Impatto di terapie antibiotiche specifiche sulla prevalenza di batteri resistenti all'ospite umano (SATURN)

Condurremo uno studio prospettico longitudinale osservazionale in 3 ospedali in unità con alta prevalenza di organismi resistenti. I pazienti consenzienti saranno sottoposti a screening per il trasporto di organismi AMR al momento del ricovero e quelli trovati portatori dell'ARB target saranno inclusi nello studio longitudinale. Per migliorare la resa dello screening possiamo utilizzare la stratificazione del rischio basata sui fattori di rischio identificati in ciascun centro. Ai pazienti inclusi nello studio longitudinale verrà chiesto di fornire campioni seriali di feci ogni 2-3 giorni durante il ricovero (il tampone rettale sarà consentito in sostituzione del campione di feci, dopo aver sviluppato una metodologia appropriata per correlare tra campioni di feci e tamponi rettali).

Questi campioni saranno analizzati utilizzando colture quantitative per il numero di organismi resistenti e i campioni saranno soggetti a PCR quantitativa in tempo reale per quantificare i geni resistenti (CTX-M, TEM, SHV, KPC, VIM come richiesto). Parallelamente, la contaminazione ambientale sarà esaminata e quantificata con metodi simili. I dati saranno raccolti giornalmente per quanto riguarda il trattamento antibiotico, altri farmaci, parametri clinici, movimenti intestinali e presenza di diarrea e vari indici PK/PD. L'antibiotico target per questo studio include agenti comunemente usati in ambito ospedaliero tra cui chinoloni, cefalosporine, piperacillina/tazobactam, ertapenem, imipenem, doripenem, metronidazolo, clindamicina e aminoglicosidi. Verranno esaminati la durata, l'ordine sequenziale del trattamento e gli indici PK/PD. Gli effetti della profilassi antibiotica chirurgica saranno esaminati come un importante punto finale. Gli effetti degli agenti/classi di antibiotici bersaglio sulla selezione, l'arricchimento e la diffusione degli organismi AMR bersaglio. Saranno condotte analisi per confrontare: 1. gli effetti di vari antibiotici 2. l'effetto della durata della terapia 3. la durata dell'effetto (post-trattamento). 4. Gli effetti degli indici PK/PD.

L'analisi secondaria esaminerà il rischio di sviluppare infezioni in funzione di vari fattori tra cui il tempo e il carico di trasporto di organismi resistenti e di esposizione agli antibiotici. Verrà eseguita la correlazione con gli isolati clinici, inclusa la tipizzazione, l'analisi genica e plasmidica per determinare la correlazione tra i ceppi colonizzanti e quelli infettanti. Verrà condotto un esperimento che simula il contatto con il paziente per esaminare la contaminazione di mani, guanti e camici dopo il contatto al fine di correlare tra contaminazione ambientale e contaminazione degli operatori sanitari. Ulteriori lavori saranno condotti sulla profilazione delle comunità batteriche mediante tecniche di DNA fingerprinting utilizzando l'etrogeneità della lunghezza (LH-PCR) e l'analisi automatizzata del distanziatore interno ribosomiale (ARISA) su un campione dei pazienti studiati.