Spesifisten antibioottihoitojen vaikutus isäntäresistenttien bakteerien esiintyvyyteen (SATURN)

Suoritamme havainnollisen pitkittäisen prospektiivisen tutkimuksen 3 sairaalassa yksiköissä, joissa on paljon vastustuskykyisiä organismeja. Suostumuspotilaat seulotaan AMR-organismien kantajiksi saapumisen yhteydessä, ja ne, joiden havaitaan olevan kohteena olevan ARB:n kantajia, otetaan mukaan pitkittäistutkimukseen. Parantaaksemme seulonnan tuottoa voimme käyttää riskikerrosta, joka perustuu kussakin keskuksessa tunnistettuihin riskitekijöihin. Pitkittäiseen tutkimukseen osallistuvia potilaita pyydetään toimittamaan sarja ulostenäytteitä 2–3 päivän välein sairaalahoidon aikana (peräsuolen vanupuikko voidaan korvata ulostenäytteellä sen jälkeen, kun on kehitetty sopiva menetelmä korreloida ulostenäytteiden ja peräsuolen vanupuikkojen välillä).

Nämä näytteet analysoidaan kvantitatiivisilla viljelmillä resistenttien organismien määrän selvittämiseksi, ja näytteille tehdään kvantitatiivinen reaaliaikainen PCR resistenttien geenien (CTX-M, TEM, SHV, KPC, VIM tarpeen mukaan) määrittämiseksi. Samanaikaisesti ympäristön saastumista tutkitaan ja kvantifioidaan vastaavilla menetelmillä. Tietoja kerätään päivittäin antibioottihoidosta, muista lääkkeistä, kliinisistä parametreista, suolen liikkeistä ja ripulin esiintymisestä sekä erilaisista PK/PD-indekseistä. Tämän tutkimuksen kohteena oleva antibiootti sisältää yleisesti sairaalassa käytettävät aineet, mukaan lukien kinolonit, kefalosporiinit, piperasilliini/tatsobaktaami, ertapeneemi, imipeneemi, doripeneemi, metronidatsoli, klindamysiini ja aminoglykosidit. Hoidon kesto, peräkkäinen järjestys ja PK/PD-indeksit tutkitaan. Tärkeänä päätepisteenä tarkastellaan kirurgisen antibioottiprofylaksin vaikutuksia. Kohdeantibioottisten aineiden/luokkien vaikutukset kohteena olevien AMR-organismien valintaan, rikastumiseen ja leviämiseen. Analyyseilla verrataan: 1. eri antibioottien vaikutuksia 2. hoidon keston vaikutusta 3. vaikutuksen kestävyyttä (jälkihoito). 4. PK/PD-indeksien vaikutukset.

Toissijaisessa analyysissä tarkastellaan infektioiden kehittymisriskiä eri tekijöiden, mukaan lukien resistenttien organismien kuljetuksen aika ja kuormitus sekä antibiooteille altistuminen, funktiona. Suoritetaan korrelaatio kliinisten isolaattien kanssa, mukaan lukien tyypitys, geeni- ja plasmidianalyysit kolonisoivien ja infektoivien kantojen välisen korrelaation määrittämiseksi. Potilaskontaktia simuloivalla kokeella tutkitaan käsien, käsineiden ja takkien kontaminaatiota kosketuksen jälkeen, jotta voidaan korreloida ympäristön ja terveydenhuollon työntekijöiden saastumisen välillä. Lisätyötä tehdään bakteeriyhteisöjen profiloimiseksi DNA-sormenjälkitekniikoilla käyttäen pituushetrogeenisuutta (LH-PCR) ja automatisoitua ribososmaalista sisäistä välikeanalyysiä (ARISA) tutkituista potilaista otettujen otosten osalta.