Impacto de las terapias con antibióticos específicos en la prevalencia de bacterias resistentes en huéspedes humanos (SATURN)

Realizaremos un estudio observacional longitudinal prospectivo en 3 hospitales de unidades con alta prevalencia de organismos resistentes. Los pacientes que den su consentimiento serán examinados para determinar si son portadores de organismos AMR en el momento de la admisión, y aquellos que sean portadores del ARB objetivo se incluirán en el estudio longitudinal. Para mejorar el rendimiento del cribado podemos utilizar la estratificación del riesgo en función de los factores de riesgo identificados en cada centro. A los pacientes incluidos en el estudio longitudinal se les pedirá que proporcionen muestras de heces en serie cada 2 o 3 días durante la hospitalización (se permitirá el hisopo rectal como reemplazo de la muestra de heces, después de desarrollar una metodología adecuada para correlacionar las muestras de heces con los hisopos rectales).

Estas muestras se analizarán mediante cultivos cuantitativos para determinar el número de organismos resistentes, y las muestras se someterán a PCR cuantitativa en tiempo real para cuantificar los genes resistentes (CTX-M, TEM, SHV, KPC, VIM, según se requiera). Paralelamente, la contaminación ambiental será examinada y cuantificada utilizando métodos similares. Se recogerán datos diarios sobre tratamiento antibiótico, otros medicamentos, parámetros clínicos, deposiciones y presencia de diarrea, y diversos índices PK/PD. El antibiótico objetivo para este estudio incluye agentes de uso común en el entorno hospitalario, incluidas quinolonas, cefalosporinas, piperacilina/tazobactam, ertapenem, imipenem, doripenem, metronidazol, clindamicina y aminoglucósidos. Se examinarán la duración, el orden secuencial del tratamiento y los índices PK/PD. Los efectos de la profilaxis antibiótica quirúrgica se examinarán como un punto final importante. Los efectos de los agentes/clases de antibióticos objetivo en la selección, el enriquecimiento y la propagación de los organismos AMR objetivo. Se realizarán análisis para comparar: 1. los efectos de varios antibióticos 2. el efecto de la duración de la terapia 3. la duración del efecto (posterior al tratamiento). 4. Los efectos de los índices PK/PD.

Se realizará un análisis secundario que examinará el riesgo de desarrollar infecciones en función de varios factores, incluido el tiempo y la carga de transporte de organismos resistentes y de exposición a antibióticos. Se realizará la correlación con los aislamientos clínicos, incluidos los análisis de tipificación, genes y plásmidos para determinar la correlación entre las cepas colonizadoras e infectantes. Se llevará a cabo un experimento que simule el contacto con el paciente para examinar la contaminación de manos, guantes y batas después del contacto con el fin de establecer una correlación entre la contaminación ambiental y la contaminación de los trabajadores de la salud. Se llevará a cabo un trabajo adicional sobre la elaboración de perfiles de comunidades bacterianas mediante técnicas de huellas dactilares de ADN utilizando heterogeneidad de longitud (LH-PCR) y análisis de espaciador interno ribosómico automatizado (ARISA) en una muestra de los pacientes estudiados.