Indvirkning af specifikke antibiotikabehandlinger på forekomsten af ​​humane værtsresistente bakterier (SATURN)

Vi vil gennemføre en observationel longitudinel prospektiv undersøgelse på 3 hospitaler i enheder med høj forekomst af resistente organismer. Patienter, der samtykker, vil blive screenet for transport af AMR-organismer ved indlæggelsen, og de, der viser sig at være bærere af mål-ARB, vil blive inkluderet i den longitudinelle undersøgelse. For at forbedre udbyttet af screening kan vi bruge risikostratificering baseret på risikofaktorer identificeret på hvert center. Patienter inkluderet i den longitudinelle undersøgelse vil blive bedt om at give serielle afføringsprøver hver 2.-3. dag under hospitalsindlæggelse (rektal podning vil blive tilladt som erstatning for afføringsprøver, efter at der er udviklet passende metodologi til at korrelere mellem afføringsprøver og rektale podninger).

Disse prøver vil blive analyseret ved hjælp af kvantitative kulturer for antallet af resistente organismer, og prøver vil blive genstand for kvantitativ realtids-PCR for at kvantificere resistente gener (CTX-M, TEM, SHV, KPC, VIM efter behov). Sideløbende hermed vil miljøforurening blive undersøgt og kvantificeret ved hjælp af lignende metoder. Der vil dagligt blive indsamlet data vedrørende antibiotikabehandling, anden medicin, kliniske parametre, afføring og tilstedeværelse af diarré og forskellige PK/PD-indekser. Målantibiotikummet for denne undersøgelse omfatter almindeligt anvendte midler i hospitalsmiljøet, herunder quinoloner, cephalosporiner, piperacillin/tazobactam, ertapenem, imipenem, doripenem, metronidazol, clindamycin og aminoglykosider. Varigheden, den sekventielle behandlingsrækkefølge og PK/PD-indeks vil blive undersøgt. Virkningerne af kirurgisk antibiotikaprofylakse vil blive undersøgt som et vigtigt slutpunkt. Effekterne af målantibiotiske midler/klasser på selektion, berigelse og spredning af mål-AMR-organismerne. Der vil blive udført analyser for at sammenligne: 1. virkningen af ​​forskellige antibiotika 2. virkningen af ​​behandlingsvarighed 3. virkningens holdbarhed (efterbehandling). 4. Effekterne af PK/PD-indekser.

Sekundær analyse vil undersøge risikoen for at udvikle infektioner som funktion af forskellige faktorer, herunder tid og belastning af transport af resistente organismer og eksponering for antibiotika. Korrelation med kliniske isolater vil blive udført, herunder typebestemmelse, gen- og plasmidanalyser for at bestemme korrelation mellem koloniserende og inficerende stammer. Eksperiment, der simulerer patientkontakt, vil blive udført for at undersøge forurening af hænder, handsker og kjoler efter kontakt for at korrelere mellem miljøforurening og forurening af sundhedspersonale. Yderligere arbejde vil blive udført med at profilere bakteriesamfund ved hjælp af DNA-fingeraftryksteknikker ved brug af længdeheterogenitet (LH-PCR) og automatiseret ribosomal intern spacer-analyse (ARISA) på en prøve af de undersøgte patienter.