- ICH GCP
- Yhdysvaltain kliinisten tutkimusten rekisteri
- Kliininen tutkimus NCT07556328
Histomolekulaarinen profilointi ohutsuolen sairauksissa (Deep Bowel)
Ohutsuolisairauksien diagnostiikan ja hoidon histologinen ja molekulaarinen profilointi - Prospektiivinen kohorttitutkimus (DeepBowel-tutkimus)
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Yksityiskohtainen kuvaus
Keliakia on krooninen autoimmuunisairaus, joka vaikuttaa noin 2,4 prosenttiin Suomen väestöstä. Huolimatta diagnostisten menetelmien kehittymisestä, duodenum biopsyjen histologinen arviointi on edelleen kultainen standardi diagnoosissa useimmissa tapauksissa. Histologinen arviointi on kuitenkin altis arvioijien väliselle vaihtelulle, ja kansainvälisissä monikeskustutkimuksissa on raportoitu 10 %:n diagnostinen virheprosentti.
Tämä tutkimus:
- Luo luotettavat digitaaliset morfometriset viitearvot (villus-krypto-suhde) normaalille ohutsuolen limakalvolle käyttäen digitoituja biopsia dioja ja tekoäly/koneoppimispohjaisia analyysityökaluja;
- Tutkii keliakian etenemisen ja hoitovasteen taustalla olevia molekulaarisia reittejä RNA-sekvensoinnin (RNA-Seq-transkriptomiikka) avulla keliakiapotilaiden ja terveiden kontrollien biopsioista, viitevertailulla lääketutkimusaineistoon;
- Mallintaa taudin etenemistä ja vaikeahoitoista ohutsuolen vauriota käyttäen suoliston organoidiviljelmiä, jotka on johdettu keliakiapotilaiden, vaikeahoitoisten potilaiden ja terveiden kontrollien biopsioista.
Tutkimusbiopsianäytteet käsitellään Tampereen yliopiston keliakiatutkimuskeskuksessa pseudonymisoituna. Tilastolliset analyysit tehdään yhteistyössä tutkimuksen tilastotieteilijän kanssa. Kaikki data säilytetään 15 vuotta tutkimuksen päättymisen jälkeen.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
- Nimi: Juha Taavela
- Puhelinnumero: +358443400330
- Sähköposti: juha.taavela@tuni.fi
Opiskelupaikat
-
-
-
Tampere, Suomi, 33720
- Rekrytointi
- Hatanpää Specialist Medical Care
-
Ottaa yhteyttä:
- Juha Taavela
- Puhelinnumero: +358443400330
- Sähköposti: juha.taavela@tuni.fi
-
Tampere, Suomi, 33720
- Rekrytointi
- Tampere University Hospital (Tays)
-
Ottaa yhteyttä:
- Juha Taavela
- Puhelinnumero: +358443400330
- Sähköposti: juha.taavela@tuni.fi
-
Valkeakoski, Suomi, 33720
- Rekrytointi
- Valkeakoski Regional Hospital
-
Ottaa yhteyttä:
- Juha Taavela
- Puhelinnumero: +358443400330
- Sähköposti: juha.taavela@otuni.fi
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Osallistumiskriteerit:
- Ikä ≥ 18 vuotta
- Kliinisesti perusteltu ylemmän ruuansulatuskanavan tähystys (gastroskopia)
- Kirjallinen tietoinen suostumus ennen toimenpidettä
- Ryhmä 1 (terveet kontrollit): Negatiiviset keliakiavasta-aineet (anti-transglutaminaasi ja/tai anti-endomyysium); ei epäiltyä keliakiaa
- Ryhmä 2 (keliakian diagnostiikka): Lähetetty primaariseen keliakian diagnostiikkaan, joka vaatii pohjukaissuolen biopsian
- Ryhmä 3 (hoitoa kestämätön vaurio): Vahvistettu ohutsuolen limakalvovaurio, joka ei ole reagoinut gluteenittomaan ruokavalioon
Poissulkukriteerit:
- Ryhmä 1 (terveet kontrollit): Muut ohutsuolen sairaudet, jotka aiheuttavat limakalvovaurioita, mukaan lukien Crohnin tauti ja ohutsuolen haavaumat
- Kyvyttömyys antaa kirjallista tietoista suostumusta
- Kieltäytyminen osallistumasta
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
|---|
|
Ryhmä 1 - Terveet kontrollit (n = 130)
Aikuiset ≥18 vuotta, joille tehdään kliinisesti aiheellinen gastroskopia (esim. refluksioireet), ilman keliakiaepäilyä ja negatiiviset keliakian vasta-aineet (anti-transglutaminaasi ja/tai anti-endomysium).
|
|
Ryhmä 2 - keliakian diagnostinen ryhmä (n = 130)
Aikuiset, jotaka on ohjattu keliakian ensidiagnostiikkaan ja tarvitsevat ohutsuolen koepalan, tavanomaisten hoitosuositusten mukaisesti.
|
|
Ryhmä 3 - Refraktäärinen ohutsuolivaurio-ryhmä (n = 40)
Aikuiset, joilla on ohutsuolen limakalvovaurio (villousatrofia), joka ei reagoi gluteenittomaan ruokavalioon, lähetetty endoskopiaan jatkuvan histologisen vaurion poissulkemiseksi.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Nukka-poimu-suhde
Aikaikkuna: Tutkimusbiopsia saatu endoskopian yhteydessä; digitaalinen morfometria suoritettu tutkimuksen päättymiseen asti (31. joulukuuta 2025 asti)
|
Pinta-arkujen ja kryptien välinen suhde normaalissa pohjukaissuolen limakalvossa määritettynä digitaalisella morfometrialla
|
Tutkimusbiopsia saatu endoskopian yhteydessä; digitaalinen morfometria suoritettu tutkimuksen päättymiseen asti (31. joulukuuta 2025 asti)
|
|
Transkriptomiikka
Aikaikkuna: Tutkimusbiopsia saatu endoskopian yhteydessä; RNA-sekvensointianalyysi suoritettu tutkimuksen päättymiseen saakka (31. joulukuuta 2025 asti)
|
Transkriptominen (RNA-Seq) profiili pohjukaissuolen limakalvosta keliakiapotilailla ja terveillä verrokeilla
|
Tutkimusbiopsia saatu endoskopian yhteydessä; RNA-sekvensointianalyysi suoritettu tutkimuksen päättymiseen saakka (31. joulukuuta 2025 asti)
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
tekoälyyn/koneoppimiseen perustuva kuvanalysis
Aikaikkuna: Koko tutkimusjakson ajan, joulukuun 31. päivään 2035 asti
|
Kehitys ja validointi tekoälyyn/machine learning -pohjalle perustuvasta kuvananalyysityökalusta ohutsuolen limakalvovaurioiden asteittamiseksi
|
Koko tutkimusjakson ajan, joulukuun 31. päivään 2035 asti
|
|
Keliakian organoidiviljelymallit
Aikaikkuna: Koko tutkimusjakson ajan 31. joulukuuta 2035 asti
|
Keliakia- ja refraktaarisen ohutsuolen epiteelitulehduksen vasteiden organoidiviljelymallit solu- ja molekyylitasolla
|
Koko tutkimusjakson ajan 31. joulukuuta 2035 asti
|
|
Transkriptomiprofiilien vertailu
Aikaikkuna: Tutkimuksen ajan aina 31. joulukuuta 2035 asti
|
Transkriptomiprofiilien vertaaminen tämän kohortin ja referenssilääketutkimusaineiston välillä
|
Tutkimuksen ajan aina 31. joulukuuta 2035 asti
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Yhteistyökumppanit
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Yleiset julkaisut
- Schuppan D, Maki M, Lundin KEA, Isola J, Friesing-Sosnik T, Taavela J, Popp A, Koskenpato J, Langhorst J, Hovde O, Lahdeaho ML, Fusco S, Schumann M, Torok HP, Kupcinskas J, Zopf Y, Lohse AW, Scheinin M, Kull K, Biedermann L, Byrnes V, Stallmach A, Jahnsen J, Zeitz J, Mohrbacher R, Greinwald R; CEC-3 Trial Group. A Randomized Trial of a Transglutaminase 2 Inhibitor for Celiac Disease. N Engl J Med. 2021 Jul 1;385(1):35-45. doi: 10.1056/NEJMoa2032441.
- Taavela J, Viiri K, Popp A, Oittinen M, Dotsenko V, Peraaho M, Staff S, Sarin J, Leon F, Maki M, Isola J. Histological, immunohistochemical and mRNA gene expression responses in coeliac disease patients challenged with gluten using PAXgene fixed paraffin-embedded duodenal biopsies. BMC Gastroenterol. 2019 Nov 15;19(1):189. doi: 10.1186/s12876-019-1089-7.
- Taavela J, Viiri K, Valimaki A, Sarin J, Salonoja K, Maki M, Isola J. Apolipoprotein A4 Defines the Villus-Crypt Border in Duodenal Specimens for Celiac Disease Morphometry. Front Immunol. 2021 Jul 29;12:713854. doi: 10.3389/fimmu.2021.713854. eCollection 2021.
- Risnes LF, Reims HM, Doyle RM, Qiao SW, Sollid LM, Lundin KEA, Christophersen A. Gluten-Free Diet Induces Rapid Changes in Phenotype and Survival Properties of Gluten-Specific T Cells in Celiac Disease. Gastroenterology. 2024 Jul;167(2):250-263. doi: 10.1053/j.gastro.2024.03.027. Epub 2024 Mar 28.
- Dotsenko V, Oittinen M, Taavela J, Popp A, Peraaho M, Staff S, Sarin J, Leon F, Isola J, Maki M, Viiri K. Genome-Wide Transcriptomic Analysis of Intestinal Mucosa in Celiac Disease Patients on a Gluten-Free Diet and Postgluten Challenge. Cell Mol Gastroenterol Hepatol. 2021;11(1):13-32. doi: 10.1016/j.jcmgh.2020.07.010. Epub 2020 Jul 31.
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- R25009
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
IPD-suunnitelman kuvaus
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .