způsobující poškození sliznice, včetně Crohnovy choroby a vředů tenkého střeva
- Neschopnost poskytnout písemný informovaný souhlas
- Odmítnutí účasti
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
|---|
|
Skupina 1 – Zdravé kontroly (n = 130)
Dospělí ≥18 let podstupující klinicky indikovanou gastroskopii (např. při příznacích refluxu) bez podezření na celiakii a s negativními celiakálními protilátkami (proti tkáňové transglutamináze a/nebo endomysiu).
|
|
Skupina 2 - Diagnostická skupina celiakie (n = 130)
Dospělí pacienti odeslaní k primární diagnostice celiakie vyžadující duodenální biopsii v souladu se standardními klinickými pokyny.
|
|
Skupina 3 – Skupina refrakterního poranění tenkého střeva (n = 40)
Dospělí s poškozením sliznice tenkého střeva (atrofií klků), které nereaguje na bezlepkovou dietu, odeslaní na endoskopii k vyloučení probíhajícího histologického poškození.
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Poměr klku ke kryptě
Časové okno: Výzkumný bioptický vzorek získaný při endoskopii; digitální morfometrie provedená do ukončení studie (do 31. prosince 2025)
|
Poměr klků ke kryptám v normální duodenální sliznici stanovený digitální morfometrií
|
Výzkumný bioptický vzorek získaný při endoskopii; digitální morfometrie provedená do ukončení studie (do 31. prosince 2025)
|
|
Transkriptomické
Časové okno: Vzorek pro výzkumnou biopsii získaný během endoskopie; analýza RNA-Seq provedena do ukončení studie (do 31. prosince 2025)
|
Transkriptomický (RNA-Seq) profil duodenzní sliznice u pacientů s celiakií a zdravých kontrol
|
Vzorek pro výzkumnou biopsii získaný během endoskopie; analýza RNA-Seq provedena do ukončení studie (do 31. prosince 2025)
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Analýza obrazu založená na AI / strojovém učení
Časové okno: Po celou dobu studie až do 31. prosince 2035
|
Vývoj a validace nástroje pro analýzu obrazu založeného na AI/strojovém učení pro hodnocení poškození sliznice tenkého střeva
|
Po celou dobu studie až do 31. prosince 2035
|
|
Modely kultur organoidů celiakie
Časové okno: Po celou dobu studie až do 31. prosince 2035
|
Modely organoidových kultur celiakálních a refrakterních epiteliálních zánětlivých odpovědí tenkého střeva na buněčné a molekulární úrovni
|
Po celou dobu studie až do 31. prosince 2035
|
|
Porovnání transkriptomických profilů
Časové okno: Během studijního období do 31. prosince 2035
|
Porovnání transkriptomických profilů mezi touto kohortou a referenčním souborem dat z klinických studií s léčivy
|
Během studijního období do 31. prosince 2035
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Spolupracovníci
Publikace a užitečné odkazy
Obecné publikace
- Schuppan D, Maki M, Lundin KEA, Isola J, Friesing-Sosnik T, Taavela J, Popp A, Koskenpato J, Langhorst J, Hovde O, Lahdeaho ML, Fusco S, Schumann M, Torok HP, Kupcinskas J, Zopf Y, Lohse AW, Scheinin M, Kull K, Biedermann L, Byrnes V, Stallmach A, Jahnsen J, Zeitz J, Mohrbacher R, Greinwald R; CEC-3 Trial Group. A Randomized Trial of a Transglutaminase 2 Inhibitor for Celiac Disease. N Engl J Med. 2021 Jul 1;385(1):35-45. doi: 10.1056/NEJMoa2032441.
- Taavela J, Viiri K, Popp A, Oittinen M, Dotsenko V, Peraaho M, Staff S, Sarin J, Leon F, Maki M, Isola J. Histological, immunohistochemical and mRNA gene expression responses in coeliac disease patients challenged with gluten using PAXgene fixed paraffin-embedded duodenal biopsies. BMC Gastroenterol. 2019 Nov 15;19(1):189. doi: 10.1186/s12876-019-1089-7.
- Taavela J, Viiri K, Valimaki A, Sarin J, Salonoja K, Maki M, Isola J. Apolipoprotein A4 Defines the Villus-Crypt Border in Duodenal Specimens for Celiac Disease Morphometry. Front Immunol. 2021 Jul 29;12:713854. doi: 10.3389/fimmu.2021.713854. eCollection 2021.
- Risnes LF, Reims HM, Doyle RM, Qiao SW, Sollid LM, Lundin KEA, Christophersen A. Gluten-Free Diet Induces Rapid Changes in Phenotype and Survival Properties of Gluten-Specific T Cells in Celiac Disease. Gastroenterology. 2024 Jul;167(2):250-263. doi: 10.1053/j.gastro.2024.03.027. Epub 2024 Mar 28.
- Dotsenko V, Oittinen M, Taavela J, Popp A, Peraaho M, Staff S, Sarin J, Leon F, Isola J, Maki M, Viiri K. Genome-Wide Transcriptomic Analysis of Intestinal Mucosa in Celiac Disease Patients on a Gluten-Free Diet and Postgluten Challenge. Cell Mol Gastroenterol Hepatol. 2021;11(1):13-32. doi: 10.1016/j.jcmgh.2020.07.010. Epub 2020 Jul 31.
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Primární dokončení (Odhadovaný)
Dokončení studie (Odhadovaný)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- R25009
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Popis plánu IPD
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .